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シングルセルマルチオミクスのための瞬間凍結肝臓組織からの核の単離

JoVE Journal
Biology

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JoVE Journal Biology

Isolation of Nuclei from Flash-Frozen Liver Tissue for Single-Cell Multiomics

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シングルセルマルチオミクスのための瞬間凍結肝臓組織からの核の単離

DOI:

10.3791/64792-v

•

09:09 min

•

December 09, 2022

•

Mateusz Strzelecki⁴, Kelvin Yin, Carlos Talavera-López³, Celia P. Martinez-Jimenez⁴

¹Helmholtz Pioneer Campus (HPC),Helmholtz Munich, ²Institute of Computational Biology, Computational Health Department,Helmholtz Munich, ³Division of Infectious Diseases and Tropical Medicine,Ludwig-Maximillian-Universität Klinikum, ⁴TUM School of Medicine,Technical University of Munich

Chapters

00:04Introduction
00:57Nuclei Isolation
05:11Nuclei Sorting for Hepatocyte Ploidy Profiling or Well-Based Sequencing Approaches
06:36Results: Isolation of Nuclei from Flash-Frozen, Archived Liver Tissues for Single-Nucleus RNA-Seq, ATAC-Seq, and Joint Multiomics
08:39Conclusion

Summary

Automatic Translation

ここでは、一核RNA-seq、ATAC-seq、およびジョイントマルチオミクス(RNA-seqおよびATAC-seq)について、瞬間凍結されたアーカイブされた肝臓組織から核を単離するためのプロトコルを紹介します。

Tags

Nuclei Isolation Single-cell Multiomics Density Gradient Centrifugation Iodixanol Cell Strainer Bio-archived Human Liver Samples Mouse Model Non-human Primate

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