Sistein Kalıntılarının Solvent Erişilebilirlik Analizi<em> Mısır rayado fino virüsü</emÜretilen> Virüs gibi parçacıklar<em> Nicotiana benthamiana</emVLP'ler için Peptidlerin> Bitkiler ve Çapraz bağlama
Summary
Sistein artıkları tiyol grubunun çözücü yönelik analiz etmek için bir yöntem,<em> Mısır rayado fino virüsü</emBir peptid çapraz bağlama reaksiyonu, ardından> (MRFV)-virüs benzeri tanecikler (VLP'ler) tarif edilir. Yöntem, belirli reaksiyonlar için hedef olabilir VLP'ler yüzeyi üzerinde çeşitli kimyasal gruplarından durumu yararlanır.
Abstract
Virüs özellikleri ve fiziko-kimyasal ve fiziksel özelliklerini taklit ve sömürücü dünyanın en acil sorunlarından bazılarına çözümler sunmak için umut vaat ediyor. Sırf aralığı ve ilginç özellikleri ile birleştiğinde virüs tipleri potansiyel virüs tabanlı teknolojilerde uygulamalar için sonsuz fırsatlar verecektir. Virüsler, sıcaklık ve pH koşulları altında geniş bir yelpazede farklı şekil ve boyut, simetri özgüllüğü, polyvalence, ve sabit özelliklere sahip partiküller halinde kendini monte etmek özelliğine sahiptir. Doğal olarak, bu gibi özelliklerinin dikkate değer bir dizi ile, virüs biomateryaller 9, aşılar, 14, 15, elektronik maddeler, kimyasal araçlar, konteynırlar ve moleküler elektronik 4, 5, 10, 11, 16, 18, 12 olarak kullanım için önerilmiştir.
Nanoteknolojide virüsler kullanılması için, yeni işlevler vermek için kendi doğal formlardan değiştirilmesi gerekir. Bu zorlu process gen viral genomun değişiklik ve kimyasal olarak virüs parçacığı reaktif gruplar 8 ile yabancı ya da arzu edilen moleküllerin bağlanması dahil çeşitli mekanizmalar vasıtasıyla gerçekleştirilebilir. Bir virüs değiştirme yeteneği öncelikle virüs fizikokimyasal ve fiziksel özelliklerine bağlıdır. Buna ek olarak, genetik veya fizikokimyasal olumsuz değişiklikler virüsün doğal yapısını ve fonksiyonunu etkileyen virüs olmadan gerçekleştirilmesi gerekir. Maize rayado fino virüsü (MRFV) kat proteinler, protein-protein stabilize edilmektedir kararlı ve boş VLP'ler üreten E. coli içinde kendi kendine bir araya etkileşimi ve bu virüs bazlı teknolojileri uygulamalar 8 kullanılabilir. Tütün bitkilerinde üretilen peptidlerin VLP'ler çeşitli kovalent 13 görüntülenebilir hangi bir yapı iskelesi olarak incelenmiştir. Burada, bir virüs kapsid içinde çözücü erişilebilir sissteinler hangi modifikasyonu için kullanılabilir belirlemek) 1 adımları açıklarkatyon, ve 2) capsids ile değiştirilmiş peptitler bioconjugate. Doğal ya da mutationally takılan amino asit kalıntıları ve standart bağlama teknolojileri kullanarak, malzemeler çok çeşitli böyle Brom mozaik virüsü 3, karanfil benek virüsü 12, Börülce klorotik benek virüsü 6, Tütün mozaik virüsü gibi bitki yüzeyinde ortaya konulmuştur Virüs 17, Şalgam sarı mozaik virüsü 1 ve MRFV 13.
Protocol
Representative Results
Discussion
Burada sunulan yöntem, bitki üretilen VLP'ler yüzeyi üzerinde hem de diğer protein kompleksleri üzerinde mevcut reaktif sistein çok hassas ve hızlı bir analizine izin verir. Maleimides stabil tiyoeter bağları oluşturmak için ücretsiz sülfidril içeren moleküllerle reaksiyona tiyol özgü reaktifler vardır. Bu yöntem, diğer amino asitler ile etkileşimlerine sülfhidril grupları ile tepkimeye maleimides özgüllüğünü dayanmaktadır. VLP'ler arasında doğal yapısının korunması tüm sü…
Disclosures
The authors have nothing to disclose.
Materials
| Name of the reagent | Company | Catalog number | Comments |
| Thinwall, Ultra-Clear Tubes | Beckman | 344059 | |
| mMESSAGE mMACHINE T7 Kit | Life Tecnologies | AM1344M | |
| Fluorescein-5-Maleimide | Thermo Scientific Life Technologies | 46130 F150 | 46130 is out of order substitute with F150 |
| Pierce Biotin Quantitation Kit | Thermo Scientific | 28005 | |
| EZ-Link Maleimide-PEG2-Biotin, No-Weigh Format | Thermo Scientific | 21901 | |
| SM(PEG)n Crosslinkers | Thermo Scientific | 22107 | |
| 10-20% Tris-Glycine gel | Invitrogen | EC61352 | |
| Laemmli Buffer | Bio-Rad | 1610737 | |
| Tris Glycine SDS Running Buffer | Invitrogen | LC2675 | |
| Tris Glycine Transfer Buffer | Invitrogen | LC3675 | |
| Nitrocellulose Membrane Filter Paper Sandwich | Invitrogen | LC2001 | |
| Phosphatase Labeled Affinity Purified Antibody to Rabbit IgG | Kirkegaard and Perry Laboratories | 0751516 | |
| NBT/BCIP Phosphatase Substrate | Kirkegaard and Perry Laboratories | 508107 |
References
- Barnhill, H., Reuther, R., Ferguson, P. L., Dreher, T. W., Wang, Q. Turnip yellow mosaic virus as a chemoaddressable bionanoparticle. Bioconj. Chem. 18, 852-859 (2007).
- Chapman, S., Kavanagh, T., Baulcombe, D. Potato virus X as a vector for gene expression in plants. Plant J. 2, 549-557 (1992).
- Chen, C., Kwak, E. S., Stein, B., Kao, C. C., Dragnea, B. Packaging of gold particles in viral capsids. J. Nanosci. Nanotechnol. 5, 2029-2033 (2005).
- Fowler, C. E., Shenton, W., Stubbs, G., Mann, S. Tobacco mosaic virus liquid crystals as templates for the interior design of silica mesophases and nanoparticles. Advanced Materials. 13, 1266-1269 (2001).
- Gazit, E. Use of biomolecular templates for the fabrication of metal nanowires. FEBS. J. 274, 317-322 (2007).
- Gillitzer, E., Wilts, D., Young, M., Douglas, T. Chemical modification of a viral cage for multivalent presentation. Chem. Commun. , 2390-2391 (2002).
- Hammond, R. W., Hammond, J. Maize rayado fino virus capsid proteins assemble into virus-like particles in Escherichia coli. Virus Res. 147, 208-215 (2010).
- Hermamson, G. T. . Bioconjugate techniques. , (1991).
- Kaiser, C. R., Flenniken, M. L., Gillitzer, E., Harmsen, A. L., Harmsen, A. G., Jutila, M. A., Douglas, T., Young, M. J. Biodistribution studies of protein cage nanoparticles demonstrate broad tissue distribution and rapid clearance in vivo. Int. J. Nanomed. 2, 715-733 (2007).
- Knez, M., Bittner, A. M., Boes, F., Wege, C., Jeske, H., Maisse, E., Kern, K. Biotemplate synthesis of 3-nm nickel and cobalt nanowires. Nano Lett. 3, 1079-1082 (2003).
- Lee, S. Y., Culver, J. N., Harris, M. T. Effect of CuCl2 concentration on the aggregation and mineralization of Tobacco mosaic virus biotemplate. J. Colloid. Interface. Sci. 297, 554-560 (2006).
- Lvov, Y., Haas, H., Decher, G., Mohwald, H., Mikhailov, A., Mtchedlishvily, B., Morgunova, E., Vainshtein, B. Successive deposition of alternate layers of polyelectrolytes and a charged virus. Langmuir. 10, 4232-4236 (1994).
- Natilla, A., Hammond, R. W. Maize rayado fino virus virus-like particles expressed in tobacco plants: a new platform for cysteine selective bioconjugation peptide display. J. Virol. Methods. 178, 209-215 (2011).
- Rae, C. S., Khor, I. W., Wang, Q., Destito, G., Gonzalez, M. J., Singh, P., Thomas, D. M., Estrada, M. N., Powell, E., Finn, M. G., Manchester, M. Systemic trafficking of plant virus nanoparticles in mice via the oral route. Virology. 343, 2224-2235 (2005).
- Raja, K. S., Wang, Q., Gonzalez, M. J., Manchester, M., Johnson, J. E., Finn, M. G. Hybrid virus-polymer materials. Synthesis and properties of PEG-decorated Cowpea mosaic virus. Biomacromolecules. 4, 472-476 (2003).
- Royston, E., Lee, S. Y., Culver, J. N., Harris, M. T. Characterization of silica-coated Tobacco mosaic virus. J. Colloid Interface Sci. 298, 706-712 (2006).
- Schlick, T. L., Ding, Z., Kovacs, E. W., Francis, M. B. Dual-surface modification in the Tobacco mosaic virus. J. Am. Chem. Soc. 127, 3718-3723 (2005).
- Young, M., Willits, D., Uchida, M., Douglas, T. Plant viruses as biotemplates for materials and their use in nanotechnology. Annu. Rev. Phytopathol. 46, 361-384 (2008).
