Journal
/
/
Divergens av rotmikrobiota i olika livsmiljöer baserat på viktade korrelationsnätverk
JoVE Journal
Biology
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Divergence of Root Microbiota in Different Habitats based on Weighted Correlation Networks
DOI:

09:49 min

September 25, 2021

, , , ,

Chapters

  • 00:06Introduction
  • 00:46I. Data Download
  • 01:05II. Optimal Power Value Determination
  • 02:38III. Construction of a Co-Expression Network and Module Identification
  • 04:25IV. Preservation Test
  • 05:44V. Correlation Analysis of the Module Membership
  • 06:55VI. Analysis of the Microbial Flora in the Microbial Differential Network Module
  • 07:43Resuts: Analysis of Differences in Rice delavayi Root Microbial Communities Based on Weighted Co‐Expression Network
  • 09:18Conclusion

Summary

Automatic Translation

Nätverksanalys tillämpades för att utvärdera associeringen av olika ekologiska mikrobiella samhällen, såsom jord, vatten och rhizosfär. Här presenteras ett protokoll om hur du använder WGCNA-algoritmen för att analysera olika samförekomstnätverk som kan uppstå i mikrobiella samhällen på grund av olika ekologiska miljöer.

Related Videos

Read Article