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マウス卵巣エピゲノムとトランスクリプトームの細胞特異的ペアインプロゲーション

JoVE 杂志
生物学

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JoVE 杂志生物学

Cell-Specific Paired Interrogation of the Mouse Ovarian Epigenome and Transcriptome

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マウス卵巣エピゲノムとトランスクリプトームの細胞特異的ペアインプロゲーション

DOI:

10.3791/64765-v

•

12:25 min

•

February 24, 2023

•

Sarah R. Ocañas*^1,2,3, José V. V. Isola*^1,3, Tatiana D. Saccon, Kevin D. Pham, Ana J. Chucair-Elliott, Augusto Schneider, Willard M. Freeman³, Michael B. Stout³

¹Aging and Metabolism Research Program,Oklahoma Medical Research Foundation, ²Genes & Human Disease Research Program,Oklahoma Medical Research Foundation, ³Oklahoma City Veterans Affairs Medical Center, ⁴Nutrition College,Federal University of Pelotas

Chapters

00:04Introduction
01:16Creation of the Nuclei Suspension
04:03Isolation of Nuclei Tagged in Specific Cell Types (INTACT)
06:02Performing Translating Ribosome Affinity Purification (TRAP)
10:02Results: Validation of Cyp17-NuTRAP Mouse Model
11:26Conclusion

Summary

自动翻译

このプロトコルでは、翻訳リボソームアフィニティー精製(TRAP)法と特定の細胞タイプでタグ付けされた核の単離(INTACT)法が、Cyp17a1-Creマウス系統に交配されたNuTRAPマウスモデルを使用して、細胞特異的卵巣トランスクリプトームとエピゲノムのペアインプロゲーション用に最適化されました。

Tags

Cell-specific Ovarian Epigenome Ovarian Transcriptome Cell Isolation Cell Type-specific Cre Driver Nuclei Isolation Cell Sorting Paired Analysis Ovarian Aging Female Infertility

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