Behovet av nya metoder för att studera membrankontaktställen (MCS) har ökat på grund av ett ökande intresse för att studera dessa cellulära strukturer och deras komponenter. Här presenterar vi ett protokoll som integrerar tidigare tillgängliga mikroskopitekniker för att identifiera och kvantifiera intraorganella och interorganella proteinkomplex som finns vid MCS.