Journal
/
Cancer Research
/
Morfologi-baserte skillet mellom sunn og patologiske celler utnytte Fourier transformeres og selv-organisering kart
JoVE Journal
Cancer Research
This content is Free Access.
JoVE Journal Cancer Research
Morphology-Based Distinction Between Healthy and Pathological Cells Utilizing Fourier Transforms and Self-Organizing Maps

Morfologi-baserte skillet mellom sunn og patologiske celler utnytte Fourier transformeres og selv-organisering kart

DOI:
10.3791/58543-v

•

08:59 min

•

October 28, 2018

•

, , , , , , ,
1Department of Chemical and Product Safety,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), 2Deutsches Rheuma-Forschungszentrum (DRFZ) Berlin, a Leibniz Institute, 3Charité Universitätsmedizin Berlin, 4Applied Systems Biology,Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology Hans Knöll Institute

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:11Reconstruct the 3D Image
  • 03:13Transform the 3D Reconstructed Surfaces into 2D Projections
  • 04:28Find the Periphery and Calculate the Fourier Components using Fiji
  • 05:13Self-Organizing Maps
  • 06:53Results: Robustness of SOM Mapping Approach
  • 08:32Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Her gir vi en arbeidsflyt som gjør identifisering av sunn og patologiske cellene basert på deres 3-dimensjonal form. Vi beskriver prosessen med å bruke 2D-projeksjon skisserer basert på 3D overflater for å trene kart Self-Organizing som gir objektive klynging av de undersøkte celle populasjonene.

Tags

Morphology-based DistinctionFourier TransformsSelf-organizing Maps3D MicroscopyCell ReconstructionSurface CreationSmoothingThresholdingCancer ResearchImmunologyDiagnosisTherapy

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/58543?article_type=v

Analysere kommunikasjonen mellom monocytter og primære brystkreft celler i en ekstracellulær Matrix ekstrakt (ECME)-basert tredimensjonale System
check_url/58543?article_type=v

En prekliniske musemodell Osteosarcoma definere den ekstracellulære Vesicle-mediert kommunikasjonen mellom svulst og Mesenchymal stamceller
check_url/58543?article_type=v

Enkel og rask metode å få høy kvalitet svulst DNA fra klinisk-patologisk prøver bruker Touch forlaget cytologi
check_url/58543?article_type=v

Utnytte høyoppløselig ultralyd Monitor svulst utbruddet og vekst i genmodifiserte bukspyttkjertelkreft modeller
check_url/58543?article_type=v

18F-FDG PET/CT Imaging og kvantitative Histology måle dynamiske endringer i glukose metabolisme i musen modeller av lungekreft
check_url/58543?article_type=v

Fange små molekyl kommunikasjon mellom vev og celler ved hjelp av Imaging massespektrometri
check_url/58543?article_type=v

Patologisk analyse av lungemetastase etter lateral hale-vene injeksjon av tumorceller
check_url/58543?article_type=v

Ortotopisk implantasjon av pasientavledede kreftceller hos mus rekapitulerer avansert kolorektal kreft
check_url/58543?article_type=v

Identifisere, diagnostisere og gradere ondartede perifere nerveskjede svulster i genetisk utviklede musemodeller
check_url/58543?article_type=v

Etablering og evaluering av en risikoprediksjonsmodell for patologisk eskalering av gastrisk lavgradig intraepitelial neoplasi

Read Article