Journal
/
Biochemistry
/
Övervakning av protein-RNA-interaktionsdynamik in vivo vid hög tidsupplösning med χCRAC
JoVE Journal
Biochemistry
This content is Free Access.
JoVE Journal Biochemistry
Monitoring Protein-RNA Interaction Dynamics In Vivo at High Temporal Resolution Using χCRAC
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Övervakning av protein-RNA-interaktionsdynamik in vivo vid hög tidsupplösning med χCRAC

DOI:
10.3791/61027-v

•

09:15 min

•

May 09, 2020

•

, , , , , , , , ,
1Centre for Engineering Biology,University of Edinburgh, 2Institute of Cell Biology,University of Edinburgh, 3Department of Molecular Biology and Genetics,Aarhus University, 4UVO3 Ltd.

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:58UV Crosslinking and Lysate Production
  • 03:18Elution and SDS-PAGE
  • 05:24PCR and Gel Extraction
  • 07:06Results: Temporal Binding of Nrd1 to its Targets
  • 08:47Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Kinetisk tvärbindning och analys av cDNA är en metod som möjliggör undersökning av dynamiken i protein-RNA-interaktioner i levande celler vid hög tidsupplösning. Här beskrivs protokollet i detalj, inklusive tillväxt av jästceller, UV-tvärbindning, skörd, proteinrening och nästa generations sekvenseringsbiblioteksberedningssteg.

Tags

Protein-RNA InteractionKinetic CRACUV CrosslinkingRNA Binding ProteinsRNA ExtractionCell HarvestingTime-resolved AnalysisLive Cell MonitoringStress ResponseAdherent CellsMicroorganisms

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/61027?article_type=v

Högupplösande enkelpartikelanalys från elektronkryo-mikroskopi bilder med hjälp av SPHIRE
check_url/61027?article_type=v

Använda i Vitro fluorescens resonans energiöverföring att studera dynamiken i proteinkomplex på en millisekund tidsskala
check_url/61027?article_type=v

In vivo kalcium avbildning i C. elegans kropps vägg muskler
check_url/61027?article_type=v

Proteom-wide kvantifiering av märkning homogenitet på nivån enda molekyl
check_url/61027?article_type=v

Undersöka dynamiken i cellulära vidhäftning och spridning av epitelceller på fibronectin under oxidativ stress
check_url/61027?article_type=v

Kvantifiering av proteininteraktion Nätverksdynamik med hjälp av multiplexerade Co-immunoprecipitation
check_url/61027?article_type=v

Fluorescens spektroskopi med dubbla färger för att studera protein-proteininteraktion och proteindynamik i levande celler
check_url/61027?article_type=v

Övervakning av proteinaggregeringskinetik in vivo med hjälp av automatiserad inkluderingsräkning i Caenorhabditis elegans
check_url/61027?article_type=v

Rutinmässig insamling av högupplösta kryo-EM-dataset med 200 KV transmissionselektronmikroskop
check_url/61027?article_type=v

Högupplöst neutronspektroskopi för att studera pikosekund-nanosekunddynamik hos proteiner och hydratiseringsvatten

Read Article