Journal
/
Genetics
/
Använda i Vitro och i cell form att undersöka småmolekylära inducerad Pre-mRNA strukturella förändringar
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Using In Vitro and In-cell SHAPE to Investigate Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Använda i Vitro och i cell form att undersöka småmolekylära inducerad Pre-mRNA strukturella förändringar

DOI:
10.3791/59021-v

•

11:58 min

•

January 30, 2019

•

, ,
1Calibr,The Scripps Research Institute, 2Department of Integrative Structural and Computational Biology,The Scripps Research Institute

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:3132P-labeled Primer Labeling for In Vitro Selective 2‘-hydroxyl Acylation Analyzed by Primer Extension (SHAPE)
  • 03:44Small Molecule Binding and RNA 2‘-OH Modification
  • 06:29Marker Preparation and Primer Extension
  • 08:59PAGE Analysis
  • 10:15Results of In Vitro and In-cell SHAPE for Analyzing Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
  • 11:02Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Detaljerade protokoll för både in vitro och i cell selektiv 2'-hydroxylgruppen acylation analyseras av primer filändelsen (form) experiment för att fastställa det sekundära strukturerar av pre-mRNA sekvenser av intresse i närvaro av en RNA-targeting liten molekyl är presenteras i denna artikel.

Tags

Keywords: In Vitro SHAPEIn-cell SHAPERNA Secondary StructureSmall MoleculePre-mRNAReverse TranscriptionRadioactive LabelingAcrylamide GelPassive Elution

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/59021?article_type=v

Transkription in vitro analyser och deras tillämpning i Drug Discovery
check_url/59021?article_type=v

Optogenetic Slumpmässig mutagenes med användning Histon-miniSOG i<em> C. elegans</em
check_url/59021?article_type=v

Analys av omgivnings Partiklar-inducerad kromosomavvikelser Använda en<em> In Vitro</em> System
check_url/59021?article_type=v

In Vitro Mareld Assay att karakterisera dygnsrytmen i mjölkkörtlar epitelceller
check_url/59021?article_type=v

Realtidsanalys av transkriptionsfaktor som bindande, transkription, översättning och omsättning under cellulär aktivering med visning av globala händelser
check_url/59021?article_type=v

En Optogenetic metod för att kontrollera och analysera gen uttrycksmönster i Cell-till-cell interaktioner
check_url/59021?article_type=v

Enda molekyl fluorescens In Situ hybridisering (smFISH) analys i spirande jäst vegetativ tillväxt och meios
check_url/59021?article_type=v

Kvantitativ analys av alternativa Pre-mRNA Splicing i mus hjärnan sektioner med RNA In Situ hybridisering analys
check_url/59021?article_type=v

Endogen Protein taggning i mänskliga inducerade pluripotenta stamceller med CRISPR/Cas9
check_url/59021?article_type=v

Användning av enda molekyl fluorescerande i Situ hybridisering (SM-fisk) för att kvantifiera och lokalisera mRNA i murina oocyter

Read Article