Journal
/
Chemistry
/
Massespektrometri-guidet genom minedrift som et redskab til at afdække nye naturlige produkter
JoVE Journal
Chemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Chemistry
Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products

Massespektrometri-guidet genom minedrift som et redskab til at afdække nye naturlige produkter

DOI:
10.3791/60825-v

•

11:13 min

•

March 12, 2020

•

, , ,
1Department of Organic Chemistry, Institute of Chemistry,University of Campinas (UNICAMP), 2Center for Natural and Human Sciences,Federal University of ABC (UFABC)

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 02:54Genome Mining for Biosynthetic Gene Clusters
  • 03:46Strain Cultivation
  • 04:51Acquiring Mass Spectra and Preparation for GNPS Analysis
  • 05:43GNPS Analysis
  • 08:33Results: Genome Sequence Analysis and Molecular Networking
  • 09:46Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

En massespektrometri-guidet genom minedrift protokol er etableret og beskrevet her. Den er baseret på oplysninger om genomsekvenser og LC-MS/MS-analyse og har til formål at lette identifikationen af molekyler fra komplekse mikrobielle ekstrakter og planteekstrakter.

Tags

Keywords: Mass SpectrometryGenome MiningNatural Product DiscoveryMolecular NetworkingWhole Genome SequencingGenotype-to-chemotypeBiosynthetic ClustersSecondary MetabolismGNPSStreptomycesFungiPlants

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/60825?article_type=v

Kemiske haver som Flow-through Reactors simulere naturlig Hydrotermiske Systems
check_url/60825?article_type=v

En Direct, Early Stage Guanidinylation Protokol til syntese af komplekse aminoguanidin-holdige Naturprodukter
check_url/60825?article_type=v

Laboratorium Produktion af biobrændstoffer og biokemikalier fra en Rapsolie gennem Catalytic Cracking Conversion
check_url/60825?article_type=v

NMR spektroskopi som et robust værktøj til Rapid Evaluering af Lipid Profil af fiskeolie kosttilskud
check_url/60825?article_type=v

Coulomb eksplosion billeddannelse som et redskab til at skelne mellem stereoisomere
check_url/60825?article_type=v

Elektrokemiske impedans spektroskopi som et redskab for elektrokemisk sats konstant estimering
check_url/60825?article_type=v

Farve Spot Test som en Præsumptive værktøj til hurtig påvisning af syntetiske Cathinones
check_url/60825?article_type=v

Nye teknikker til at observere strukturdynamik Photoresponsive flydende krystaller
check_url/60825?article_type=v

Ansætte trykisoleret varmt vand udvinding (PHWE) til at udforske naturprodukter kemi på bachelor laboratorium
check_url/60825?article_type=v

En to-trins pyrolyse-gaskromatografi metode med massespektrometrisk detektion til identifikation af tatovering blæk ingredienser og forfalskede produkter

Read Article