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自己 カエノールハブディティス 線虫の生態学的調査を行うための高度にスケーラブルなアプローチ
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
A Highly Scalable Approach to Perform Ecological Surveys of Selfing Caenorhabditis Nematodes
DOI:

09:10 min

March 01, 2022

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Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:34Collection Preparation
  • 01:21Field Collection
  • 02:21Plating Out Field Collections and Isolating Nematodes from Collections
  • 04:06Exporting S-Plates from Fulcrum
  • 04:41Check for Proliferation on S-Plates
  • 05:26Lysis of Isofemale Lines
  • 06:22PCR of SSU and ITS2 Sequences
  • 07:00Identifying Nematodes and Processing the Collection Data
  • 08:04Results: Identifying Nematodes with Sanger Sequencing and Sequence BLAST
  • 08:40Conclusion

Summary

Automatic Translation

このプロトコルは、自己発症 性Caenorhabditis 線虫の大規模な生態学的調査を実行するために使用することができる。この方法の主な利点は、自然から収集された線虫に関連する生態学的および分子的データの効率的な組織化および分析である。

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