Journal
/
Genetics
/
En fullstendig rørledning for isolere og sekvensering MicroRNAs, og analyserer seg benytter åpen kilde verktøy
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools

En fullstendig rørledning for isolere og sekvensering MicroRNAs, og analyserer seg benytter åpen kilde verktøy

DOI:
10.3791/59901-v

•

00:09 min

•

August 21, 2019

•

, ,
1Division of Medical Genetics,University of Washington School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:513’ Adaptor Ligation
  • 04:465’ Linker Ligation
  • 05:44Reverse Transcription (RT)
  • 06:33PCR Amplification and Agarose Gel Purification
  • 08:10Results: Representative MicroRNA Analyses
  • 08:49Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Her beskriver vi en trinnvis strategi for å isolere små RNAs, berikende for microRNAs og klargjøre prøver for sekvenser med høy gjennomstrømming. Vi beskriver hvordan du behandler sekvensen leser og justere dem til microRNAs, ved hjelp av åpen kildekode-verktøy.

Tags

MicroRNARNA SequencingBioinformaticsGel PurificationSmall RNARNA IsolationGene TherapyDisease Mechanism

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Påvisning av Kopier nummer Endringer Bruke enkelt celle Sequencing

Robust DNA isolasjon og høy gjennomstrømming sekvensering biblioteket konstruksjon for Herbarium prøver

Neste generasjons sekvensering og bioinformatikk rørledning for å evaluere genetisk determinanter av konstitusjonelle sykdom

Sjelden hendelse gjenkjenning feil-korrigert DNA og RNA sekvensering

En rask og lettvint rørledning for generering Genomic punkt mutanter i C. elegans bruker CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins

Ultralow inngang genomet sekvensering biblioteket forberedelse fra en enkelt Tardigrade prøven

Høy gjennomstrømming identifikasjon av regulatoriske gensekvenser med neste generasjons sekvensering av runde kromosom konformasjon fange (4C-seq)

Isolere, sekvensering og analysere ekstracellulære MicroRNAs fra menneskelige stamceller

Sekvensering av mRNA fra hele Blood bruke Nanopore sekvensering

Masse massespektrometri-baserte Proteomikk analyser bruker OpenProt databasen å avsløre romanen proteiner oversatt fra ikke-kanoniske åpent lesing rammer

Read Article