Summary

肝癌組織由来の微小細胞外小胞の濃縮法

Published: February 03, 2023
doi:

Summary

ここでは、最適化された差動超遠心法による肝癌組織由来の小さな細胞外小胞の濃縮について説明します。

Abstract

組織由来の小さな細胞外小胞(sEV)は、ソース細胞の機能状態と組織の間質空間の特性を反映することができます。これらのsEVの効率的な濃縮は、それらの生物学的機能の研究にとって重要な前提条件であり、臨床検出技術と治療キャリア技術の開発の鍵です。sEVは通常ひどく汚染されているため、組織から分離することは困難です。この研究は、肝癌組織から高品質のsEVを迅速に濃縮する方法を提供します。この方法には、消化酵素(コラゲナーゼDおよびDNase Ι)と組織とのインキュベーション、70 μmセルストレーナーによるろ過、差動超遠心分離、および0.22 μmメンブレンフィルターによるろ過の4段階のプロセスが含まれます。差動超遠心分離ステップの最適化とろ過ステップの追加により、この方法で得られるsEVの純度は、従来の示差超遠心分離によって達成されるものよりも高くなります。これは、組織由来sEVの研究のための重要な方法論と裏付けとなるデータを提供します。

Introduction

小さな細胞外小胞(sEV)は、直径が約30 nmから150 nmで、さまざまな細胞から分泌されます1。それらは組織細胞と通信し、脂質、タンパク質、DNA、RNAなどの重要な生体分子をさまざまな臓器、組織、細胞、および細胞内部分に輸送することにより、局所または遠隔の微小環境を調節することができます。したがって、それらはまた、受信者セル23の挙動を変えることができる。特定のsEVの単離と精製は、病気の発症および経過中の生物学的挙動を研究するための不可欠な前提条件です。ゴールドスタンダードと見なされている差動超遠心分離は、sEVを通常存在する組織から分離するために一般的に使用されます4。組織破片、細胞破片、大きな小胞、およびアポトーシス小体は、sEVのみを残してこの技術によって除去することができます。

コラゲナーゼDおよびDNaseIは、細胞または小胞の分子特性に影響を及ぼさないことが示されており、両方の酵素の特性が細胞外マトリックス5における小胞の放出に寄与する。これらの酵素は、ヒト転移性黒色腫組織、結腸癌組織、および結腸粘膜組織からsEVを抽出するために使用されています567。しかし、これらの方法におけるコラゲナーゼDとDNase Iの濃度と消化時間は異なり、一貫性のない結論につながります。他のサブタイプのsEVの共沈を避けるために、研究者はろ過および/または示差遠心分離によってより大きな細胞外小胞(直径0.1 μmまたは0.2 μm)を除去しました8。ソース組織に応じて、単離および精製の異なる方法が必要とされる場合がある910

従来の差動超遠心分離法を使用して肝臓組織からsEVを抽出すると、上清の表面に白質の層が形成され、その特性を決定する方法はありません。以前の研究11では、この白質の層がsEVの純度に影響を与えることがわかりました。従来の方法で分離されたサンプルの粒子数とタンパク質濃度は現在の方法よりも高かったが、多くの汚染物質が結果の再現性を低下させる可能性があるため、変動係数は大きかった。すなわち、洗剤を用いて(すなわち、1%Triton X-100中の粒子の溶解度を検出する)と、この方法で得られたsEVの純度が高いことを見出した。そこで、この方法を用いて大腸がん組織由来のsEVを単離・精製し、プロテオミクス研究を行っています。

現在、肝臓がんにおけるsEVの研究は、主に血清、血漿、および細胞培養の上清に焦点を当てています12,13,14。しかし、肝臓がん組織由来のsEVは、肝臓がんの生理学的病理と周囲の微小環境をより正確に反映し、他のEVの劣化や汚染を効果的に回避することができます15,16。示差超遠心法を使用することで、この方法は収量を豊かにし、高品質のsEVを得ることができ、肝臓がんのさらなる研究のための重要な基礎を提供します。この方法により、肝癌組織を鋭利な分離により分離し、コラゲナーゼDおよびDNaseIによって解離させることができます。次いで、細胞破片、大きな小胞、およびアポトーシス小体は、濾過および示差超遠心分離によってさらに除去される。最後に、sEVは後の研究のために分離および精製されます。

Protocol

ヒト肝癌組織は、甘南医科大学第一附属病院で肝悪性腫瘍と診断された患者から採取されました。すべての患者がインフォームドコンセントフォームに署名し、ヒト組織サンプルの収集は甘南医科大学第一付属病院の倫理委員会によって承認されました。このプロトコルで使用されるすべての材料、機器、およびソフトウェアに関連する詳細については、 材料の表 を参照してく…

Representative Results

ヒト肝がん組織由来のsEVは、肝臓がん患者の診断、治療、予後において重要な役割を果たしてきました。この方法では、一般的な実験機器を使用して、肝臓がん組織に由来するsEVを分離および精製しました。これは、sEVの研究に方法論的サポートを提供する可能性があります。図2は、肝がん組織からsEVを濃縮する一般的なプロセスを示しています。組織の細胞間空間に…

Discussion

このプロトコルは、肝臓癌組織からsEVを抽出するための再現性のある方法について説明しています。高品質のsEVは、鋭い組織分離、消化酵素による処理、差動超遠心分離、および0.22μmフィルター膜ろ過および精製によって得られます。ダウンストリーム分析では、sEVの高純度を確保することが非常に重要です。差動遠心分離の過程で、上清の表面に白い物質(未知の組成)の層が現れます。こ?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

著者らは、この研究を支援してくれた甘南医科大学第一付属病院に感謝します。この研究は、中国国家自然科学財団(助成金番号82260422)の支援を受けました。

Materials

0.22 µm Membrane Filter Unit Millex SLGPR33RB
1 mL Sterile syringe Hubei Xianming Medical Instrument Company YL01329
2% Uranyl Acetate Electron Microscopy Sciences 22400-2
4.7 mL Centrifuge Tube Beckman Coulter 361621
6-well Cell cuture plate LABSELECT 11110
50 mL Beaker Tianjin Kangyiheng Experimental Instrument Sales Company CF2100800
70 µm Cell strainer Biosharp BS-70-XBS
100 mm Cell culture dish CELL TER CS016-0128
600 µL Centrifuge tube Axygen MCT060C
BCA protein quantification kit Thermo Fisher RJ240544
Beckman Coulter Optima-Max-TL Beckman  A95761
BioRad Mini trans-blot Bio-Rad 1703930
BioRad Mini-Protean Bio-Rad 1645050
CD63 Antibody Abcam ab134045
CD9 Antibody Abcam ab263019
Centrifuge 5430R Eppendorf 5428HQ527333
Cleaning Solution NanoFCM C1801
Collagenase D Roche 11088866001
Copper net Henan Zhongjingkeyi Technology Company DJZCM-15-N1
Dry Thermostat Hangzhou allsheng instruments company AS-01030-00
FITC Anti Human CD9 Antibody Elabscience E-AB-F1086C
Glycine Solarbio G8200
Goat horseradish peroxidase (HRP)-coupled secondary anti-mouse antibody  Proteintech SA00001-1
Goat horseradish peroxidase (HRP)-coupled secondary anti-rabbit antibody  Proteintech SA00001-2
Methanol Shanghai Zhenxing Chemical Company
Nanoparticle flow cytometer NanoFCM INC FNAN30E20112368
Phosphatase inhibitors(PhosSTOP) Roche 4906845001
Phosphate Buffered Saline(PBS) Servicebio G4202
Polyvinylidene Difluoride Membrane Solarbio ISEQ00010
QC Beads NanoFCM QS2502
RPMI-1640 basic medium Biological Industries  C11875500BT
Scalpel Guangzhou Kehua Trading Company NN-0623-1
Silica Nanospheres NanoFCM S16M-Exo
Transference Decoloring Shaker TS-8 Kylin-Bell E0018
Transmission Electron Microscope Thermo Scientific Talos L120C
Tris Solarbio T8060
TSG101 Antibody Proteintech 28283-1-AP
Tweezer Guangzhou Lige Technology Company LG01-105-4X

References

  1. Isaac, R., Reis, F. C. G., Ying, W., Olefsky, J. M. Exosomes as mediators of intercellular crosstalk in metabolism. Cell Metabolism. 33 (9), 1744-1762 (2021).
  2. Hou, R., et al. Advances in exosome isolation methods and their applications in proteomic analysis of biological samples. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 411 (21), 5351-5361 (2019).
  3. Zhang, L., Yu, D. Exosomes in cancer development, metastasis, and immunity. Biochimica et Biophysica Acta – Reviews on Cancer. 1871 (2), 455-468 (2019).
  4. Yang, D., et al. and perspective on exosome isolation – Efforts for efficient exosome-based theranostics. Theranostics. 10 (8), 3684-3707 (2020).
  5. Crescitelli, R., Lässer, C., Lötvall, J. Isolation and characterization of extracellular vesicle subpopulations from tissues. Nature Protocols. 16 (3), 1548-1580 (2021).
  6. Crescitelli, R., et al. Subpopulations of extracellular vesicles from human metastatic melanoma tissue identified by quantitative proteomics after optimized isolation. Journal of Extracellular Vesicles. 9 (1), 1722433 (2020).
  7. Jang, S. C., et al. Mitochondrial protein enriched extracellular vesicles discovered in human melanoma tissues can be detected in patient plasma. Journal of Extracellular Vesicles. 8 (1), 1635420 (2019).
  8. Muralidharan-Chari, V., et al. ARF6-regulated shedding of tumor cell-derived plasma membrane microvesicles. Current Biology. 19 (22), 1875-1885 (2009).
  9. Matejovič, A., Wakao, S., Kitada, M., Kushida, Y., Dezawa, M. Comparison of separation methods for tissue-derived extracellular vesicles in the liver, heart, and skeletal muscle. FEBS Open Bio. 11 (2), 482-493 (2021).
  10. Zhou, X., et al. Brown adipose tissue-derived exosomes mitigate the metabolic syndrome in high fat diet mice. Theranostics. 10 (18), 8197-8210 (2020).
  11. Chen, J., et al. Comparison of the variability of small extracellular vesicles derived from human liver cancer tissues and cultured from the tissue explants based on a simple enrichment method. Stem Cell Reviews and Reports. 18 (3), 1067-1077 (2022).
  12. Fang, T., et al. Tumor-derived exosomal miR-1247-3p induces cancer-associated fibroblast activation to foster lung metastasis of liver cancer. Nature Communications. 9 (1), 1247-1243 (2018).
  13. Huang, X., et al. RNA sequencing of plasma exosomes revealed novel functional long noncoding RNAs in hepatocellular carcinoma. Cancer Science. 111 (9), 3338-3349 (2020).
  14. Chen, L., et al. HCC-derived exosomes elicit HCC progression and recurrence by epithelial-mesenchymal transition through MAPK/ERK signalling pathway. Cell Death & Disease. 9 (5), 513 (2018).
  15. Jingushi, K., et al. Extracellular vesicles isolated from human renal cell carcinoma tissues disrupt vascular endothelial cell morphology via azurocidin. International Journal of Cancer. 142 (3), 607-617 (2018).
  16. Camino, T., et al. Deciphering adipose tissue extracellular vesicles protein cargo and its role in obesity. International Journal of Molecular Sciences. 21 (24), 9366 (2020).

Play Video

Cite This Article
Wang, X., Chen, J., Li, Z., Huang, D., Yi, X., Wu, J., Zhong, T. An Enrichment Method for Small Extracellular Vesicles Derived from Liver Cancer Tissue. J. Vis. Exp. (192), e64499, doi:10.3791/64499 (2023).

View Video