/
/
Morfologi-baserade åtskillnad mellan friska och sjukliga celler utnyttja Fourier transformer och självorganiserande kartor
This content is Free Access.
1Department of Chemical and Product Safety,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), 2Deutsches Rheuma-Forschungszentrum (DRFZ) Berlin, a Leibniz Institute, 3Charité Universitätsmedizin Berlin, 4Applied Systems Biology,Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology Hans Knöll Institute
Chapters
- 00:04Title
- 01:11Reconstruct the 3D Image
- 03:13Transform the 3D Reconstructed Surfaces into 2D Projections
- 04:28Find the Periphery and Calculate the Fourier Components using Fiji
- 05:13Self-Organizing Maps
- 06:53Results: Robustness of SOM Mapping Approach
- 08:32Conclusion
Här, tillhandahåller vi ett arbetsflöde som möjliggör identifiering av friska och sjukliga celler baserat på deras 3-dimensionell form. Vi beskriver processen för att använda 2D projektion konturer baserat på de 3D-ytorna för att utbilda en självorganiserande karta som kommer att ge objektiva klustring av de undersökta cellpopulationer.
