يتطلب اشتراك JoVE لعرض هذا المحتوى. تسجيل الدخول أو ابدأ نسخة تجريبية مجانية

مقالة منهجية

تطبيقات للواح الاضاءه المتوافقة مع اللوحة المفتوحة المصدر

7.3K مشاهدة

⸱

DOI:

10.3791/60088

⸱

أكتوبر 3, 2019

 ,  , 

في هذه المقالة

ملخص

ان باعث الضوء المعين بالأنابيب الصغيرة (M.A.P.L.E.) هو جهاز يعمل بالحاسوب ويقوم بشكل منهجي باناره ابار الميكروتير لتوفير التوجيه للاعداد اليدوي للوحات المجهرية.  يحسن M.A.P.L.E. دقه اعداد الصفيحة الدقيقة اثناء أتمته حفظ سجلات البيانات.  الاضافه إلى ذلك ، فانه يمكن ان تساعد في فحص جوده اللوحة المجهرية أو المساعدة في الكشف عن الأخطاء.

الملخص

ويشيع استخدام الصفائح المجهرية في البيئة المختبرية الحديثة لمجموعه واسعه من المهام سواء في العمليات المختبرية الصغيرة الحجم ، فضلا عن حملات الفحص العالية الانتاجيه الواسعة النطاق. علي الرغم من ان أتمته المختبرات قد زادت بشكل كبير من فائده الصفائح الدقيقة لا تزال هناك حالات حيث الاجهزه القائمة علي الاتمته ليست ممكنة ، وفعاله من حيث التكلفة أو متوافقة مع احتياجات تنسيق اللوحة الصغيرة. وفي هذه الحالات ، يجب اعداد الصفائح المجهرية يدويا. إشكاليه للتلاعب الجزئي اليدوي هو ان عددا من الصعوبات يمكن ان تنشا المتعلقة بدقه تتبع عمليات العينة ، وحفظ سجل البيانات ومراقبه الجودة (QC) التفتيش للتحف الجيدة أو أخطاء التنسيق. بما ان [ميكروبلايت] بئر كثافة زيادة ([اي.], [96-ول], [384-ول], [1536-ول]) الامكانيه لإدخال أخطاء أيضا زيادات بشده.  وعلاوة علي ذلك ، فانه بالنسبة للعمليات المختبرية الصغيرة علي مستوي المقاعد هناك حاجه إلى تحسين سهوله ودقه مناوله العينات بطريقه فعاله من حيث التكلفة. هنا ، نقوم بوصف النظام الذي يعمل كدليل لتنضيد العينات شبه مؤتمت والمشار اليه باسم باعث الضوء المعين لM.A.P.L.E..  M.A.P.L.E. له استخدامات متعددة لدعم الجمع بين الضرب المركب واعداد الصفيحة الدقيقة لتطوير المقايسة في الفحص عاليه الانتاجيه أو العمليات المختبرية العليا ، فضلا عن QC/ضمان الجودة (QA) التقييم التشخيصي لصفيحه صغيره جوده أو تصور أخطاء التنسيق بشكل جيد.

المقدمة

وكما نشرت في الاونه الاخيره1، فان مختبر تحديد الهوية الرئيسية في سكريبس البحوث2 قد وضعت وأصدرت لوحه الاضاءه مفتوحة المصدر لاعداد الصفيحة الصغيرة المشار اليها باسم باعث الضوء المساعدة ميكروبلايت (ماجستير P.L.E.). الاعداد اليدوي للوحات مجهريه ، سواء كانت مصنوعة لأداره مركب أو احتياجات الفحص الحيوي ، يمكن ان تكون عرضه للأخطاء البشرية التي تزيد بشكل كبير وكذلك كثافة الزيادات microplates. الاضافه إلى ذلك ، فان الحفظ السليم للسجلات وتسجيل البيانات الخاصة بمحتوي/شكل الصفيحة الصغيرة هو أيضا عرضه لأخطاء الإدخال اليدوية. وفي مرافق التشغيل الألى للفحص العالي الإنتاجي ، تخفف هذه المسائل من خلال استخدام محطات العمل الروبوتية التي تعم....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

البروتوكول

1. شبه الألى "لوحه إلى لوحه" اعداد نقل عينه

  1. إنشاء ملف CSV كما هو موضح في الشكل 1 الذي يحتوي علي لوحات المصدر والوجهة باستخدام تطبيق تحرير جدول البيانات. يجب ان يكون ملف CSV الذي تم إنشاؤه أعمده الراس التالية في الترتيب المسرودة: Source_barcode; Destination_barcode; Source_well; Dest_well; Transfer_volume.
  2. ضمن أعمده الراس ، تاكد من تضمين صف واحد في ملف CSV لكل عمليه التحويل المطلوبة (علي سبيل المثال ، نقل العينة) مع المعلومات التالية:
    1. Source_barcode: الباركود الابجديه الرقمية من الصفيحة المصدر ، علي سبيل المثال ، S1007372 ؛ اتركه فارغا إذا لم يقترن الباركود.
    2. Destination_barcode: الباركود الابجديه الرق....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

النتائج

منصة M.A.P.L.E. قادره علي إلقاء الضوء علي الآبار في 96-و 384 الصفائح الدقيقة بشكل جيد في مجموعه متنوعة من الطرق شكلي المستخدم, السماح بالتحكم المباشر والمستقل من اللون وكثافة الاضاءه في كل بئر. من خلال المساعدة علي تقليل فرص الخطا في عمليات التغليف اليدوي ، يساعد M.A.P.L.E. المستخدمين علي اعداد الصفائح الدقيقة مع زيادة الثقة بان كل بئر يحتوي علي المحتويات المطلوبة. نقل العينات بين لوحات واعداد لوحات التخفيف التسلسلي ، مثل الامثله التي شوهدت في الشكل 12 والشكل 13.......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المناقشة

من خلال الإفراج عن M.A.P.L.E. كمنصة مفتوحة المصدر ، وقد أدخلنا أداه مختبريه التي توفر الفائدة ، ولكن يمكن أيضا ان تمتد بسهوله لتلبيه الاحتياجات المتطورة للمستخدم النهائي. يعد اعداد عينه الصفيحة الصغيرة بالسطح مهمة شائعه يتم تنفيذها في مجموعه واسعه من بيئات المختبرات ويمكن تحسين هذه المهمة بشكل واضح باستخدام تقنيه مثل M.A.P.L.E.

تم تصميم منصة M.A.P.L.E. خصيصا مع التكيف مع التطبيقات المستقبلية في الاعتبار. يمكن استخراج كل مكون (لوحه الاضاءه الكترونيه ، والبرامج الثابتة ، واجهه المستخدم الرسوميه .......

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

الإفصاحات

المؤلفين ليس لديهم مصالح مالية أو تضارب في المصالح مع اي من المكونات المصنعة المقترحة في بناء جهاز M.A.P.L.E.. المصادر المقدمة هي بدقه لراحة المستخدم ويمكن استخدام اي مكونات متوافقة من مصادر بديله حسب الحاجة.

شكر وتقدير

ويود أصحاب البلاغ الاعتراف بلينا ديلوكا ، وفخر سينغيرا ، وهانا ويليامز ، ولين دينغ ، وائل نووسو ، وساره واتتمان لمساعدتهم في اختبار منصة M.A.P.L.E..

....

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

المواد

قائمة المواد المستخدمة في هذه المقالة
الاسمالشركةرقم فهرسيالتعليقات
96 أو 384 بئر صفيحةدقيقة https://en.wikipedia.org/wiki/Microplate
ضوء ماصةمساعدة المصدر المفتوحhttps://github.com/pierrebaillargeon/Microplate-Assistive-Pipetting-Light-Emitter
ماصةhttps://www.jove.com/science-education/5033/an-introduction-to-the-micropipettor
مطيافبصريات المحيطUSB-650 المد
باعث الأحمر

المراجع

  1. Baillargeon, P., et al. Design of Microplate-Compatible Illumination Panels for a Semiautomated Benchtop Pipetting System. SLAS TECHNOLOGY: Translating Life Sciences Innovation. , (2019).
  2. Baillargeon, P., et al.

الوصول مقيد. يرجى تسجيل الدخول أو بدء فترة تجريبية لعرض هذا المحتوى.

إعادة الطباعة والأذونات

استكشف المزيد من المقالات

باعث ضوئي للمساعدة في الماصة للأطباق الدقيقةلوحات إضاءة مفتوحة المصدرتطبيق التخفيف المتسلسلنقل العينات من طبق إلى آخرعرض توضيحي للفحص عالي الإنتاجيةدليل ضوئي محمولمراقبة جودة الأطباق الدقيقةالكشف عن شوائب الآباراختيار المركبات الواعدةدعم تطوير المقايسات التحليلية