Journal
/
Genetics
/
En komplett pipeline för att isolera och sekvensera mikroRNAs, och analysera dem med hjälp av Open source-verktyg
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

En komplett pipeline för att isolera och sekvensera mikroRNAs, och analysera dem med hjälp av Open source-verktyg

DOI:
10.3791/59901-v

•

00:09 min

•

August 21, 2019

•

, ,
1Division of Medical Genetics,University of Washington School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:513’ Adaptor Ligation
  • 04:465’ Linker Ligation
  • 05:44Reverse Transcription (RT)
  • 06:33PCR Amplification and Agarose Gel Purification
  • 08:10Results: Representative MicroRNA Analyses
  • 08:49Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Här beskriver vi en steg-för-steg-strategi för att isolera små RNAs, berika microRNAs och förbereda prover för sekvensering med höga dataflöden. Sedan beskriver vi hur du bearbetar sekvensläsningar och anpassar dem till microRNAs med hjälp av verktyg med öppen källkod.

Tags

MicroRNARNA SequencingBioinformaticsGel PurificationSmall RNARNA IsolationGene TherapyDisease Mechanism

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/59901?article_type=v

Detektion av Copy Number Ändringar Använda Single Cell Sequencing
check_url/59901?article_type=v

Robust DNA isolering och hög genomströmning sekvensering bibliotek konstruktion för herbarieexemplar
check_url/59901?article_type=v

Riktade nästa generations sekvensering och bioinformatik Pipeline för att utvärdera genetiska determinanter av konstitutionella sjukdom
check_url/59901?article_type=v

Detektion av sällsynta händelser med fel-korrigerade DNA och RNA-sekvensering
check_url/59901?article_type=v

En snabb och lättköpt Pipeline för generera genomisk punkt mutanter i C. elegans med CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins
check_url/59901?article_type=v

Ultralåga ingående Genome Sequencing bibliotek förberedelse från enda Tardigrade prov
check_url/59901?article_type=v

Hög genomströmning identifiering av reglerande gensekvenser som använder nästa generations sekvensering av cirkulär kromosom konformation fånga (4C-seq)
check_url/59901?article_type=v

Isolera, sekvensering och analysera extracellulära mikroRNA från humana mesenkymala stamceller
check_url/59901?article_type=v

Sekvensering av mRNA från helblod med Nanopore sekvensering
check_url/59901?article_type=v

Mass Spectrometry-baserad proteomik analyser med hjälp av databasen OpenProt att avslöja nya proteiner översatt från icke-kanoniska öppen läsning ramar

Read Article