Journal
/
Genetics
/
Kombinera Laser Capture Microdissection och Microfluidic qPCR att analysera transkriptionella profiler av enskilda celler: A Systems Biology strategi för opioidberoende
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Combining Laser Capture Microdissection and Microfluidic qPCR to Analyze Transcriptional Profiles of Single Cells: A Systems Biology Approach to Opioid Dependence
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Kombinera Laser Capture Microdissection och Microfluidic qPCR att analysera transkriptionella profiler av enskilda celler: A Systems Biology strategi för opioidberoende

DOI:
10.3791/60612-v

•

09:54 min

•

March 08, 2020

•

, , , ,
1Daniel Baugh Institute for Functional Genomics and Computational Biology, Department of Pathology, Anatomy, and Cell Biology,Thomas Jefferson University, 2Sidney Kimmel Medical College,Thomas Jefferson University, 3Department of Pharmacology & Physiology,Drexel University College of Medicine

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:59Preparing the Samples
  • 02:16Laser Capture Microdissection
  • 04:07Single-cell Microfluidic RT-qPCR
  • 08:08Results: Microfluidic qPCR Yields Accurate and Anatomically Specific Transcriptional Profiles of Single-Cells
  • 09:21Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Detta protokoll förklarar hur man samlar in enstaka nervceller, mikroglia och astrocyter från den centrala kärnan i amygdala med hög noggrannhet och anatomisk specificitet med hjälp av laser fånga microdissection. Dessutom förklarar vi vår användning av microfluidic RT-qPCR för att mäta en delmängd av transkriptomen i dessa celler.

Tags

Laser Capture MicrodissectionMicrofluidic QPCRTranscriptional ProfilesSingle CellsSystems BiologyOpioid DependenceGene ExpressionCellular SubphenotypesAnatomic SpecificityBiological ProblemsNeuronsBrain RegionsAmygdalaEthanol DehydrationXyleneFluorescenceLCM SoftwareInfrared Laser

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Encelliga genuttryck Använda Multiplex RT-qPCR att karaktärisera Heterogena Sällsynta Lymfoida populationer

Encelliga profilering av genuttryck med FACS och qPCR med interna standarder

Enda molekyl Analys av Laser Lokaliserade psoralen Addukter

Laser Microirradiation att studera In Vivo cellulära svar till enkla och komplexa DNA-skador

Anpassning av hybridisering fånga av kromatin-associerade proteiner för proteomik för att däggdjursceller

Ultralåga ingående Genome Sequencing bibliotek förberedelse från enda Tardigrade prov

En roman mättnad mutagenes strategi: Enda steg karakterisering av reglerande proteinet bindningsställen i RNA med hjälp av Phosphorothioates

Den replika Set-metoden: En hög genomströmning strategi att kvantitativt mäta Caenorhabditis elegans livslängd

En kombinatorisk Single-cell strategi att karaktärisera molekylära och Immunophenotypic heterogenitet av mänskliga stamceller och stamceller populationer

Generation av Cancer Cell kloner att visualisera Telomeric Repeat-innehållande RNA TERRA uttryckt från en enda telomeren i levande celler

Read Article