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Percorso di conferma metaboliche e scoperta attraverso 13 C-etichettatura dei proteinogenici Aminoacidi
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JoVE 杂志 生物学
Metabolic Pathway Confirmation and Discovery Through 13C-labeling of Proteinogenic Amino Acids
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Percorso di conferma metaboliche e scoperta attraverso 13 C-etichettatura dei proteinogenici Aminoacidi

DOI:
10.3791/3583-v

•

07:26 min

•

January 26, 2012

•

, , , , ,
1Department of Energy, Environmental and Chemical Engineering,Washington University, 2Department of Biology,Washington University, 3Department of Energy, Environmental and Chemical Engineering and Department of Biology,Washington University

Chapters

  • 00:05Title
  • 01:16Cell Culture
  • 01:40Amino Acid Extraction
  • 02:46Amino Acid Derivatization and GC-MS Conditions
  • 04:07GC-MS Data Analysis
  • 05:41Representative GC-MS Analysis
  • 07:06Conclusion

Summary

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13 C-isotopo etichettatura è una tecnica utile per determinare il metabolismo cellula centrale per vari tipi di microrganismi. Dopo che le cellule sono state coltivate con un substrato specifico etichettato, GC-MS di misurazione in grado di rivelare vie metaboliche funzionali basati su modelli di etichettatura unico nel proteinogenici aminoacidi.

Tags

Metabolic Pathway ConfirmationMetabolic Pathway Discovery13C LabelingProteinogenic Amino Acids生物化学Functional Genomics13C-assisted Metabolism AnalysisIsotopic LabelingAtom Transition PathsBiochemical NetworkTranscriptomicsProteomicsIsotopomer-assisted Analysis Of Metabolic PathwaysLabeled SubstratesMinimal MediumCarbon SourceMeasurement NoisesNon-labeled CarbonNutrient SupplementsLabeled Substrate ChoiceReaction StereochemistryIntermediate ProductsSingly Labeled Carbon SubstratesUniformly Labeled SubstratesAmino Acid Labeling PatternsGC-MS

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