इस प्रोटोकॉल का लक्ष्य एक समूह है कि नामकरण और वर्गीकरण के लिए सुसंगत मानदंडों का अभाव में अलग प्रोटीन के लिए एक संदर्भ विकसित करना है । इस संदर्भ में एक पूरे के रूप में समूह के विश्लेषण और चर्चा की सुविधा होगी और स्थापित नामों के अलावा इस्तेमाल किया जा सकता है ।