Här beskriver vi en metod som kombinerar i situ MHC-tetramer färgning med immunohistokemi att bestämma localizationen, fenotyp och kvantitet av antigen-specifika T-celler i vävnader. Detta protokoll används för att bestämma de rumsliga och fenotypiska egenskaperna av antigen-specifika CD8 T-celler i förhållande till andra celltyper och strukturer i vävnader.