Dieses Protokoll bietet sowohl qualitative als auch quantitative Analysen von Gesamtsiderophoren, Pyoverdin und Pyochelin aus Pseudomonas aeruginosa.
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Methodenartikel
Dieses Protokoll bietet sowohl qualitative als auch quantitative Analysen von Gesamtsiderophoren, Pyoverdin und Pyochelin aus Pseudomonas aeruginosa.
Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) ist dafür bekannt, dass er eine Vielzahl von Virulenzfaktoren produziert, um Infektionen im Wirt zu etablieren. Ein solcher Mechanismus ist das Abfangen von Eisen durch Siderophorproduktion. P. aeruginosa produziert zwei verschiedene Siderophore: Pyochelin, das eine geringere Eisenchelat-Affinität aufweist, und Pyoverdin, das eine höhere Eisenchelat-Affinität aufweist. Dieser Bericht zeigt, dass Pyoverdin direkt aus bakteriellen Überständen quantifiziert werden kann, während Pyochelin vor der Quantifizierung aus Überständen extrahiert werden muss.
Die primäre Methode zur qualitativen Analyse der Siderophorproduktion ist der Chrom-Azurolsulfonat-Agarplatten-Assay (CAS). In diesem Assay führt die Freisetzung des CAS-Farbstoffs aus demFe3+-Farbstoffkomplex zu einem Farbwechsel von Blau zu Orange, was auf eine Siderophorproduktion hinweist. Für die Quantifizierung der gesamten Siderophore wurden bakterielle Überstände zu gleichen Teilen mit CAS-Farbstoff in einer Mikrotiterplatte gemischt, gefolgt von einer spektrophotometrischen Analyse bei 630 nm. Pyoverdin wurde direkt aus dem bakteriellen Überstand quantifiziert, indem es zu gleichen Teilen mit 50 mM Tris-HCl gemischt wurde, gefolgt von einer spektrophotometrischen Analyse. Ein Peak bei 380 nm bestätigte das Vorhandensein von Pyoverdin. Was Pyochelin betrifft, so war eine direkte Quantifizierung aus dem bakteriellen Überstand nicht möglich, so dass es zuerst extrahiert werden musste. Die anschließende spektrophotometrische Analyse ergab das Vorhandensein von Pyochelin mit einem Peak bei 313 nm.
Organismen benötigen Eisen, um verschiedene lebenswichtige Funktionen zu erfüllen, wie z. B. den Elektronentransport und die DNA-Replikation1. Es ist bekannt, dass Pseudomonas aeruginosa, ein gramnegativer opportunistischer Erreger, eine Vielzahl von Virulenzfaktoren besitzt, um eine Infektion im Wirt zu etablieren, von denen ein Mechanismus die Siderophorbildungist 2. Unter eisenabbauenden Bedingungen setzt P. aeruginosa spezialisierte Moleküle frei, die als Siderophore bezeichnet werden und Eisen aus der Umgebung abschrecken. Siderophore chelatieren Eisen extrazellulär, und der resultierende Eisen-Sid....
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Alle Bakterienisolate von P. aeruginosa wurden aus medizinischen mikrobiologischen Labors in Vadodara und Jaipur, Indien, bezogen. Alle ausgewählten klinischen Isolate wurden in der Biosicherheitswerkbank (BSL2) gehandhabt und beim Umgang mit Bakterienisolaten während der Experimente wurde äußerste Sorgfalt walten lassen. Die kommerziellen Details aller Reagenzien/Lösungen sind in der Materialtabelle aufgeführt.
1. Herstellung von Chrom-Azurolsulfonat (CAS)-Farbstoff und Agar-Agar-Medien
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Vor der Quantifizierung von Siderophoren aus klinischen Isolaten wurde ein qualitatives Screening auf die Siderophorproduktion durchgeführt, um die Produktion von Siderophoren sicherzustellen. Der qualitative Nachweis von Siderophoren aus klinischen Isolaten wurde durch streifende Bakterien auf CAS-Agarplatten beobachtet. Drei klinische Isolate, nämlich MR1, TL7, J3, sowie PAO1 (der Referenzstamm), wurden für die Studie ausgewählt. Alle drei klinischen Isolate und PAO1 zeigten positive Er.......
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Dieses Protokoll ermöglicht es den Forschern, die Gesamtzahl der Siderophore und zwei verschiedene Siderophore von P. aeruginosa, nämlich Pyoverdin und Pyochelin, aus dem bakteriellen zellfreien Überstand zu quantifizieren. Im CAS-Agarplatten-Assay bilden der CAS-Farbstoff undFe3+-Ionen einen Komplex. Wenn Bakterien Siderophore produzieren, löschen sieFe-3+-Ionen aus dem CAS-Fe3+-Komplex, was zu einer Farbänderung um das Bakterienwachstum herum führt. Diese Veränderung führt zu e.......
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Die Autoren haben nichts zu verraten.
Die Autoren danken für die Finanzierung durch DBT - Biotechnology Teaching Program, DBT - BUILDER Program und FIST. MR bedankt sich für das von SHODH erhaltene Stipendium. HP bedankt sich für das vom CSIR erhaltene Stipendium.
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| Name | Unternehmen | Katalognummer | Kommentare |
|---|---|---|---|
| Agar-Agar, Typ I | HIMEDIA | GRM666 | |
| 8-Hydroxychinolin | Loba Chemie | 4151 | |
| Casaminosäure | SRL Chemikalien | 68806 | |
| Cetyltrimethylammoniumbromid (CTAB) | HIMEDIA | RM4867-100G | |
| Chloroform | Merck | 1070242521 | |
| Chromazurolsulfonat | HIMEDIA | RM336-10G | |
| Zitronensäure | Merck | 100241 | |
| Dextrose-Monohydrat | Merck | 108342 | |
| Dichlormethan | Merck | 107020 | |
| Eisenchlorid-Hexahydrat | HIMEDIA | GRM6353 | |
| Glaskolben | Borosil | 5100021 | |
| Glas Reagenzgläser | Borosil | 9820U05 | |
| Salzsäure | SDFCL | 20125 | |
| King's Medium B Base | HIMEDIA | M1544-500G | |
| M9 Minimal Medium Salze | HIMEDIA | G013-500G | |
| Magnesiumsulfat | Qualigens | 10034 | |
| MultiskanGO UV-Spektralphotometer | Thermo Scientific | 51119200 | |
| Pepton Typ I, bakteriologisch | HIMEDIA | RM667-500G | |
| PIPES freie Säure | MP Biomedicals | 190257 | |
| Kaliumdihydrogenphosphat | Merck | 1048731000 | |
| Proteose Pepton | HIMEDIA | RM005-500G | |
| Shimadzu UV-Vis Spektralphotometer | Shimadzu | 2072310058 | |
| Sigma Laborzentrifuge | Sigma-Aldrich | 3-18K | |
| Natriumchlorid | Qualigens | 15915 |
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