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방법 논문

다발성 경화증 재발 데이터로 입증 된 계절 변화의 삼각 모델링하는 방법

10.5K 조회수

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DOI:

10.3791/53169

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2015년 12월 9일

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이 논문에서

요약

플롯 분석과 삼각법 회귀를 결합하는 것은 다발성 경화증(MS)의 재발 발병 타이밍과 같은 복잡하고 주기적인 현상을 탐색하기 위한 강력한 방법입니다. 이 방법을 사용하면 재발 시 계절적 추세를 편견 없이 특성화할 수 있어 계절 변동, 자외선(UVR) 및 위도의 영향에 대한 새로운 추론을 할 수 있습니다.

초록

이 보고서는 양쪽 반구에 위치한 20개국 46개 임상 센터의 55년 동안의 다발성 경화증 재발 데이터에 대한 삼각법 회귀 모델링의 새로운 Stata 기반 적용을 설명합니다. 이 방법의 성공의 핵심은 통계적 회귀 모델링을 안내하고 확증하기 위해 플롯 분석을 전략적으로 사용하는 것이었습니다. 재발 확률에 대한 계절 및 위도 영향의 존재 및 구조적 형태에 관한 현실적인 가설을 수립하고 결과 모델의 성능을 테스트하기 위해 초기 플롯 분석이 필요했습니다. 그런 다음 이러한 관계를 정량화하고, 중요한 교란 요인을 조정하고, 이러한 연관성이 얼마나 그럴듯한지에 대한 확실성을 측정하기 위해 삼각법 회귀가 필요했습니다. 그래프 기법과 회귀 모델링의 동기화를 통해 최적 수렴이 달성될 때까지 모델을 체계적으로 개선할 수 있었으며, 다발성 경화증의 재발 발병 시기를 예측하는 데 있어 계절과 위도의 독립적인 영향에 대해 새로운 추론을 할 수 있었습니다. 이러한 방법은 계절 및/또는 지리적 위치에 따라 체계적으로 변하는 것으로 의심되거나 알려진 다른 복잡한 질병 및 역학 현상에 적용할 수 있는 잠재력을 가지고 있습니다.

서론

다발성 경화증의 가장 일반적인 형태 (MS)는 다발성 경화증 (RRMS)를 송금대로 돌아가는된다. RRMS는 부분적 또는 완전한 회복에 따라 신경 기능의 일시적인 악화, 특징입니다. 세계적으로, MS의 발생률과 유병률 RRMS에 구체적 발생할 재발 이벤트의 빈도도 위도에 따라 변화 여부. 양쪽 반구에서 적도에서 멀리 멀어짐 1-3을 증가시키고, 그러한 어떤 기본적인 계절 변화가 있는지 협회는 확실하지 않다. 재발시기에 계절을 탐험 최신 연구에 독방 지리적 위치에 재발 타이밍 계절 동향 및 탐구하는 것이없는 폭 넓은 위도의 영향에 관한 추론을 제한, 단일 임상 센터로 제한되어있다. 4-14 이러한 연구는 더 작은 샘플에 의해 제한되어왔다 크기와 스파 스 재발 데이터. 유로 임상 센터에서 열 연구의 2000 메타 분석OPE, 각각의 연구는 시즌의 발병 재발을보고 삼십가지 경우의 최소 포함 미국과 캐나다는 봄에 정점 재발와 겨울 통 4, 재발 발병의시기에 명확한 계절 추세를 설명 . 발병 유사 순환 연간 경향은 일본 (15), 스페인 (16) 모두에서 작은, 연구이기는하지만, 이후에 관찰되었다. 그러나, 비교 미국의 연구는이 패턴 (17)을 확증하는 데 실패했습니다. 지금까지 이....

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프로토콜

참고 : 제공되는 코드 파일에서 같은 번호로 STATA 코드의 섹션으로 대응을 설명하는 각 단계. STATA 명령 이름은 다음 프로토콜 이탤릭체로되어있다.

1. 준비하고 관찰 재발 발병 데이터 플롯

  1. "새 마 - 파일 편집기"버튼을 클릭하여 수행 할 파일을 열고 세 지리적 수준의 각 열두 달력 개월의 각 일자 재발의 온 세트의 수를 계산하기 위해 생성 명령을 사용하여 모델링 할 위치, 반구 글로벌. DO-파일에서 "(DO) 실행"할 파일을 동작 버튼을 클릭하여 조치 명령.
  2. 위치 집계 재발 데이터를 샤피로-Wilk 또는 수정 Jarque-Bera 테스트를 사용하여 정상에 대한 재발 횟수의 기본 배포를 테스트하거나 각각 환자 수준의 재발 데이터를 해리하는 데 swilk 또는 sktest 명령을 사용하십시오. 코드를 선택하고 "(DO) 실행".
    참고 : 중요한 왜곡의 존재에 자연 로그 변환을 적용하고 이후 샤피로-Wilk 또는 적절하게 수정 Jarque-Bera 테스트를 다시 적용하여 대략 정상의 로그 변환 재발 카운트 변수를 테스트 (38, 39)을.
  3. 동일한 수평 축을 따라 계절에 모두 북부와 남반구의 재발의 플로....

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결과

20 개국에 걸쳐 46 임상 센터에서 공급 32,762 재발 이벤트에 삼각 회귀의 응용 프로그램은 MS의 재발 발병시기가 두 반구에서 계절 사이의 기간이 순환과 계절 인 관찰에 대한 방어 통계 인수를 제공하기위한 기초이었다 UVR의 저점 이후 재발 피크는 위도와 상관 관계. 이에 치명타 모델 개발, 평가 및 개선의 필요 반복적 인 과정을 안내하는 플롯 분석에 의존했다.

관찰 된 데이터의 달력 달 분산 플롯에 의해 재발 빈도의 분석은 모든 지리적 수준에서 봄 피크와 가을 물마루 연간주기를 제안했다. 글로벌 재발 데이터의 레이더 플롯은 북반구 재발 월 (그림 1A)에서 정점을 확인했다. 남반구의 재발 발병 데이터 북 데이터 <와 결합했을 때이 봄 피크 지속11 월 피크를 보여 남부 지역 강한> (그림 1B). 오색 골짜기는 각각 11 월과 월에 관찰 북부와 남부 반구 재발의 가장 낮은 주파수를 가진 두 반구에 기록되었다. 에드워드의 시험을.......

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토론

여기에 설명 된 프로토콜은 글로벌 MS 재발 발병 데이터의 시각적 인 그래프 분석에 의해 유도 체계적인 회귀 기반 기술을 자세히 설명합니다. 그것은 사용자가 MS의 재발 개시 타이밍의 시간성에 관한 및 삼각 모델의 사용을 통해 공식적으로이 이론을 테스트 이론을 탐구 할 수 있도록 시작점으로 두 반구에 걸쳐 20 개국에서 재발 데이터의 비교적 간단한 설명 분석을합니다. 최초의 글로벌 재발 발병 데이터를 플로팅하고 체계적으로 그래프와 관찰 된 데이터의 후보 기하학적 맞는 평가의 단계적인 과정을 통해, 계절 트로프 UVR 이후 최대 재발 발병 확률 사이의 위도에 의존하는 상관 관계의 상관 관계는 지금​​까지 전례가없는, 관찰되었다 MS의 역학. 또한 공식 통계 모델링과 경향 시각화를 결합하여,이 분석은 재발 개시 타이밍에 영향을 미치는 요인을 계절을했다 제안하기 전에 메타 분석을 확인북반구와, 또한 처음으로, 남반구이 관찰을 확장했다.

삼각 회귀 모델링 정식 등 모두 재발 시작 타.......

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공개 사항

팀 Spelman은 컨설팅과 바이오젠 아이 덱의 Inc에서 여행을위한 자금 조달에 대한 사례금을 받았다; orla는 회색 바이오젠 아이 덱, 머크 세로 노 노바티스에서 여행 지원을 받았다; 바이오젠 아이 덱, 젠 자임, 노바티스와 머크 세로 노의 과학 자문위원회에 봉사에 대한 보상; 로빈 루카스는 경쟁 이익을 공개하지 않았고, 헬무트 Butzkueven 과학 자문위원회와 바이오젠 아이 덱과 노바티스에 대한 컨설턴트 역할에 대한 보상을 받았다; 바이오젠 아이 덱 호주, 머크 세로 노 호주, 노바티스 호주에서 스피커 사례금; 바이오젠 아이 덱 호주와 머크 세로 노 호주에서 지원을 여행; CASS 재단 (호주), 머크 세로 노, 호주, 신경 과학 재단의 로얄 멜버른 병원 친구, 멜버른 대학에서 연구를 지원합니다.

감사의 글

저자는 자외선 위성 데이터를 추출하고 해석하는 데 도움을 준 Ivan Hanigan에게 감사의 뜻을 전합니다. 이 연구는 HB[ID628856], NHMRC 프로젝트 그랜트[1032484], NHMRC 연구 우수 센터[Grant ID 1001216] 및 MSBase 재단에 NHMRC Career Development Award(임상)의 지원을 받았습니다. MSBase 재단은 Merck Serono, Biogen Idec, Novartis Pharma, Bayer-Schering, Sanofi-Aventis 및 BioCSL의 지원을 받는 비영리 단체입니다. RL은 NHMRC Career Development Award[ID 1004898]의 지원을 받습니다.

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재료

이 논문에 사용된 재료 목록
이름회사카탈로그 번호댓글
Stata SE 버전 13StataCorp, College Station, Texas버전 13분석에 사용되는 통계 분석 소프트웨어
Microsoft Excel 2010 Microsoft 2010달력 날짜 조회를 위한 스프레드시트 프로그램

참고문헌

  1. Simpson, S. Jr, Blizzard, L., Otahal, P., Van der Mei, I., Taylor, B. Latitude is significantly associated with the prevalence of multiple sclerosis: a meta-analysis. J Neurol Neurosurg Psychiatry. 82 (10), 1132-1141 (2011).
  2. Risco, J., et al.

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재인쇄 및 허가

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삼각 회귀 분석위도 분석재발 시점Stata 소프트웨어UVR 모델링조화 모델위상 이동데이터 시각화