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A Comprehensive Approach to Studying the Promoter Interactome in Scarce Cells

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Un flusso di lavoro integrato per studiare l'architettura del genoma spazio-temporale centrata sul promotore in popolazioni cellulari scarse

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Genetics

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JoVE Journal Genetics

An Integrated Workflow to Study the Promoter-Centric Spatio-Temporal Genome Architecture in Scarce Cell Populations

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Un flusso di lavoro integrato per studiare l'architettura del genoma spazio-temporale centrata sul promotore in popolazioni cellulari scarse

A Comprehensive Approach to Studying the Promoter Interactome in Scarce Cells

DOI:

10.3791/65316-v

•

01:54 min

•

April 21, 2023

•

Llorenç Rovirosa*¹, Laureano Tomás-Daza*^1,2, Blanca Urmeneta, Alfonso Valencia³, Biola M. Javierre⁴

¹Josep Carreras Leukaemia Research Institute, ²Barcelona Supercomputing Center, ³Catalan Institution for Research and Advanced Studies (ICREA), ⁴Institute for Health Science Research Germans Trias i Pujol

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Keywords: LiCHi-C Chromatin Interactions Genome Organization Gene Regulation Regulatory Elements Promoter-centric Spatiotemporal Rare Cell Populations Low Input Capture Hi-C

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