Summary

Biyomedikal ve Biyomühendislik Araştırmaları için Ahtapot Ekosistemi Kurulması

Published: September 22, 2021
doi:

Summary

Ahtapotların benzersiz fizyolojik ve anatomik yapılarını anlamak biyomedikal araştırmaları büyük ölçüde etkileyebilir. Bu kılavuz, bu türe uyum sağlamak için bir deniz ortamının nasıl kurulup sürdürüleceğizlerini gösterir ve ahtapotun sinir sistemi anatomisini ve işlevini görselleştirmek için son teknoloji görüntüleme ve analitik yaklaşımları içerir.

Abstract

Biyomedikal araştırmalardaki birçok gelişme, farklı türlerdeki belirli işlevleri destekleyen anatomik ve hücresel mekanizmaların keşfedilmelerinden ilham alınmıştır. Ahtapot, bilim insanlarına nörobilim, robotik, rejeneratif tıp ve protez alanları hakkında yeni bilgiler veren bu olağanüstü hayvanlardan biridir. Bu sefalopod türüyle yapılan araştırmalar, projenin başarısı için kritik öneme sahip ahtapot ve ekosistemi için karmaşık tesislerin ve yoğun bakımın kurulumunu gerektirir. Bu sistem, hayvan için güvenli ve temiz bir ortam sağlamak için birden fazla mekanik ve biyolojik filtreleme sistemi gerektirir. Kontrol sistemi ile birlikte, tesisin uzun vadede etkin bir şekilde çalışması için özel rutin bakım ve temizlik gereklidir. Tankın manzarasını değiştirerek, çeşitli avları birleştirerek ve üzerinde çalışmaları için zorlu görevler sunarak bu akıllı hayvanlara zenginleştirilmiş bir ortam sağlamaları önerilir. Sonuçlarımız arasında MRG ve tüm vücut otoflüoresans görüntülemenin yanı sıra sinir sistemini daha iyi anlamak için davranışsal çalışmalar bulunmaktadır. Ahtapotlar, biyomedikal araştırmaların birçok alanını etkileyebilecek benzersiz fizyolojiye sahiptir. Onlara sürdürülebilir bir ekosistem sağlamak, farklı yeteneklerini ortaya çıkarmanın ilk önemli adımıdır.

Introduction

Biyomedikal araştırma ve biyomedikal mühendisliğindeki yeni kavramlar genellikle biyolojik türlerin çevresel ve fizyolojik koşulları ve zorlukları ele almak için sahip oldukları belirli stratejileri belirlemekle ilham almaktadır. Örneğin, ateşböceklerindeki floresan özelliklerini anlamak, diğer model organizmalarda hücresel aktiviteyi rapor edebilecek yeni floresan sensörlerin geliştirilmesine yol açmıştır1; alglerde ışıkla aktive edilen iyon kanallarının tanımlanması hücresel ve zamansal spesifik ışık bazlı-nöromodülasyonun gelişmesine yol açmıştır2,3,4,5; Dünya’nın manyetik alanına göre gezinen cam yayın balığındaki proteinlerin keşfedilmesi manyetik tabanlı nöromodülasyonun gelişmesine yol açmıştır6,7,8,9,10,11; Aplysia’daki sifon refleksini anlamak, davranışın hücresel temelini anlamada etkili olmuştur12,13,14.

Araştırmacılar, geleneksel olmayan laboratuvar türlerinin sahip olduğu fizyolojik işlevler üzerindeki benzersiz güçlü yönlerden ve yeni bakış açılarından yararlanarak mevcut biyomühendislik ve filogenetik araç kutusunu genişletmeye devam ediyor. Federal kurumlar, çeşitli türler üzerinde gerçekleştirilen yeni çalışmaları finanse ederek bu çalışma çizgilerini desteklemeye başlıyorlar.

Eşsiz anatomi ve yenilenme yeteneklerine sahip bir hayvan cinsinin yanı sıra her bir kolunun adaptif kontrolü, büyüleyici biyologlar ve mühendisler ve toplumun her kesiminden büyüleyici kitleler Ahtapot17’dir. Nitekim, ahtapotun fizyolojisi ve davranışının birçok yönü son on yıllarda incelenmiştir15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26 . Bununla birlikte, moleküler ve evrimsel biyoloji, robotik, hareket kaydı, görüntüleme, makine öğrenimi ve elektrofizyolojideki son gelişmeler ahtapot fizyolojisi ve davranışı ile ilgili keşifleri hızlandırır ve bunları yenilikçi biyomühendislik stratejilerine çevirir27,28,29,30,31,32,33,34,35 ,36,37,38,39.

Burada, farklı geçmişlerden, bilimsel ilgi alanlarından ve hedeflerden bilim adamları ve mühendisler için ilgi ve alaka düzeyi olacak ahtapot hayvancılığının nasıl kurulacağını ve sürdürüleceğini açıklıyoruz. Bununla birlikte, sonuçlarımız ahtapotların nörobilim ve nöromühendislik araştırmalarında uygulanmasına odaklanmaktadır. Ahtapot, merkezi beyinde 45 milyon nöron, optik loblarda 180 milyon nöron ve sekiz eksenel kordon ve periferik gangliyonda ek 350 milyon nöron ile oldukça gelişmiş bir sinir sistemine sahiptir; karşılaştırıldığında, bir köpek benzer sayıda nörona ve bir kediye sadece yarısına sahiptir40. Omurgalı sinir sisteminin aksine, ahtapotun beynindeki milyonlarca nöronun kolunun eksenel kordonlarındaki milyonlarca nörona bağlayan sadece 32K efferent ve 140K afferent lifleri vardır40,41,42. Bu nispeten az sayıda birbirine bağlı lif, ahtapotların sahip olduğu benzersiz dağıtılmış nöronal kontrolü vurgulayarak, motor programlarının yürütülmesine ilişkin ayrıntıların çoğunun eksenel kordonun kendisinde gerçekleştirildiğini göstermektedir. Ahtapotun kolları, kabın içinde olsalar bile kavanoz kapaklarını açma gibi manipülasyon becerilerini sağlayan olağanüstü ince motor kontrolüne sahiptir. Bu son derece gelişmiş prehensile motor yeteneği Cephalopods sınıfına özgüdür (ahtapot, mürekkep balığı ve kalamar)43.

Gerçekten de, yüz milyonlarca yıllık evrim boyunca ahtapot, bilimsel ve mühendislik alanlarında yeni gelişim ve ilerlemeye ilham veren olağanüstü ve sofistike bir genom ve fizyolojik sistem43.44 geliştirmiştir. Örneğin, ahtapotun emicilerinin anatomik yapısına dayanan suya dayanıklı bir yapışkan yama ıslak ve kuru yüzeylere yapışabilir45; ahtapotun kamuflaj derisinden esinlenen sentetik bir kamuflaj malzemesi, düz, 2D bir yüzeyi tümsekler ve çukurlarla üç boyutlu bir yüzeye dönüştürebilir46. Gelecekte vücudun içinde cerrahi aletler olarak hizmet verebilecek minyatür yumuşak ve otonom robotlar (yani Octobots); ve tank benzeri bir robot48’e bağlı bir kol (yani OctoArm) da geliştirilmiştir. Biyomedikal araştırmalarda ahtapotların birçok türü kullanılır, örneğin Ahtapot vulgaris, Ahtapot sinensis, Ahtapot variabilis ve Ahtapot bimaküloidleri (O. bimaküloidler); O. vulgaris ve O. bimaculoides en yaygın 34,49,50’dir. Farklı ahtapot genomlarının son dizilimi bu cinsi özel olarak ilgi çekici kılmaktadır ve ahtapot araştırmalarında yeni sınırlar açmaktadır34,43,51,52.

Kurulumumuzda kullanılan bimaküloidler, ilk olarak 1949’da keşfedilen ve Orta Kaliforniya’dan Baja California yarımadasının güneyine kadar Kuzeydoğu Pasifik kıyılarındaki sığ sularda bulunabilen orta büyüklükte bir ahtapot türüdür17. Gözlerinin altındaki mantındaki sahte göz lekeleri tarafından tanınabilir. Dev Pasifik Ahtapotu (Enteroctopus dofleini) ve Common Octopus (O. vulgaris) ile karşılaştırıldığında, Kaliforniya İki Noktalı Ahtapot (O. bimaküloidler) nispeten küçüktür, birkaç santimetreden daha küçük başlar ve bir çocuk olarak hızlı büyür. Bir laboratuvarda yükseltildiğinde, yetişkin mantle boyutu ortalama 100 cm’ye kadar büyüyebilir ve 800 g53,54 ağırlığa kadar çıkabilir. Ahtapotlar ilk 200 gün içinde hızlı bir büyüme dönemine sahiptir; O zamana kadar yetişkin olarak kabul edilirler ve hayatlarının geri kalanında büyümeye devam ederler55,56,57. Ahtapotlar yamyam olabilir, özellikle her iki cinsiyet de bir tank içinde bir araya geldiğinde; bu nedenle, ayrı tanklarda ayrı ayrı barındırılmaları gerekir58.

Protocol

Tüm hayvan çalışmaları Michigan Eyalet Üniversitesi Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi (IACUC) tarafından onaylandı. 1. Ahtapot tank ekipmanı kurulumu İlk olarak, Malzeme Tablosunda gösterildiği gibi, deniz çevre sistemine dahil edilecek bir akvaryum için biyolojik olmayan tüm malzemeleri elde edin. Boyutlar inç olarak sağlanır. Kurulumdan önce tüm boru, boru ve filtre sistemi parçalarını etanol ve deiyonize (DI) su ile …

Representative Results

Çalışmalarımızdaki tüm hayvanlar vahşi doğadan elde edildi ve bu nedenle tam yaşları belirlenemedi ve laboratuvarda kalmaları değişkendi. Ahtapot durumu her gün gözlendi. Parazitler, bakteriler, cilt hasarı veya anormal davranışlar görmedik. Hayvanların ortalama ağırlığı 170.38 +/- 77.25 g idi. Her hayvan kendi 40 galonluk tanklarında yaşıyordu. Bir hafta boyunca bir tank için kaydedilen parametreler için ortalama ± standart sapma şunlardı: pH 8.4 ± 0.0, tuzluluk 34.06 ± 0.61 ppt, sıca…

Discussion

Sistem Kurulumu:
Akvaryum ekosistemi, suyu filtrelemek ve oksijenleştirmek için hem mekanik hem de biyolojik yöntemlerin uygulandığı şekilde geliştirilmiştir. Sistemin filtreleme elemanları, azot ve oksijen seviyelerini korumak için çorap filtreleri, protein sıyırıcıları ve düzenli temizlik kullanır. Daha da önemlisi, tehlikeli azotlu bileşikleri ve diğer biyolojik atıkları tüketmek ve fotosentez işlemleriyle suyu havalamak için deniz mikroorganizmalarına da güveniyoruz. E…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Bu çalışma NIH UF1NS115817 (G.P.) tarafından desteklendi. G.P., NIH’nin R01NS072171 ve R01NS098231 hibeleri tarafından kısmen desteklenmektedir. Emit Imaging’den Patrick Zakrzewki ve Mohammed Farhoud’a Xerra Görüntüleme Platformu’ndaki verilerin toplanması ve görselleştirilmesindeki yardım ve destekleri için teşekkür ederiz. MSU’nun Bruker Biospin ile bir araştırma anlaşması var.

Materials

1-3/4 in. Drill Bit Home Depot 204074205 Glass cutting tool
Part number:1
1" flow sensors Neptune Systems Local Dealer Pipe with sensor to measure water flow
Part number:2
1" Slip Bulkhead Strainer Bulk Reef Supply 207113 Strainer for water leaving tank
Part number:3
10 gallon tank Pruss Pets Local Dealer Fiddler crab holding tank
Part number:4
4 inch X 12 inch 200 Micron Nylon Monofiliment Mesh Filter Sock w/ Plastic Ring AQUAMAXX UJ41171 Filter for large organic matter in sump
Part number:5
40 gallon aquarium Pruss Pets Local Dealer 4 Food aquarium tanks
Part number:6
60g poly tanks – rectangle Pruss Pets Local Dealer 2 Water Storage (salt and freshwater)
Part number:7
Active Aqua 1/10th HP Hydroponic or Aquarium Chiller 2018 Model WayWe 719574198463 For cooling water continuously
Part number:8
ALAZCO 2 Soft-Grip Handle Heavy-Duty Tile Grout Brush ALAZCO B06W2FT5V5 Tank Cleaning
Part number:9
Ammonia Testing Kit Aquarium Pharmaceuticals 33D For water testing
Part number:10
Apex system WiFi Neptune Systems Local Dealer System connection for off site monitoring
Part number:11
API Aquarium Test Kit Amazon B001EUE808 For water testing
Part number:12
API Copper Test Kit Amazon B0006JDWH8 For water testing
Part number:13
Aqua Ultraviolet Classic UV 25 Watt Series Units Aqua Ultraviolet A00028 For removing bacteria leaving sump system
Part number:14
AquaClear 50 Foam Filter Inserts, 3 pack Aquaclear A1394 Food Tank Carbon Filter Inserts
Part number:15
Aqueon QuietFlow LED PRO Aquarium Power Filter 30 Aqueon 100106082 Food tank filtering units
Part number:16
Auto Top Off Kit (ATK) (Each includes 1 FMM module, 2 optical sensors and 1 float) Neptune Systems Local Dealer For freshwater tank
Part number:17
Automatic top off from RODI (LLC) Neptune Systems Local Dealer From water storage to octopus tanks
Part number:18
Banded Trochus Snail LiveAquaria CN-112080 For algae bin
Part number:19
Chaetomorpha Algae, Aquacultured LiveAquaria BVJ-76354 For algae bin
Part number:20
Clams – Live, Hard Shell, Cherrystone, Wild, USA Dozen Fulton Fish Market N/A Live food
Part number:21
Classic Sea Salt Mix – Tropic Marin Bulk Reef Supply 211813 Salt for tank water
Part number:22
Clear Masterkleer Soft PVC Plastic Tubing, for Air and Water, 3/4" ID, 1" OD McMaster 5233K71 Cleaning tool
Part number:23
Continuum Aquablade-P Acrylic Safe Algae Scraper W/ Plastic Blade – 15 Inch Marine Depot 4C31001 Cleaning tool
Part number:24
Copper Testing Kit Aquarium Pharmaceuticals 65L For water testing
Part number:25
Curve Refugium CREE LED Aquarium Light Eshopps 6500K Algae bin light
Part number:26
Eheim 1262 return pumps EHEIM 1250219 Pump for storage tanks
Part number:27
Eshopps R-100 Refugium Sump GEN 3 Eshopps 15000 Sump system
Part number:28
Ethyl Alcohol, 200 Proof Sigma-Aldrich 64-17-5 Anesthesia
Part number:29
Extech DO600 ExStik II Dissolved Oxygen Meter Extech DO600 Oxygen measurment
Part number:30
Fiddler Crabs; live; dozen NORTHEAST BRINE SHRIMP N/A Live food
Part number:31
Filter Cartrages Aqueon 100106087 Food tank filters
Part number:32
Florida Crushed Coral Dry Sand – CaribSea Bulk Reef Supply 212959 Sedimate for bottom of tank
Part number:33
FMM module Neptune Systems Local Dealer Controller for apex system
Part number:34
Fritz-Zyme TurboStart 900 – Fritz Bulk Reef Supply 213036 Bacteria start
Part number:35
Hand Operated Drum Pump, Siphon, Basic Pump with Spout, For Container Type Bucket, Pail Granger 38Y789 Water Hand Pump
Part number:36
High pH Testing Kit Aquarium Pharmaceuticals 27 For water testing
Part number:37
Imagitarium Fine Mesh Net for Shrimp Petco 2580993 Shrimp and fish transfer net
Part number:38
Leak Detection Kit (LDK) – Includes FMM module plus 2 ALD sensors Neptune Systems Local Dealer Placed on floor to detect water
Part number:39
Lee`S Algae Scrubber Pad Jumbo – Glass Marine Depot LE12007 Cleaning tool
Part number:40
Live rocks Pruss Pets Local Dealer Habitat for octopus
Part number:41
Long Bottle Cleaning Brush 17" Extra Long Haomaomao B07FS7J7PN Tank Cleaning
Part number:42
Magnesium chloride Sigma-Aldrich M1028-100ML Euthanasia
Part number:43
Magnetic Probe Rack Neptune Systems Local Dealer For holding apex sensor probes
Part number:44
Marine Ghost Shrimp NORTHEAST BRINE SHRIMP N/A Live food
Part number:45
Marineland C-Series Canister Carbon Bags Filter Media, 2 count Chewy 98331 For elevated copper levels
Part number:46
Nitra-Zorb Bag Aquarium Pharmaceuticals AP2213 Absorbes nirtogen compounds
Part number:47
Nitrate Testing Kit Aquarium Pharmaceuticals LR1800 For water testing
Part number:48
Nitrite Testing Kit Aquarium Pharmaceuticals 26 For water testing
Part number:49
Pawfly 2 Inch Air Stones Cylinder 6 PCS Bubble Diffuser Airstones for Aquarium Fish Tank Pump Blue Amazon B076S56XWX Aierating water
Part number:50
Penn Plax Airline Tubing for Aquariums –Clear and Flexible Resists Kinking, 8 Feet Standard Amazon B0002563MM Tubing for connecting air pump to air stone
Part number:51
Plumbing with unions/valves plus 3/4" flex hose Pruss Pets Local Dealer Water transport
Part number:52
PM1 module Neptune Systems Local Dealer Power control module for apex
Part number:53
Protein skimmer Reef Octopus AC20284 Removes biowaste from system
Part number:54
PVC Apex Mounting board, grommets, wire mounts Neptune Systems Local Dealer Helps ensure organization for wires and tubing within system
Part number:55
PVC Regular Cement and 4-Ounce NSF Purple Primer Amazon Oatey – 30246 For connecting PVC pipes
Part number:56
RODI unit Neptune Systems Local Dealer RO Water
Part number:57
Salinity Probes HANNA probes HI98319 Measures salinity of water
Part number:58
Seachem Pristine Aquarium Treatment Sea Chem 1438 Provides bacteria that break down excess food, waste and detritus
Part number:59
Seachem Stability Fish Tank Stabilizer Sea Chem 116012607 Seachem Stability will rapidly and safely establish the aquarium biofilter in freshwater and marine systems
Part number:60
Set of lexan tops Pruss Pets Local Dealer Aquarium tank lids
Part number:61
Set of Various extended length aquabus cables Neptune Systems Local Dealer Cables for Apex system
Part number:62
SLSON Aquarium Algae Scraper Double Sided Sponge Brush Cleaner Long Handle Fish Tank Scrubber for Glass Aquariums Amazon B07DC2TZCJ Cleaning tool
Part number:63
Standard-Wall PVC Pipe Fitting for Water, 45 Degree Elbow Adapter, 3/4 Socket Female x 3/4 Socket Male McMaster 4880K189 PVC pipe
Part number:64
Standard-Wall PVC Pipe Fitting for Water, 90 Degree Elbow Adapter, 1 Socket Female x 1 Socket Male McMaster 4880K773 PVC pipe
Part number:65
Standard-Wall PVC Pipe Fitting for Water, Adapter, 1 Socket-Connect Female x 1 Barbed Male McMaster 4880K415 PVC pipe
Part number:66
Standard-Wall PVC Pipe Fitting for Water, Straight Reducer, 2 Socket Female x 3/4 Socket Female McMaster 4880K008 PVC pipe
Part number:67
Standard-Wall PVC Pipe Fitting for Water, Tee Connector, White, 1 Size Socket-Connect Female McMaster 4880K43 PVC pipe
Part number:68
Standard-Wall Unthreaded Rigid PVC Pipe for Water, 1 Pipe Size, 10 Feet Long McMaster 48925K13 PVC pipe
Part number:69
Standard-Wall Unthreaded Rigid PVC Pipe for Water, 3/4 Pipe Size, 5 Feet Long McMaster 48925K92 PVC pipe
Part number:70
Structural FRP Fiberglass Sheet, 48" Wide x 96" Long, 1/4" Thick McMaster 8537K15 Table top material
Part number:71
Structural FRP Fiberglass Square Tube, 10 Feet Long, 2" Wide x 2" High Outside, 1/8" Wall Thickness McMaster 8548K33 Structural table materal
Part number:72
Tank Sediment TopDawg Pet Supply 8479001207 Sediment for bottom of fiddler crab tank
Part number:73
Temperature probe Neptune Systems Local Dealer Temperature probe for tanks
Part number:74
Tetra TetraMarine Large Saltwater Flakes for all Marine Fish Amazon B00025K0US Fish, shrimp, and crab food
Part number:75
Tetra Whisper Aquarium Air Pump for 10 gallon Aquariums Petco 2335234 Air pump for smaller tanks
Part number:76
Thick-Wall Through-Wall Pipe Fitting, for Water, PVC Connector, 1 Socket-Connect Female McMaster 36895K843 PVC pipe
Part number:77
Vectra s2 pump Bulk Reef Supply 212141 Aquarium Pump
Part number:78
Water Pump TACKLIFE GHWP1A Pump for cleaning tanks
Part number:79
Wyze Cam v2 1080p HD Indoor WiFi Smart Home Camera with Night Vision Amazon B076H3SRXG DeepLabCut Recording
Part number:80

References

  1. Wet, J. R., Wood, K. V., DeLuca, M., Helinski, D. R., Subramani, S. Firefly luciferase gene: structure and expression in mammalian cells. Molecular and Cellular Biology. 7 (2), 725-737 (1987).
  2. Han, X., Boyden, E. S. Multiple-color optical activation, silencing, and desynchronization of neural activity, with single-spike temporal resolution. PLoS One. 2 (3), 299 (2007).
  3. Zhang, F., et al. Multimodal fast optical interrogation of neural circuitry. Nature. 446 (7136), 633-639 (2007).
  4. Li, N., et al. Optogenetic-guided cortical plasticity after nerve injury. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (21), 8838-8843 (2011).
  5. Airan, R. D., Li, N., Gilad, A. A., Pelled, G. Genetic tools to manipulate MRI contrast. NMR Biomedicine. 26 (7), 803-809 (2013).
  6. Cywiak, C., et al. Non-invasive neuromodulation using rTMS and the electromagnetic-perceptive gene (EPG) facilitates plasticity after nerve injury. Brain Stimulation. 13 (6), 1774-1783 (2020).
  7. Hwang, J., et al. Regulation of Electromagnetic Perceptive Gene Using Ferromagnetic Particles for the External Control of Calcium Ion Transport. Biomolecules. 10 (2), (2020).
  8. Lu, H., et al. Transcranial magnetic stimulation facilitates neurorehabilitation after pediatric traumatic brain injury. Scientific Reports. 5, 14769 (2015).
  9. Krishnan, V., et al. Wireless control of cellular function by activation of a novel protein responsive to electromagnetic fields. Bioscience Reports. 8 (1), 8764 (2018).
  10. Mitra, S., Barnaba, C., Schmidt, J., Pelled, G., Gilad, A. A. Functional characterization of an electromagnetic perceptive protein. bioRxiv. , 329946 (2020).
  11. Hunt, R. D., et al. Swimming direction of the glass catfish is responsive to magnetic stimulation. PLoS One. 16 (3), 0248141 (2021).
  12. Kandel, E. R., Krasne, F. B., Strumwasser, F., Truman, J. W. Cellular mechanisms in the selection and modulation of behavior. Neurosciences Research Program bulletin. 17, 521 (1979).
  13. Carew, T. J., Castellucci, V. F., Kandel, E. R. An analysis of dishabituation and sensitization of the gill-withdrawal reflex in Aplysia. International Journal of Neuroscience. 2 (2), 79-98 (1971).
  14. Kandel, E. R. The molecular biology of memory storage: a dialog between genes and synapses. Bioscience Reports. 21 (5), 565-611 (2001).
  15. Forsythe, J. W., Hanlon, R. T. Effect of temperature on laboratory growth, reproduction and life-span of octopus-bimaculoides. Marine Biology. 98 (3), 369-379 (1988).
  16. Forsythe, J. W., Hanlon, R. T. Behavior, body patterning and reproductive-biology of octopus-bimaculoides from California. Malacologia. 29 (1), 41-55 (1988).
  17. Pickford, B. M. The Octopus bimaculatus problem: A study in sibling species. Bulletin of the Bingham Oceanographic Collection. 12, 1-66 (1949).
  18. Sumbre, Y., Fiorito, G., Flash, T. Control of octopus arm extension by a peripheral motor program. Science. 293 (5536), 1845-1848 (2001).
  19. Gutfreund, Y., et al. Organization of octopus arm movements: a model system for studying the control of flexible arms. Journal of Neuroscience. 16 (22), 7297-7307 (1996).
  20. Gutfreund, Y., Matzner, H., Flash, T., Hochner, B. Patterns of motor activity in the isolated nerve cord of the octopus arm. The Biological Bulletin. 211 (3), 212-222 (2006).
  21. Hague, T., Florini, M., Andrews, P. L. R. Preliminary in vitro functional evidence for reflex responses to noxious stimuli in the arms of Octopus vulgaris. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology. 447, 100-105 (2013).
  22. Hochner, B., Brown, E. R., Langella, M., Shomrat, T., Fiorito, G. A learning and memory area in the octopus brain manifests a vertebrate-like long-term potentiation. Journal of Neurophysiology. 90 (5), 3547-3554 (2003).
  23. Hochner, B., Glanzman, D. L. Evolution of highly diverse forms of behavior in molluscs. Current Biology. 26 (20), 965-971 (2016).
  24. Hvorecny, L. M., et al. Octopuses (Octopus bimaculoides) and cuttlefishes (Sepia pharaonis, S. officinalis) can conditionally discriminate. Animal Cognition. 10 (4), 449-459 (2007).
  25. Kier, W. M., Stella, M. P. The arrangement and function of octopus arm musculature and connective tissue. Journal of Morphology. 268 (10), 831-843 (2007).
  26. Levy, G., Hochner, B. Embodied organization of octopus vulgaris morphology, vision, and locomotion. Frontiers in Physiology. 8, 164 (2017).
  27. Giorgio-Serchi, F., Arienti, A., Laschi, C. Underwater soft-bodied pulsed-jet thrusters: Actuator modeling and performance profiling. The International Journal of Robotics Research. 35 (11), 1308-1329 (2016).
  28. Han, S., Kim, T., Kim, D., Park, Y., Jo, S. Use of deep learning for characterization of microfluidic soft sensors. IEEE Robotics and Automation Letters. 3 (2), 873-880 (2018).
  29. Hanassy, S., Botvinnik, A., Flash, T., Hochner, B. Stereotypical reaching movements of the octopus involve both bend propagation and arm elongation. Bioinspiration and Biomimetics. 10 (3), 035001 (2015).
  30. Hochner, B., Shomrat, T., Fiorito, G. The octopus: a model for a comparative analysis of the evolution of learning and memory mechanisms. The Biological Bulletin. 210 (3), 308-317 (2006).
  31. Imperadore, P., Fiorito, G. Cephalopod tissue regeneration: consolidating over a century of knowledge. Frontiers in Physiology. 9, 593 (2018).
  32. Imperadore, P., et al. Nerve regeneration in the cephalopod mollusc Octopus vulgaris: label-free multiphoton microscopy as a tool for investigation. Journal of the Royal Society, Interface. 15 (141), 20170889 (2018).
  33. Levy, G., Flash, T., Hochner, B. Arm coordination in octopus crawling involves unique motor control strategies. Current Biology. 25 (9), 1195-1200 (2015).
  34. Li, F., et al. Chromosome-level genome assembly of the East Asian common octopus (Octopus sinensis) using PacBio sequencing and Hi-C technology. Molecular Ecology Resources. 20 (6), 1572-1582 (2020).
  35. Lopes, V. M., Rosa, R., Costa, P. R. Presence and persistence of the amnesic shellfish poisoning toxin, domoic acid, in octopus and cuttlefish brains. Marine Environmental Research. 133, 45-48 (2018).
  36. Mazzolai, B., Margheri, L., Dario, P., Laschi, C. Measurements of octopus arm elongation: Evidence of differences by body size and gender. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology. 447, 160-164 (2013).
  37. McMahan, W., et al. . Proceedings 2006 IEEE International Conference on Robotics and Automation, 2006. , 2336-2341 (2006).
  38. Meisel, D. V., Kuba, M., Byrne, R. A., Mather, J. The effect of predatory presence on the temporal organization of activity in Octopus vulgaris. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology. 447, 75-79 (2013).
  39. Nesher, N., Levy, G., Grasso, F. W., Hochner, B. Self-recognition mechanism between skin and suckers prevents octopus arms from interfering with each other. Current Biology. 24 (11), 1271-1275 (2014).
  40. Wells, M. J. . Octopus : Physiology and behaviour of an advanced invertebrate. , (1978).
  41. Young, J. Z. . The anatomy of the nervous system of Octopus vulgaris. , (1971).
  42. Zullo, L., Sumbre, G., Agnisola, C., Flash, T., Hochner, B. Nonsomatotopic organization of the higher motor centers in octopus. Current Biology. 19 (19), 1632-1636 (2009).
  43. Albertin, C. B., et al. The octopus genome and the evolution of cephalopod neural and morphological novelties. Nature. 524 (7564), 220-224 (2015).
  44. Albertin, C. B., Simakov, O. Cephalopod Biology: At the intersection between genomic and organismal novelties. Annual Review if Animal Biosciences. 8, 71-90 (2020).
  45. Baik, S., et al. A wet-tolerant adhesive patch inspired by protuberances in suction cups of octopi. Nature. 546 (7658), 396-400 (2017).
  46. Pikul, J. H., et al. Stretchable surfaces with programmable 3D texture morphing for synthetic camouflaging skins. Science. 358 (6360), 210 (2017).
  47. Wehner, M., et al. An integrated design and fabrication strategy for entirely soft, autonomous robots. Nature. 536 (7617), 451-455 (2016).
  48. McMahan, W., et al. Field trials and testing of the OctArm continuum manipulator. Proceedings 2006 IEEE International Conference on Robotics and Automation, 2006. ICRA. , 2336-2341 (2006).
  49. Hochner, B., Brown, E. R., Langella, M., Shomrat, T., Fiorito, G. A learning and memory area in the octopus brain manifests a vertebrate-like long-term potentiation. Journal of Neurophysiology. 90 (5), 3547-3554 (2003).
  50. Tapia-Vasquez, A. E., et al. Proteomic identification and physicochemical characterisation of paramyosin and collagen from octopus (Octopus vulgaris) and jumbo squid (Dosidicus gigas). International Journal of Food Science & Technology. 55 (10), 3246-3253 (2020).
  51. Kim, B. -. M., et al. The genome of common long-arm octopus Octopus minor. GigaScience. 7 (11), (2018).
  52. Zarrella, I., et al. The survey and reference assisted assembly of the Octopus vulgaris genome. Scientific data. 6 (1), 13 (2019).
  53. Forsythe, J. W., Hanlon, R. T. Effect of temperature on laboratory growth, reproduction and life span of Octopus bimaculoides. Marine Biology. 98 (3), 369-379 (1988).
  54. Stoskopf, M. K., Oppenheim, B. S. Anatomic features of Octopus bimaculoides and Octopus digueti. Journal of Zoo and Wildlife Medicine. 27 (1), 1-18 (1996).
  55. Ramos, J. E., et al. Body size, growth and life span: implications for the polewards range shift of Octopus tetricus in south-eastern Australia. PLoS One. 9 (8), 103480 (2014).
  56. Hanlon, R. T., Forsythe, J. W. Advances in the laboratory culture of octopuses for biomedical research. Lab Animal Science. 35 (1), 33-40 (1985).
  57. Moltschaniwskyj, N. A., Carter, C. G. Protein synthesis, degradation, and retention: mechanisms of indeterminate growth in cephalopods. Physiological and Biochemical Zoology. 83 (6), 997-1008 (2010).
  58. Fiorito, G., et al. Guidelines for the care and welfare of Cephalopods in Research -A consensus based on an initiative by CephRes, FELASA and the Boyd Group. Lab Animal. 49, 1-90 (2015).
  59. Valverde, J. C., Garcia, B. G. Suitable dissolved oxygen levels for common octopus (Octopus vulgaris cuvier, 1797) at different weights and temperatures: analysis of respiratory behaviour. Aquaculture. 244 (1-4), 303-314 (2005).
  60. Cardeilhac, P. T., Whitaker, B. R. Copper Treatments: Uses and Precautions. Veterinary Clinics of North America: Small Animal Practice. 18 (2), 435-448 (1988).
  61. Hodson, P. V., Borgman, U., Shear, H. Toxicity of copper to aquatic biota. Copper in the Environment. (2), 307-372 (1979).
  62. Poole, B. M. Techniques for the culture of ghost shrimp (palaemonetes pugio). Environmental Toxicology and Chemistry. 7 (12), 989-995 (1988).
  63. Burggren, W. W. Respiration and circulation in land crabs: novel variations on the marine design. American Zoologist. 32 (3), 417-427 (1992).
  64. Reitsma, J., Murphy, D. C., Archer, A. F., York, R. H. Nitrogen extraction potential of wild and cultured bivalves harvested from nearshore waters of Cape Cod, USA. Marine Pollution Bulletin. 116 (1), 175-181 (2017).
  65. Messenger, J. B. Cephalopod chromatophores: neurobiology and natural history. Biological Reviews. 76 (4), 473-528 (2001).
  66. Morgan Holst, M. M., Miller-Morgan, T. The Use of a species-specific health and welfare assessment tool for the giant pacific octopus, enteroctopus dofleini. Journal of Applied Animal Welfare Science. 24 (3), 272-291 (2021).
  67. Rosas, C., et al. Energy balance of Octopus maya fed crab or an artificial diet. Marine Biology. 152 (2), 371-381 (2007).
  68. Anderson, R. C., Wood, J. B., Byrne, R. A. Octopus Senescence: The Beginning of the end. Journal of Applied Animal Welfare Science. 5 (4), 275-283 (2002).
  69. Butler-Struben, H. M., Brophy, S. M., Johnson, N. A., Crook, R. J. In vivo recording of neural and behavioral correlates of anesthesia induction, reversal, and euthanasia in cephalopod molluscs. Frontiers in Physiology. 9, 109 (2018).
  70. Jiang, X., et al. Octopus visual system: A functional MRI model for detecting neuronal electric currents without a blood-oxygen-level-dependent confound. Magnetic Resonance in Medicine. 72 (5), 1311-1319 (2014).
  71. Hennig, J., Nauerth, A., Friedburg, H. RARE imaging: a fast imaging method for clinical MR. Magnetic Resonance in Medicine. 3 (6), 823-833 (1986).
  72. Brant-Zawadzki, M., Gillan, G. D., Nitz, W. R. MP RAGE: a three-dimensional, T1-weighted, gradient-echo sequence–initial experience in the brain. Radiology. 182 (3), 769-775 (1992).
  73. Bertapelle, C., Polese, G., Di Cosmo, A. Enriched environment increases PCNA and PARP1 Levels in Octopus vulgaris central nervous system: first evidence of adult neurogenesis in Lophotrochozoa. Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution. 328 (4), 347-359 (2017).
  74. Maselli, V., Polese, G., Soudy, A. -. S. A., Buglione, M., Cosmo, A. D. Cognitive stimulation induces differential gene expression in Octopus vulgaris: The key role of protocadherins. 生物学. 9, (2020).
check_url/cn/62705?article_type=t

Play Video

Cite This Article
VanBuren, T., Cywiak, C., Telgkamp, P., Mallett, C. L., Pelled, G. Establishing an Octopus Ecosystem for Biomedical and Bioengineering Research. J. Vis. Exp. (175), e62705, doi:10.3791/62705 (2021).

View Video