Aquí, describimos un conjunto de métodos para caracterizar la interacción de proteínas con membranas de células o microvesículas.
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Artículo de método
Aquí, describimos un conjunto de métodos para caracterizar la interacción de proteínas con membranas de células o microvesículas.
En el cuerpo humano, la mayoría de las principales reacciones fisiológicas involucradas en la respuesta inmune y la coagulación de la sangre proceden en las membranas de las células. Un primer paso importante en cualquier reacción dependiente de la membrana es la unión de la proteína en la membrana de fosfolípidos. Se ha desarrollado un enfoque para estudiar la interacción de las proteínas con las membranas lipídicas utilizando proteínas marcadas fluorescentemente y citometría de flujo. Este método permite el estudio de las interacciones proteína-membrana utilizando células vivas y vesículas de fosfolípidos naturales o artificiales. La ventaja de este método es la simplicidad y disponibilidad de reactivos y equipos. En este método, las proteínas se etiquetan utilizando colorantes fluorescentes. Sin embargo, se pueden utilizar proteínas autofabricadas y disponibles comercialmente, marcadas fluorescentemente. Después de la conjugación con un colorante fluorescente, las proteínas se incuban con una fuente de la membrana de fosfolípidos (microvesículas o células), y las muestras se analizan por citometría de flujo. Los datos obtenidos se pueden utilizar para calcular las constantes cinéticas y el equilibrio Kd. Además, es posible estimar el número aproximado de sitios de unión a proteínas en la membrana de fosfolípidos utilizando perlas de calibración especiales.
Las biomembranas separan el contenido interno de las células animales y el espacio extracelular. Tenga en cuenta que las membranas también rodean las microvesículas formadas durante el ciclo de vida de la célula y los orgánulos. La membrana celular está compuesta predominantemente de lípidos y proteínas. Las proteínas de membrana realizan funciones de señalización, estructurales, de transporte y adhesivas. Sin embargo, la bicapa lipídica también es esencial para la interrelación de la célula animal con el espacio extracelular. Este artículo propone un método para estudiar la interacción periférica de las proteínas externas con la membrana lipídica.
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1. Etiquetado de proteínas fluorescentes
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El método de citometría de flujo descrito en este documento se utiliza para caracterizar la unión de las proteínas de coagulación plasmática a las plaquetas activadas. Además, se aplicaron vesículas de fosfolípidos PS:PC 20:80 como sistema modelo. Este artículo se centra principalmente en las vesículas artificiales de fosfolípidos como ejemplo. Los parámetros del citómetro, en particular, la tensión del tubo fotomultiplicador (PMT) y la compensación deben seleccionarse para cada dispositivo específico, el objeto de estud.......
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El método propuesto se puede adaptar para una caracterización aproximada de la interacción de proteínas con membranas de fosfolípidos de diversas fuentes y composiciones. La citometría de flujo cuantitativa descrita aquí concede a la resonancia de plasmón de superficie (SPR) en varios parámetros. En particular, tiene una menor sensibilidad y resolución de tiempo y requiere un etiquetado fluorescente de proteínas. El etiquetado fluorescente puede conducir a un cambio en la conformación y la pérdida de actividad de muchas .......
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Los autores no tienen conflictos de intereses que revelar.
Los autores fueron apoyados por una subvención de la Fundación Rusa de Ciencia 20-74-00133.
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| Nombre | Empresa | Número de catálogo | Comentarios |
|---|---|---|---|
| A23187 | Sigma Aldrich | C7522-10MG | |
| Alexa Fluor 647 NHS Ester (Succinimidyl Ester) | Thermo Fisher Scientific | A37573 | colorante fluorescente |
| Apirasa de patatas | Sigma Aldrich | A2230 | |
| BD FACSCantoII | BD Bioscience | ||
| albúmina sérica bovina | VWR Life Science AMRESCO | Am-O332-0.1 | |
| Cloruro de calcio, anhidro, en polvo, ≥ 97% | Sigma Aldrich | C4901-100G | |
| Espectrómetro de fluorescencia Cary Eclipse | Agilent | ||
| D-(+)-Glucosa | Sigma Aldrich | G7528-1KG | |
| DiIC16(3) (1,1'-Dihexadecil-3,3,3',3'-Tetrametilindocarbocianina Perclorato) | Thermo Fisher Scientific | D384 | |
| DMSO | Sigma Aldrich | D8418 | |
| Sal disódica EDTA | VWR Life Science AMRESCO | Am-O105B-0.1 | |
| FACSDiva | BD Bioscience | software de adquisición de datos de citometría | |
| FlowJo | Tree Star | software de citómetro para análisis de datos | |
| HEPES | Sigma Aldrich | H4034-500G | |
| Human Factor X | Investigación enzimática | HFX 1010 | |
| Clorhidrato de hidroxilamina | Panreac | 141914.1209 | |
| L-&alfa;-fosfatidilcolina (Cerebro, Porcino) | Avanti Lípidos Polares | 840053P | |
| L-&alfa;-fosfatidilserina (Cerebro, Porcino) (sal sódica) | Avanti Lípidos Polares | 840032P | |
| Cloruro de magnesio | Sigma Aldrich | M8266-100G | |
| Mini-Extrusora | Avanti Lípidos polares | 610020-1EA | |
| OriginPro 8 SR4 v8.0951 | OriginLab Corporation | Software estadístico | |
| Tabletas de solución salina tamponada con fosfato (PBS), grado biotecnológico | VWR Ciencias de la vida AMRESCO | 97062-732 | |
| Cloruro de potasio | Sigma Aldrich | P9541-500G | |
| Prostaglandina E1 | Cayman Chemical | 13010 | |
| Sephadex G25 | GE Healthcare | GE17-0033-01 medio de filtración en | gel para la purificación de proteínas |
| Sepharose CL-2B | Sigma Aldrich | CL2B300-500ML | medio de filtración en gel para la purificación de plaquetas |
| Bicarbonato de sodio | Corning | 61-065-RO | |
| Cloruro de sodio | Sigma | Aldrich S3014-500G | |
| Fosfato de sodio monobásico | Sigma Columnas de | S3139-250G | |
| con membrana 0.2 y micro; m | Sartorius | VS0171 | |
| Citrato trisódico dihidratado | Sigma Aldrich | S1804-1KG |
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