Journal
/
Genetics
/
Bruke i Vitro og i celle form å undersøke små molekyl indusert Pre-mRNA strukturelle endringer
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Using In Vitro and In-cell SHAPE to Investigate Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes

Bruke i Vitro og i celle form å undersøke små molekyl indusert Pre-mRNA strukturelle endringer

DOI:
10.3791/59021-v

•

11:58 min

•

January 30, 2019

•

, ,
1Calibr,The Scripps Research Institute, 2Department of Integrative Structural and Computational Biology,The Scripps Research Institute

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:3132P-labeled Primer Labeling for In Vitro Selective 2‘-hydroxyl Acylation Analyzed by Primer Extension (SHAPE)
  • 03:44Small Molecule Binding and RNA 2‘-OH Modification
  • 06:29Marker Preparation and Primer Extension
  • 08:59PAGE Analysis
  • 10:15Results of In Vitro and In-cell SHAPE for Analyzing Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
  • 11:02Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Detaljert protokoller for både in vitro og i celle selektiv 2-hydroksyl acylation analysert av primer forlengelsen (SHAPE) eksperimenter for å finne den sekundære strukturen i pre-mRNA sekvenser av interesse i nærvær av et RNA målretting små molekyl er presentert i denne artikkelen.

Tags

In Vitro SHAPEIn-cell SHAPERNA Secondary StructureSmall MoleculePre-mRNAReverse TranscriptionRadioactive LabelingAcrylamide GelPassive Elution

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/59021?article_type=v

In vitro transkripsjon Analyser og deres program i Drug Discovery
check_url/59021?article_type=v

Optogenetic Random Mutagenese Bruke Histone-miniSOG i<em> C. elegans</em
check_url/59021?article_type=v

Analyse av Ambient Svevestøv-indusert kromosomavvik ved hjelp av en<em> In Vitro</em> System
check_url/59021?article_type=v

In Vitro Bioluminescens analysen som karakteriserer døgnrytmen i Mammary epitelceller
check_url/59021?article_type=v

Analyse i sanntid av transkripsjon faktor bindende, transkripsjon, oversettelse og omsetning vise globale hendelser under aktivering
check_url/59021?article_type=v

En Optogenetic metode for å styre og analysere Gene Expression mønstre i celle til celle interaksjoner
check_url/59021?article_type=v

Ett molekyl fluorescens In Situ hybridisering (smFISH) analyse i spirende gjær vegetativ vekst og meiose
check_url/59021?article_type=v

Kvantitativ analyse av Alternative Pre-mRNA skjøting i musen hjernen inndelinger ved hjelp av RNA i Situ hybridisering analysen
check_url/59021?article_type=v

Endogene Protein merking i menneskelig indusert Pluripotent stilk celler med CRISPR/Cas9
check_url/59021?article_type=v

Bruk av ett molekyl fluorescerende i Situ hybridisering (SM-fisk) å kvantifisere og Localize mRNAs i Murine Oocytes

Read Article