ATAC-Seq optimering för cancerepigenetikforskning

ATAC-seq är en DNA-sekvenseringsmetod som använder det hyperaktiva mutanttransposaset, Tn5, för att kartlägga förändringar i kromatintillgänglighet medierad av transkriptionsfaktorer. ATAC-seq möjliggör upptäckt av de molekylära mekanismer som ligger bakom fenotypiska förändringar i cancerceller. Detta protokoll beskriver optimeringsprocedurer för ATAC-seq i epitelcelltyper, inklusive cancerceller.