Yijun Ruan Genome Institute of Singapore Agency for Science, Technology and Research, Singapore Biography Publications Institution JoVE Articles Yijun Ruan has not added a biography. If you are Yijun Ruan and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Évaluation Systématique Des Facteurs Influant Sur ChIP-seq Fidelity Nature Methods. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22522655 Séquençage De L'exome De L'adénocarcinome Gastrique Identifie Récurrentes Mutations Somatiques Dans L'adhésion Cellulaire Et Les Gènes Remodelage De La Chromatine Nature Genetics. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22484628 Une Délétion Commune Polymorphisme BIM Médiateur Résistance Intrinsèque Et Réponses Inférieures Aux Inhibiteurs De Tyrosine Kinase Dans Le Cancer Nature Medicine. 2012 | Pubmed ID: 22426421 De Vastes Interactions Chromatine Promoteur Centrées Fournir Une Base Topologique Pour Le Règlement De Transcription Cell. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22265404 L'analyse Du Génome Large Transcription Pleine Longueur Au Moyen De 5 'et 3' Appariées Balise De Fin Séquençage De Nouvelle Génération (ARN-PET) Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2012 | Pubmed ID: 22113299 FCCT Médiée Interactome Chromatine Fonctionnelle Dans Des Cellules Pluripotentes Nature Genetics. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21685913 Les Enquêtes Larges De La Diversité ADN Viral Obtenus à L'aide De Métagénomique Des Virus Les Moustiques PloS One. 2011 | Pubmed ID: 21674005 Interaction Networks Chromatine Et Architectures D'ordre Supérieur Des Génomes Eucaryotes Journal of Cellular Biochemistry. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21520242 Globale à Long Durée Appariés Balise De Fin De Cartographie Révèle Des Tendances Caractéristiques Des Variations Structurelles Dans Les Génomes De Cancers épithéliaux Genome Research. May, 2011 | Pubmed ID: 21467267 Conséquences De La Transcription De La Génomique Les Aberrations De Structure Dans Le Cancer Du Sein Genome Research. May, 2011 | Pubmed ID: 21467264 Séquençage Du Génome Anniversaire. Présentant Le Génome Humain: Maintenant En 3D! Science (New York, N.Y.). Feb, 2011 | Pubmed ID: 21350163 Détermination De La Reliure Transcription Factor Nature Genetics. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21217639 Modèle Intégratif De Génomique Pour La Détermination De Facteurs De Sélection Du Site De Liaison Aux Récepteurs D'oestrogènes Par-α Molecular Systems Biology. Dec, 2010 | Pubmed ID: 21179027 L'échelle Du Génome Analyse Révèle Méthyl-CpG-binding Protein 2-dépendante Règlement Des MicroARN Dans Un Modèle Murin De Syndrome De Rett Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20921386 Multiplex Parallèles Approches De Séquençage Pair-fin-dimarqueur Dans La Biologie Des Systèmes Wiley Interdisciplinary Reviews. Systems Biology and Medicine. Mar-Apr, 2010 | Pubmed ID: 20836024 Réseau International Des Projets De Génomique Du Cancer Nature. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20393554 Une Enquête Génomique De La Sélection Positive Dans Burkholderia Pseudomallei Donne Un Aperçu Sur L'évolution De La Virulence Accidentelle PLoS Pathogens. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20368977 Chia-PET Outil D'analyse De La Chromatine Interaction Complète Avec Séquençage Tag Appariés Fin Genome Biology. 2010 | Pubmed ID: 20181287 Analyse De L'interaction Chromatine Utilisant Le Séquençage De Tag Paired-end Current Protocols in Molecular Biology / Edited by Frederick M. Ausubel ... [et Al.]. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20069536 Associations Préférentiels Entre Gènes Co-régulés Révéler Une Interactome Transcriptionnelle Dans Les Cellules érythroïdes Nature Genetics. Jan, 2010 | Pubmed ID: 20010836 Une Oestrogène-récepteur Alpha-humaine Liée Chromatine Interactome Nature. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19890323 Analyse Métagénomique Des Virus Dans L'eau Récupérée Environmental Microbiology. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19555373 Dernières Sélection Positive D'un Homme Du Récepteur Aux Androgènes / Ectodysplasin Haplotype A2 Receptor Et Sa Relation à La Calvitie Masculine Human Genetics. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19373488 La Nouvelle Génération De Séquençage De L'ADN De Paires De Gamme Tags (PET) Pour Les Analyses Du Transcriptome Et Du Génome Genome Research. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19339662 De Novo-Identification Des PPARgamma / RXR Sites De Liaison Et Des Cibles Directes Durant L'adipogenèse PloS One. 2009 | Pubmed ID: 19300518 ChIP-base Méthodes Pour L'identification Des Interactions à Longue Portée Chromatine Journal of Cellular Biochemistry. May, 2009 | Pubmed ID: 19247990 Evolution Du Répertoire Transcription Factor Binding Mammifères Par Des éléments Transposables Genome Research. Nov, 2008 | Pubmed ID: 18682548 S'attaquer à La Epigénome Dans Les Cellules Souches Pluripotentes Journal of Genetics and Genomics = Yi Chuan Xue Bao. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18640620 Intégration Des Voies De Signalisation Externes Avec Le Réseau De Base De La Transcription Dans Les Cellules Souches Embryonnaires Cell. Jun, 2008 | Pubmed ID: 18555785 Le Métagénome Aéroporté Dans Un Environnement Intérieur En Milieu Urbain PloS One. 2008 | Pubmed ID: 18382653 Profilage Métagénomique Fonctionnelle De Neuf Biomes Nature. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18337718 Biodiversité Et La Biogéographie Des Phages Dans Stromatolites Modernes Et Thrombolites Nature. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18311127 L'utilisation De Amplification Par Déplacement De Multiples Bibliothèques Pour Amplifier L'ADN Complexes Nucleic Acids Research. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18285362 Analyse Numérique Et Modélisation De La Distribution Avidité L'échelle Du Génome Des Sites Facteur De Transcription Liant Dans Chip-pet Expériences Genome Informatics. International Conference on Genome Informatics. 2007 | Pubmed ID: 18546507 Génome Entier De Cartographie De La Lysine 4 Trimethylations H3 Et 27 Histones Révèle Distinctes Compartiments Génomiques Dans Cellules Souches Embryonnaires Humaines Cell Stem Cell. Sep, 2007 | Pubmed ID: 18371363 Appariés Fin DiTagging Pour Transcriptome Et L'analyse Du Génome Current Protocols in Molecular Biology / Edited by Frederick M. Ausubel ... [et Al.]. Jul, 2007 | Pubmed ID: 18265396 L'échelle Du Génome Cartographie Des RELA (p65) Reliure Identifie E2F1 Comme Un Activateur Transcriptionnel Recruté Par NF-kappaB Sur TLR4 Activation Molecular Cell. Aug, 2007 | Pubmed ID: 17707233 Aberrations Pathway De Cellules De Mélanome Murin Observé Dans Transcriptomes Dimarqueur Appariés Fin BMC Cancer. 2007 | Pubmed ID: 17594473 Identification Et Analyse Des éléments Fonctionnels Dans 1% Du Génome Humain Par Le Projet Pilote ENCODE Nature. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17571346 Cartographie Des Régions Facteur De Transcription Liant Dans Les Cellules De Mammifères Par ChIP: Comparaison Des Technologies De L'Array-et Séquençage à Base De Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568005 Pseudogènes Dans Les Régions ENCODE: Annotation Consensus, L'analyse De La Transcription, Et L'évolution Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568002 Transcrits De Fusion Et Transcrits Loci Retrotransposed Découvert Grâce à L'analyse Du Transcriptome à L'aide Complète Paired-End Bimarqueurs (PET) Genome Research. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17568001 L'ensemble Du Génome Cartographie Des Sites De Liaison Aux Récepteurs D'oestrogènes Alpha PLoS Genetics. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17542648 Une Approche Génomique Pour Réponse De L'hôte De Compréhension Pendant La Dengue Novartis Foundation Symposium. 2006 | Pubmed ID: 17319164 La Cartographie Mondiale Des C-Myc Sites De Liaison Et Des Réseaux De Gènes Cibles Dans Les Cellules B De L'homme Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2006 | Pubmed ID: 17093053 PET-outil: Une Suite Logicielle Complète Pour Le Traitement Et La Gestion Des Données Appariées Dimarqueur Fin De Séquence (TEP) BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 16934139 Séquençage Multiplex De Paires De Gamme Bimarqueurs (MS-PET): Une Stratégie Pour L'analyse Ultra-haut Débit De Transcriptomes Et Des Génomes Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16840528 Le Réseau De Transcription Oct4 Et Nanog Régule Pluripotence Dans Les Cellules Souches Embryonnaires De Souris Nature Genetics. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16518401 Une Carte Mondiale De La P53 De Transcription Du Facteur Sites De Liaison Dans Le Génome Humain Cell. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16413492 ARN Viral Communautaire Dans Les Matières Fécales De L'homme: Prévalence Des Virus Pathogènes Des Plantes PLoS Biology. Jan, 2006 | Pubmed ID: 16336043 L'analyse Du Transcriptome De L'embryogenèse Zebrafish L'aide De Microréseaux PLoS Genetics. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16132083 Identification De La Signature Génétique (SIG) Analyse Pour La Caractérisation Du Transcriptome Et L'annotation Du Génome Nature Methods. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15782207 Mode De Transmission Du SRAS à Singapour Réévaluation Par Analyse De Séquence Virale Variation PLoS Medicine. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15736999 Le Statut, La Qualité, Et L'expansion Du NIH Sur Toute La Longueur Projet D'ADNc: La Collection Mammifère De Gène (MGC) Genome Research. Oct, 2004 | Pubmed ID: 15489334 Dynamics Mutationnelles Du Coronavirus Du SRAS En Culture Cellulaire Et Les Populations Humaines Isolées En 2003 BMC Infectious Diseases. Sep, 2004 | Pubmed ID: 15347429 5 'analyse à Long Sérielle D'expression Génique (LongSAGE) Et 3' Pour La Caractérisation Du Transcriptome LongSAGE Et L'annotation Du Génome Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Aug, 2004 | Pubmed ID: 15272081 Laboratoire Acquise Syndrome Respiratoire Aigu Sévère The New England Journal of Medicine. Apr, 2004 | Pubmed ID: 15103000 Interrogation Du Transcriptome Trends in Biotechnology. Jan, 2004 | Pubmed ID: 14690619 Analyse de l'interaction avec la chromatine Tag appariés Fin de séquençage (Chia-PET) pour la cartographie des interactions Chromatine et transcription Comprendre le règlement Yufen Goh*1, Melissa J. Fullwood*1,2,3, Huay Mei Poh1, Su Qin Peh1, Chin Thing Ong1, Jingyao Zhang1, Xiaoan Ruan1, Yijun Ruan1,3 1Genome Institute of Singapore, Agency for Science, Technology and Research, Singapore, 2A*STAR-Duke-NUS Neuroscience Research Partnership, Singapore, 3Department of Biochemistry, National University of Singapore, Singapore JoVE 3770 Biology
Analyse de l'interaction avec la chromatine Tag appariés Fin de séquençage (Chia-PET) pour la cartographie des interactions Chromatine et transcription Comprendre le règlement Yufen Goh*1, Melissa J. Fullwood*1,2,3, Huay Mei Poh1, Su Qin Peh1, Chin Thing Ong1, Jingyao Zhang1, Xiaoan Ruan1, Yijun Ruan1,3 1Genome Institute of Singapore, Agency for Science, Technology and Research, Singapore, 2A*STAR-Duke-NUS Neuroscience Research Partnership, Singapore, 3Department of Biochemistry, National University of Singapore, Singapore JoVE 3770 Biology