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ATAC-seq Assay with Low Mitochondrial DNA Contamination from Primary Human CD4+ T Lymphocytes

ATAC-seq ensaio com DNA mitocondrial baixa contaminação de primária humana CD4 linfócitos T

DOI:
10.3791/59120-v

•

08:36 min

•

March 22, 2019

•

, ,
1Department of Biology,Boston University, 2Department of Computer Science and Engineering,University of California San Diego, 3Bioinformatics Program,Boston University

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:55Activation and Purification of CD4+ T Cells
  • 04:36Assay for Transposase-accessible Chromatin Sequencing (ATAC-seq)
  • 06:33Results: ATAC-seq and Sequencing Result Analysis
  • 07:48Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Aqui, apresentamos um protocolo para realizar um ensaio de cromatina transposase-acessível sequenciando (ATAC-seq) em linfócitos humanos registrados CD4 +. O protocolo foi modificado para minimizar contaminando leituras de DNA mitocondriais de 50% para 3%, através da introdução de um novo buffer de Lise.

Tags

ATAC-seqMitochondrial DNA ContaminationCD4+ T LymphocytesCell ActivationCell SelectionCell IsolationCell CountingMagnetic BeadsCell CultureCell Stimulation

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