本文描述了一种制备重组腺相关病毒9型(rAAV9)载体的方法,用于在小鼠心脏中调控基因表达。
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本文描述了一种制备重组腺相关病毒9型(rAAV9)载体的方法,用于在小鼠心脏中调控基因表达。
通过在小鼠模型中向心肌递送遗传物质以调控特定基因的表达或活性,可研究基因功能,并评估其在心脏中的治疗潜力。目前可用于 体内 小鼠心脏的分子干预。基于重组腺相关病毒(rAAV)的基因组编辑已被用作一种关键工具 体内 心脏基因操作。该技术的具体优势包括高效性、高特异性、低基因组整合率、最小化 免疫原性低且致病性最小。本文详细描述了重组腺相关病毒9型(rAAV9)载体的构建、包装和纯化步骤。将rAAV9通过皮下注射导入新生小鼠后,可在小鼠心脏中实现目的基因的高效表达或有效沉默,而在肝脏及其他组织中则无此效应。使用心脏特异性TnnT2启动子可实现GFP基因在心脏中的高水平表达。此外,当采用rAAV9-U6-shRNA时,可实现心脏中靶基因mRNA的有效抑制。掌握rAAV9技术的相关知识可能对心血管研究具有重要价值。
在各种生物系统中调控特定基因的表达或活性已成为研究基因功能的重要策略1实现这一目标的直接方法是操纵核苷酸序列并产生突变等位基因。尽管对活细胞基因组进行精确、靶向的修饰仍然 一种耗时且劳动密集型的技术,强大的 TALEN 和 Crispr/Cas9 工具的开发开启了基因组编辑的新时代2-5一种更为常规的实验室基因操作方法是将遗传物质(包含编码序列的DNA和RNA,或siRNA/shRNA)导入细胞,以实现目的基因的表达或敲低1,6.
在许多情况下,基因操作的主要瓶颈是将 DNA、RNA 或蛋白质递送至细胞内。关于 体外 研究中,已在许多培养的细胞系中建立了高效的转染系统。然而,在小鼠模型中,尤其是 体内 基因递送更具挑战性。为了实现外源试剂的有效细胞摄取,需要克服一系列胞外和胞内的屏障。其他障碍还包括递送材料的快速清除以及作用时间短暂。7,8一种克服这些问题的策略是使用病毒载体作为 "载体" 或 "载体" 用于 体内 基因递送。病毒在自然进化过程中形成的转导特性,可实现将目的基因高效递送至细胞内7,9,10. 已开发出多种类型的病毒载体,并实现了灵活的 体内 在小鼠不同细胞类型和器官中的基因操作
最常用的病毒系统包括逆转录病毒、慢病毒、腺病毒和腺相关病毒(AAV)11。逆转录病毒是单链RNA病毒,可在有丝分裂过程中将其遗传物质稳定地整合到宿主细胞基因组中,从而在靶细胞和器官中实现转导基因的长期表达12-14。然而,许多类型的逆转录病毒仅感染分裂期细胞,在非分裂细胞中的感染效率极低15,这限制了其在基因递送中的应用。慢病毒属于逆转录病毒科(Retroviridae)的一个属。与其他逆转录病毒不同,慢病毒可感染分裂期和非分裂期细胞,已被广泛用于有丝分裂后及高度分化的细胞中的基因转移16。慢病毒的生命周期同样涉及将载体DNA整合至宿主基因组中,因此慢病毒介导的基因递送可实现转导基因元件的稳定且持久的表达16-18。然而,这一特性在利用此类病毒调控基因表达时可能是一把双刃剑,因为载体DNA的整合可能导致宿主细胞发生插入突变 ,并引发人为假象效应。腺病毒是另一种广泛应用的基因递送系统。与逆转录病毒和慢病毒不同,腺病毒不会整合至宿主基因组,也不会干扰宿主细胞的基因组完整性8,10,11,19。此外,腺病毒可将DNA转染至多种细胞类型,且感染过程不依赖于活跃的细胞分裂19。腺病毒另一个重要特性是载体易于纯化,因为病毒载体具有自我复制能力19,20。然而,该系统的主要局限在于腺病毒感染可能在靶细胞和器官中引发强烈的免疫反应19,从而限制了其在许多研究中的应用,尤其是在基因治疗研究中。
与这些不同类型的病毒载体相比,重组腺相关病毒(rAAV)似乎是理想的基因递送系统21,22。其免疫原性和致病性极低23,24。此外,rAAV能够感染多种细胞类型,包括分裂和非分裂细胞。在大多数情况下,rAAV不会整合到宿主基因组中,因此在靶细胞中发生非预期遗传或基因组改变的风险较低22。
近年来,重组腺相关病毒(rAAV)系统已成功用于将编码蛋白质、miRNA、shRNA 和 Crispr-gRNA 的 DNA 体内递送至小鼠心肌23,25-29。该方法学推动了心血管研究领域内的基础研究和基因治疗研究。本文详细描述了生成 rAAV9 载体的步骤,该载体可高效地在小鼠心脏中过表达或敲低目的基因。本方案为在小鼠实验模型中调控心脏基因表达提供了一种简单且有效的方法。
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所有描述的步骤均在波士顿儿童医院生物安全委员会和机构动物护理与使用委员会批准的协议下进行。波士顿儿童医院拥有无病原小鼠设施,配备受控的明暗循环和气候调节系统。兽医及动物护理人员定期更换笼具,并确保小鼠的健康状况。该设施已获得AAALAC认证,并持有有效的动物福利保证证书(AAALAC认证授予日期:1992年2月24日;动物福利保证编号:A3303-01)。小鼠通过来自压缩气源的CO2实施安乐死。在确认动物心率、活动和呼吸均已停止后,采集组织样本。新生啮齿类动物对CO2安乐死具有抗性,因此采用锋利剪刀进行断头法处死。这些方法符合美国兽医医学协会安乐死专家组的建议。
1. 通过将 cDNA 或 shRNA 表达盒克隆至质粒骨架中构建 rAAV9 载体
注意:用于基因过表达的rAAV9质粒含有AAV2的反向末端重复序列(ITRs),已改造为携带鸡源TNNT2 启动子 (rAAV9.cTNT),可实现转导基因在心肌细胞中的特异性表达25,26,29在启动子下游的质粒中引入了独特的 NheI 和 KpnI 位点。目的基因的 cDNA 片段可通过这两个限制性酶切位点克隆到 rAAV9 载体骨架中。25,26,29在此,以在小鼠心脏中过表达GFP基因的rAAV9载体的构建为例。所得质粒包含由两个ITR位点侧翼的cTNT::GFP表达盒(图1rAAV9.U6::shRNA 构建体用于基因敲低25设计shRNA时,可使用在线shRNA设计服务器。rAAV9.U6::shRNA的构建可通过以下两种方法实现:一是将含有shRNA序列的DNA寡核苷酸退火后连接至经限制性内切酶消化并携带U6启动子的rAAV9载体中;二是通过长片段PCR结合分子内Gibson组装方法完成。 "无缝" 构建30. 所得质粒应包含两侧各有一个ITR位点的U6-shRNA表达盒(图2)。此处以 rAAV9.U6::shRNA 载体为例,用于敲低 Trbp mRNA(Trbp shRNA 序列:GCAGTGATGGATATGCATCTTCTCGAGAAGATGCATATCCATCACTCG)。 scramble shRNA 作为阴性对照(CCTAAGGTTAAGTCGCCCTCGCTCGAGCGAGGGCGACTTAACCTTAGG)。
2. 使用 rAAV9 质粒转染 HEK293 细胞
3. 转染HEK293细胞的收获及rAAV9载体的纯化
4. rAAV9 滴度的测定
5. 新生小鼠中 rAAV9 的注射及心脏基因表达检测
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rAAV9.cTNT::GFP 或 rAAV9.U6::shRNA 质粒构建 rAAV9 的策略分别如图1和图2所示。以这些质粒为例,构建了用于在小鼠心脏中过表达 GFP 基因的 rAAV9 载体。所获得的质粒包含由两个 ITR 位点侧翼包围的 cTNT::GFP 表达盒(图1)。rAAV9.U6::shRNA 载体则用于敲低 Trbp mRNA(图2)
通过qPCR数据经线性回归生成rAAV9滴定的标准曲线。自变量y表示各标准样品DNA分子浓度的Log10值,对应的变量x表示CT值。Log10 (浓度)值(y)与CT值(x)之间呈现良好的线性相关性(R2 = 0.9971),并符合方程 y = -0.2832...
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在质粒构建过程中,应尽量减少不必要的ITR重组。在产生病毒之前,必须始终通过限制性酶切和琼脂糖凝胶电泳来检测AAV质粒的ITR完整性。获得100%完整的质粒是不可能的,但应尽可能降低重组比例。对于成功的rAAV9包装,重组率低于20%是可以接受的。值得注意的是,在较低温度(30 °C)下培养细菌,并采用较低的摇床转速(180–200 rpm),可降低ITR发生重组的概率。
必须确保HEK293细胞处于健康状态,以实现高效的转染和rAAV9包装。 "健康" 细胞通常具有很强的增殖能力,生长迅速。然而,HEK293细胞的快速增殖和生长并不一定保证重组腺相关病毒9型(rAAV9)包装的高效率。因此,实验应使用新鲜的细胞开始。建议使用低代次的HEK293细胞(<10 代,细胞每 2–3 天传代一次)用于 rAAV9 包装。需要注意的是,其他血清型的 rAAV 可能需要采用不同的纯化步骤进行纯化32.
在构建rAAV9质粒时,研究者具有一定的灵活性。可采用限制性酶切位点介导的连接或Gibso...
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作者无任何利益冲突需要披露。
感谢 Zaffar Haque 博士对稿件的仔细审阅。感谢 Masaharu Kataoka 博士和 Gengze Wu 博士的讨论与帮助。王实验室的工作得到了美国心脏协会、肌肉萎缩症协会以及美国国立卫生研究院(HL085635、HL116919、HL125925)的资助。
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| 姓名 | 公司 | 目录编号 | 评论 |
|---|---|---|---|
| 聚乙烯亚胺,线性(分子量 25,000) | Polysciences, Inc. | #23966-2 | |
| 聚丙烯管,36.2 ml,25 x 87 mm(数量:56) | Beckman Coulter, Inc | # 362183 | |
| 核酸酶,超纯级 | SIGMA | #E8263-25KU | |
| 密度梯度介质(碘克沙醇) | SIGMA | #D1556-250ML | |
| 带 Ultracel-100 膜的离心过滤装置 | EMD Millipore Corporation | #UFC910008 | |
| 实验室移液针,90° 钝端,14 号规格,长 6 英寸,镍镀接头 | SIGMA | #CAD7942-12EA | |
| 泊洛沙姆 188 溶液(Pluronic® F-68 溶液) | SIGMA | P5556-100ML | |
| 蛋白酶 K | SIGMA | 3115828001 | |
| 脱氧核糖核酸酶 I(DNase I) | Roche | 10104159001 | |
| 离心机 | Thermo Scientific | 75004260 | |
| 离心系统 | Beckman Coulter | 363118 | |
| 超速离心机 | Beckman Coulter | ||
| DMEM 培养基 | Fisher Scientific | SH30243FS | |
| 胎牛血清 | Atlanta Biologicals | S11150 | |
| rAAV9 载体 | Penn Vector Core | P1967 |
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A correction was made to the Authors section in: Preparation of rAAV9 to Overexpress or Knockdown Genes in Mouse Hearts.
One of the authors names and affiliation was corrected from:
Jian-Ming Jiang3,4
3 Department of Genetics, Harvard Medical School
4 Howard Hughes Medical Institute
to:
Jianming Jiang5
5 Department of Biochemistry, Yong Loo Lin School of Medicine, National University of Singapore