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Melhorando O RNA-Seq pequeno: menos polarização e melhor deteção de 2 '-O-methyl RNAs
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JoVE Journal Genetics
Improving Small RNA-seq: Less Bias and Better Detection of 2′-O-Methyl RNAs

Melhorando O RNA-Seq pequeno: menos polarização e melhor deteção de 2 '-O-methyl RNAs

DOI:
10.3791/60056-v

•

08:49 min

•

September 16, 2019

•

, ,
1Institute for Integrative Biology of the Cell, UMR9198, CNRS CEA Univ Paris-Sud,Université Paris-Saclay

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:33Small RNA Isolation
  • 02:26Unligated 3’ Adapter Elimination
  • 04:41Gel Purification
  • 05:27Raw Sequence File Treatment
  • 06:06Trimmed Sequence Mapping
  • 06:58Results: Representative 2’-OMe RNA Detection
  • 08:18Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Nós apresentamos um protocolo pequeno detalhado da reparação da biblioteca do RNA com menos viés do que métodos padrão e uma sensibilidade aumentada para 2 '-O-methyl RNAs. Este protocolo pode ser seguido usando reagentes caseiros para economizar custos ou usar kits para conveniência.

Tags

Small RNA-seqRNA Detection2′-O-Methyl RNAsUnbiased MethodsPlant MicroRNAsGel ElectrophoresisRNA ExtractionAdapter EliminationMagnetic Purification Beads

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