साल्मोनेला आंतों के उपकला कोशिकाओं के अंदर साल्मोनेला-विशिष्ट रिक्तिकाओं में और साइटोसोल (हाइपर-प्रतिकृति) में मुक्त होता है। इमेजजे के माध्यम से दो पूरक छवि विश्लेषणों द्वारा साल्मोनेला के इंट्रासेल्युलर फेनोटाइप को निर्धारित करने के लिए एक उच्च-थ्रूपुट फ्लोरेसेंस माइक्रोस्कोपी-आधारित प्रोटोकॉल का वर्णन किया गया है, जो एकल-सेल रिज़ॉल्यूशन और स्कोरिंग तक पहुंचता है।