Journal
/
Genetics
/
Kombinere Laser Capture Microdissection og Microfluidic qPCR at analysere transskriptionelle profiler af enkelte celler: A Systems Biologi tilgang til Opioid Afhængighed
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Combining Laser Capture Microdissection and Microfluidic qPCR to Analyze Transcriptional Profiles of Single Cells: A Systems Biology Approach to Opioid Dependence

Kombinere Laser Capture Microdissection og Microfluidic qPCR at analysere transskriptionelle profiler af enkelte celler: A Systems Biologi tilgang til Opioid Afhængighed

DOI:
10.3791/60612-v

•

09:54 min

•

March 08, 2020

•

, , , ,
1Daniel Baugh Institute for Functional Genomics and Computational Biology, Department of Pathology, Anatomy, and Cell Biology,Thomas Jefferson University, 2Sidney Kimmel Medical College,Thomas Jefferson University, 3Department of Pharmacology & Physiology,Drexel University College of Medicine

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:59Preparing the Samples
  • 02:16Laser Capture Microdissection
  • 04:07Single-cell Microfluidic RT-qPCR
  • 08:08Results: Microfluidic qPCR Yields Accurate and Anatomically Specific Transcriptional Profiles of Single-Cells
  • 09:21Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Denne protokol forklarer, hvordan man indsamler enkelte neuroner, mikroglia, og astrocytter fra den centrale kerne af amygdala med høj nøjagtighed og anatomisk specificitet ved hjælp af laser capture mikrodissection. Derudover forklarer vi vores brug af mikrofluidic RT-qPCR til at måle en delmængde af transskriptionen af disse celler.

Tags

Laser Capture MicrodissectionMicrofluidic QPCRTranscriptional ProfilesSingle CellsSystems BiologyOpioid DependenceGene ExpressionCellular SubphenotypesAnatomic SpecificityBiological ProblemsNeuronsBrain RegionsAmygdalaEthanol DehydrationXyleneFluorescenceLCM SoftwareInfrared Laser

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Single-celle genekspression Brug Multiplex RT-qPCR at Karakterisere Meget forskellige sjældne Lymfoide populationer

Single-celle Gene Expression Profiling Brug FACS og qPCR med interne standarder

Single Molecule Analyse af Laser Lokaliserede Psoralen Adducts

Laser Microirradiation at studere In Vivo cellulære svar til Simple og komplekse DNA-skader

Tilpasning af hybridisering fange af kromatin-associerede proteiner for Proteomics til pattedyrceller

Ultralow Input Genome Sequencing bibliotek forberedelse fra en enkelt Tardigrade prøvemateriale

En roman mætning mutagenese tilgang: Trinvist karakterisering af regulerende Protein bindende websteder i RNA ved hjælp af Phosphorothioates

Den replika sæt metode: En høj overførselshastighed tilgang til kvantitativt foranstaltning Caenorhabditis elegans levetid

En kombinatorisk encellede tilgang til at karakterisere de molekylære og Immunophenotypic heterogenitet af menneskelige stamceller og stamfader populationer

Generation af kræft celle kloner til at visualisere Telomeric Repeat-holdige RNA TERRA udtrykt fra en enkelt Telomer i levende celler

Read Article