We presenteren een gestandaardiseerd protocol voor de kwantificering van T2* relaxatietijden van tumoren met behulp van externe software. Multi-echo gradiënt echobeelden worden verkregen en ingevoerd in de software om tumor T2 * kaarten te maken en tumor T2 * relaxatietijden te meten.
T2* relaxometrie is een van de gevestigde methoden om het effect van superparamagnetische ijzeroxide nanodeeltjes op tumorweefsels te meten met magnetische resonantie beeldvorming (MRI). IJzeroxide nanodeeltjes verkorten de T1, T2 en T2* relaxatietijden van tumoren. Hoewel het T1-effect variabel is op basis van de grootte en samenstelling van de nanodeeltjes, zijn de T2- en T2 * -effecten meestal overheersend en zijn T2 * -metingen het meest tijdsefficiënt in een klinische context. Hier presenteren we onze aanpak voor het meten van tumor T2 * ontspanningstijden, met behulp van multi-echo gradiënt echosequenties, externe software en een gestandaardiseerd protocol voor het maken van een T2 * kaart met scanner-onafhankelijke software. Dit vergemakkelijkt de vergelijking van beeldvormingsgegevens van verschillende klinische scanners, verschillende leveranciers en coklinisch onderzoekswerk (d.w.z. tumor T2 * -gegevens verkregen in muismodellen en patiënten). Zodra de software is geïnstalleerd, moet de T2 Fit Map-plug-in worden geïnstalleerd vanuit de plug-inmanager. Dit protocol biedt stapsgewijze procedurele details, van het importeren van de multi-echo gradiënt echosequenties in de software, tot het maken van kleurgecodeerde T2 * -kaarten en het meten van tumor T2 * ontspanningstijden. Het protocol kan worden toegepast op solide tumoren in elk lichaamsdeel en is gevalideerd op basis van preklinische beeldvormingsgegevens en klinische gegevens bij patiënten. Dit kan tumor T2* metingen voor multi-center klinische studies vergemakkelijken en de standaardisatie en reproduceerbaarheid van tumor T2* metingen in coklinische en multi-center data-analyses verbeteren.
Niet-invasieve kwantificering van tumor T2* relaxatietijden in verschillende weefsels van het lichaam met magnetische resonantie beeldvorming (MRI) is algemeen vastgesteld1. De reden voor dit artikel is om een protocol te bieden voor het meten van tumor T2 * relaxatietijden die onafhankelijk is van scannersoftware zoals Osirix2. Dit maakt uniforme analyses van beeldgegevens van verschillende centra, verschillende scanners en verschillende leveranciers mogelijk. Inderdaad, duizenden gebruikers zouden mogelijk dezelfde aanpak kunnen gebruiken, waardoor de standaardisatie van tumor T2 * -metingen wordt verhoogd. T2*-metingen worden voor verschillende doeleinden gebruikt door onder andere neuroradiologen, deskundigen op het gebied van cardiale beeldvorming en deskundigen op het gebied van beeldvorming van de buik. MRI-pulssequenties voor metingen van weefsel T2* relaxatietijden zijn toegepast en geoptimaliseerd voor de beoordeling van onder andere intracraniële bloedingen3, leverijzergehalte1,4 en hartijzergehalte 5,6. Andere onderzoekers hebben T2*-metingen gebruikt om kwantitatieve schattingen te genereren van ophopingen van ijzeroxide-nanodeeltjes in kwaadaardige tumoren 7,8. Veel van deze eerdere benaderingen maakten echter gebruik van institutionele software of specifieke scannersoftware, die beperkt zou zijn tot gebruik bij een specifieke instelling of voor het verwerken van gegevens die op een specifieke scanner zijn verkregen. Hier beschrijven we een universeel toepasbare benadering voor het genereren van tumor T2 * -kaarten en tumor T2 * -relaxatietijden op basis van preklinische of klinische MRI-gegevens van elke scanner die multi-echo gradiënt echobeelden kan genereren. De vereiste gradiëntechosequentie moet zeer korte eerste echotijden hebben en een nauwe inter-echoafstandvan 9,10. De multi-echo gradiënt echobeelden worden vervolgens ingevoerd in de externe software, tumor T2* kaarten worden berekend en tumor T2* relaxatietijden worden gemeten. De T2 Fit Map plugin in de T2* vervalcurven van de externe modellen als een monoexponentiële fit op S(t) = Soe-t/T2* 11 waarbij S(t) de signaal- of proceswaarde op een bepaald tijdstip t vertegenwoordigt; S 0 is de beginwaarde van het signaal of proces op t =0; t geeft tijd aan; T2*, ook bekend als de schijnbare transversale relaxatietijd, karakteriseert de vervalsnelheid van het signaal of proces; en e is de basis van de natuurlijke logaritme (ongeveer gelijk aan 2,71828). De vergelijking beschrijft een exponentieel verval, waarbij het signaal of proces in de loop van de tijd afneemt als functie van de vervalsnelheid T2*. Hoe groter de waarde van T2*, hoe langzamer de vervalsnelheid en vice versa. Dezelfde software kan ook worden gebruikt om multi-echo spin echobeelden in te voeren en tumor T2-waarden te genereren door de T2-vervalcurve aan te passen aan S (t) = So e-t / T2. De curve-aanpassing werd uitgevoerd met behulp van externe software, zonder een constante offset in te bouwen. Beide vervalcurven vertonen één exponentieel gedrag, waarbij T2* een kortere duur vertoont in vergelijking met T2.
Bij patiënten met hemosiderose en hemochromatose is de kwantificering van het leverijzergehalte door weefselbiopsie de gouden standaard, terwijl niet-invasieve MR-beeldvorming het zorgpunt is voor het vaststellen van basiswaarden en het monitoren van veranderingen in de loop van de tijdniet-invasief 12,13. Hoewel het genereren van T2*-kaarten voor leverijzerkwantificering goed isingeburgerd 4, is er geen gestandaardiseerd protocol om tumor-T2*-relaxatietijden te meten. Hoewel T2*-kaarten ook kunnen worden gegenereerd door scannersoftware, is deze beperkt tot een specifieke scanner en leverancier. Op het gebied van oncologie komen seriële beeldvormingsstudies van een bepaalde patiënt vaak voor op verschillende scanners en multicenter MRI-gegevens worden verkregen op basis van beeldvormingsstudies van verschillende scanners en verschillende leveranciers. Daarnaast wordt coklinisch beeldvormingsonderzoek steeds meer geïmplementeerd en vereist het de vergelijking van MRI-gegevens van patiënten en muismodellen die hun tumor simuleren. Het doel van dit protocol is om een protocol te bieden voor het meten van tumor T2* relaxatietijden die onafhankelijk zijn van de scannersoftware. Dit maakt een uniforme analyse van beeldgegevens van verschillende centra en verschillende scanners mogelijk. Inderdaad, duizenden gebruikers zouden mogelijk dezelfde aanpak kunnen gebruiken, waardoor de standaardisatie en reproduceerbaarheid van tumor T2 * -metingen wordt verhoogd. Ons protocol maakt gebruik van externe software, die kan worden gedownload van het internet. Multi-echo gradiënt echobeelden worden in de software ingevoerd en passen in een formule voor monoexponentieel verval om een T2* kaart te genereren, waarop tumor T2* relaxatietijden kunnen worden gemeten met behulp van operator-defined regions of interest (ROIs)5. IJzeroxide nanodeeltjes kunnen in verschillende doses worden toegediend 14, In onze studie kreeg de patiënt een Ferumoxytol-injectie (30 mg / ml) met 510 mg elementair ijzer in een volume van17 ml, in een dosering van 5 mg elementair ijzer per kg lichaamsgewicht. Vervolgens werden multi-echo gradiënt echosequenties verkregen15 met behulp van ingestelde sequentieparameters voor data-acquisitie.
Ons protocol stelt ons in staat om tumor T2 * relaxatietijden te meten op basis van multi-echo gradiënt-echo sequenties, een externe software en een plug-in voor het maken van T2 * kaarten. De kritieke stappen binnen het protocol zijn de opname van de multi-echo gradiënt-echo sequentie met zeer korte TSE’s in het scanprotocol, en de monoexponentiële pasvorm van de multi-echo gradiënt-echo beelden met behulp van externe software. Het is belangrijk om de input multi-echo gradient-echo beelden te rangschikken op basis v…
The authors have nothing to disclose.
Dit werk werd gedeeltelijk ondersteund door een subsidie van het National Cancer Institute, subsidienummer U24CA264298. We bedanken Dawn Holley, Kim Halbert en Mehdi Khalighi van het PET/MRI Metabolic Service Center voor hun hulp bij de aanschaf van PET/MRI-scans in het Lucas Research Center in Stanford. We bedanken de leden van het Daldrup-Link lab voor waardevolle input en discussies over dit project.
OsiriX | Pixmeo SARL | https://www.osirix-viewer.com/ | |
3T GE MR 750 | GE Healthcare, Chicago, IL | ||
FERAHEME (ferumoxytol injection) | AMAG Pharmaceuticals, Inc. 1100 Winter Street Waltham, MA 02451 |