From a Natural Product to Its Biosynthetic Gene Cluster: A Demonstration Using Polyketomycin from Streptomyces diastatochromogenes T&#252;6028

Anja Greule; Songya Zhang; Thomas Paululat; Andreas Bechthold

doi:10.3791/54952

/

Fra et naturligt produkt til sin biosyntesegen Cluster: En Demonstration Brug Polyketomycin fra Streptomyces diastatochromogenes Tü6028

JoVE Journal
Genetics

This content is Free Access.

JoVE Journal Genetics

From a Natural Product to Its Biosynthetic Gene Cluster: A Demonstration Using Polyketomycin from Streptomyces diastatochromogenes Tü6028

Fra et naturligt produkt til sin biosyntesegen Cluster: En Demonstration Brug Polyketomycin fra Streptomyces diastatochromogenes Tü6028

DOI:

10.3791/54952-v

•

09:08 min

•

January 13, 2017

•

Anja Greule, Songya Zhang, Thomas Paululat, Andreas Bechthold

¹Department of Pharmaceutical Biology and Biotechnology,Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Germany, ²Department of Chemistry and Biology,Universität Siegen

Chapters

00:05Title
00:54Identification of a Natural Product with Antibiotic Property
03:54Propose Biosynthetic Model of the New Isolated Compound
05:02Identification of the Biosynthetic Gene Cluster
06:34Verification of the Biosynthetic Gene Cluster
07:40Results: HPLC Analysis of S. diastatochromogenes with Inactivated pokPI Gene
08:07Conclusion

Summary

Automatic Translation

Her præsenterer vi en detaljeret protokol af (A) identifikation af et naturligt produkt med antibiotisk aktivitet, (B) rensning af forbindelsen, (C) den første model af sin biosyntese, (D) genomsekvensering / -mining og ( E) kontrol af biosyntetiske gen-klyngen.

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Ved hjælp af en GFP-mærket TMEM184A Construct til Bekræftelse af Heparin receptor Identity

Forberedelse af prøver og analyser af RNASeq-baseret genekspression Data fra zebrafisk

En standardmetode til at undersøge ejendommen mutagenicitet som en funktion af punkt Mutation reparation katalyseret af CRISPR/Cas9 og SsODN i humane celler

Generation af en gen-forstyrret Streptococcus mutans stamme uden Gene kloning

At udforske Root Microbiome: udtrække bakteriel Fællesskabets Data fra jord, rhizosfære og rod Endosphere

IT analyse af sekvens Data fra Batch gær 2-Hybrid skærme

Høj overførselshastighed identifikation af regulerende gensekvenser ved hjælp af næste generations sekventering af cirkulære kromosom kropsbygning Capture (4C-seq)

Fra et naturligt produkt til sin biosyntesegen Cluster: En Demonstration Brug Polyketomycin fra<em> Streptomyces diastatochromogenes</em> Tü6028

•

•

•