Journal
/
Biologie
/
Karakterisering van het Microbiome van de teek door Next-Generation 16S rRNA Amplicon sequentiebepaling
JoVE Journal
Biologie
Zum Anzeigen dieser Inhalte ist ein JoVE-Abonnement erforderlich.  Melden Sie sich an oder starten Sie Ihre kostenlose Testversion.
JoVE Journal Biologie
Tick Microbiome Characterization by Next-Generation 16S rRNA Amplicon Sequencing
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Karakterisering van het Microbiome van de teek door Next-Generation 16S rRNA Amplicon sequentiebepaling

DOI:
10.3791/58239-v

•

07:21 min

•

August 25, 2018

•

,
1Department of Biology,San Francisco State University

Kapitel

  • 00:04Titel
  • 00:44Tick Surface Sterilization, DNA Purification, and 16S rRNA Gene Amplification
  • 02:3016S Amplicon Purification
  • 03:59Sample Barcoding and Purification
  • 04:58Library Quantification and Normalization
  • 06:01Results: Community Ecology of the Ixodes Microbiome
  • 06:43Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Automatische Übersetzung

Hier presenteren we een volgende-generatie sequencing-protocol voor het 16S rRNA rangschikken waarmee identificatie en karakterisering van microbiële gemeenschappen binnen de vectoren. Deze methode houdt het DNA-extractie, versterking en barcoding van monsters door middel van PCR, rangschikking op een stroom-cel, en bio-informatica aan sequencedata tot fylogenetische informatie.

Tags

Keywords: Tick MicrobiomeNext-generation 16S RRNA Amplicon SequencingVector-borne Disease EcologyMicrobiome CharacterizationTick CollectionDNA ExtractionAmplicon PCRContamination ControlAmplification Bias

Article

Embed

ZUR WIEDERGABELISTE HINZUFÜGEN

Usage Statistics

Verwandte Videos

check_url/de/58239?article_type=v

Fluorescentie-microscopie Screening en next-generation sequencing: Handige hulpmiddelen voor de identificatie van genen betrokken bij organel Integriteit
check_url/de/58239?article_type=v

Next-generation sequencing van het 16S ribosomaal RNA Gene Amplicons
check_url/de/58239?article_type=v

Gerichte DNA methylatie analyse van next-generation sequencing
check_url/de/58239?article_type=v

Versterking, next-generation sequencing en Genomic DNA in kaart brengen van retrovirale integratie Sites
check_url/de/58239?article_type=v

Efficiënte Nucleic Acid Extraction en 16S rRNA Gene Sequencing voor Bacteriële Gemeenschap karakterisering
check_url/de/58239?article_type=v

Begeleide Protocol voor fecale microbiële karakterisering door 16S rRNA-Amplicon Sequencing
check_url/de/58239?article_type=v

Interactome-Seq: Een Protocol voor Domainome bibliotheek bouw, de validatie en de selectie door Phage Display en volgende generatie sequentiebepaling
check_url/de/58239?article_type=v

Microbiota-analyse met behulp van twee-stap PCR en de volgende generatie 16S rRNA Gensequencing
check_url/de/58239?article_type=v

Detectie van weefsel-Resident bacteriën in blaas biopsies door 16S rRNA fluorescentie in situ hybridisatie
check_url/de/58239?article_type=v

Een op magnetische kraal gebaseerd mosquito-DNA-extractieprotocol voor sequencing van de volgende generatie

Read Article