Journal
/
Biology
/
Guidade protokoll för fekal mikrobiell karakterisering av 16S rRNA-amplikon sekvensering
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Guided Protocol for Fecal Microbial Characterization by 16S rRNA-Amplicon Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Guidade protokoll för fekal mikrobiell karakterisering av 16S rRNA-amplikon sekvensering

DOI:
10.3791/56845-v

•

08:05 min

•

March 19, 2018

•

, , , , , , , ,
1Sheba Medical Center, 2Children’s Hospital of Pittsburgh of UPMC, 3Ariel University, 4Cincinnati Children’s Hospital Medical Center

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:59Sample Handling and DNA Extraction
  • 02:12PCR and Library Preparation
  • 05:30Results: 16S RNA-Seq of Prepared Libraries
  • 07:19Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Detta manuskript beskriver en detaljerad standardiserade protokollet av hög genomströmning 16S rRNA-amplikon sekvensering. Protokollet införs ett integrerat, uniformerad, genomförbart och billig protokoll från fekal provtagning genom dataanalyser. Detta protokoll möjliggör analys av stora mängder prover med stränga normer och flera kontroller.

Tags

Keywords: 16S RRNA-Amplicon SequencingFecal MicrobiomeMicrobial CompositionAerobic And Anaerobic CommunitiesHigh-throughputFecal Sample ProcessingDNA ExtractionPCRPrimer Design96-well Plate SetupTriplicate ReactionsPCR Master Mix

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/56845?article_type=v

Pyrosequencing för Mikrobiell identifiering och karakterisering
check_url/56845?article_type=v

Nästa generations sekvensering av 16S ribosom RNA Gene amplicons
check_url/56845?article_type=v

Riktade DNA-metylering analys av Nästa generations sekvense
check_url/56845?article_type=v

Isolering av specifika genomregioner och Identifiering av associerade molekyler av enChIP
check_url/56845?article_type=v

Fekal Glukokortikoid Analys: Icke-invasiv Adrenal Övervakning av equids
check_url/56845?article_type=v

Effektiv Nucleic Acid Extraction och 16S rRNA gensekvenser för bakteriell Community karakterisering
check_url/56845?article_type=v

Ett protokoll för funktionell bedömning av hela proteinmutagenes bibliotek Använda hög genomströmning sekvensering
check_url/56845?article_type=v

Interactome-Seq: Ett protokoll för Domainome bibliotek konstruktion, validering och urval av Phage Display och nästa generations sekvensering
check_url/56845?article_type=v

Tickande mikrobiomet karakterisering av nästa generations 16S rRNA amplikon sekvensering
check_url/56845?article_type=v

Microbiota analys med två steg PCR och nästa generations 16S rRNA Gene sekvensering

Read Article