This content is Free Access.
1Department of Neurobiology, F. M. Kirby Neurobiology Center,Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, 2Proteomic Mass Spectrometry,Wellcome Trust Sanger Institute, Wellcome Genome Campus, 3Centre for Molecular Informatics, Department of Chemistry,University of Cambridge, 4Functional Proteomics Group, Chester Beatty Laboratories,Institute of Cancer Research
Kapitel
- 00:05Titel
- 00:51Mapping of Peptides using PoGoGUI
- 02:36Visualizing in the Integrative Genomics Viewer
- 03:57Mapping Peptides Identified Through a Custom Variant Database to a Reference Genome
- 04:44Mapping Peptides from Multiple Files Using PoGoGUI
- 05:48Generating a Track Hub from Mapped Peptides and Visualizing a Track Hub in the UCSC Genome Browser
- 06:50Results: Post-translational Modification and Varient Enabled Mapping of Peptides to Genomes
- 08:21Conclusion
Здесь мы представляем средство proteogenomic PoGo и протоколы для быстрого, количественных, столб-поступательные изменения и вариант включено сопоставление пептидов, выявленных с помощью масс-спектрометрии на ссылку геномов. Этот инструмент имеет для интеграции и визуализации proteogenomic и личных протеомических исследований взаимодействия с данными ортогональных геномики.
