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RIBO-seq in Bacteria: a Sample Collection and Library Preparation Protocol for NGS Sequencing
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Biochemie
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JoVE Journal Biochemie
RIBO-seq in Bacteria: a Sample Collection and Library Preparation Protocol for NGS Sequencing
DOI:

12:05 min

August 07, 2021

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Kapitel

  • 00:00Introduciton
  • 00:54Cell Harvesting and Lysis
  • 04:13MNase Digestion and Size Selection of Samples for RIBO-seq
  • 06:17rRNA Depletion and Alkaline Fragmentation of Samples for RNA-seq
  • 07:07Library Preparation and Size Selection of cDNA Libraries
  • 08:49Results: Quality of cDNA Libraries and Reads
  • 11:31Conclusion

Summary

Automatische Übersetzung

Nous décrivons ici les étapes de la collecte d’échantillons et de la préparation pour RIBO-seq chez les bactéries. Le séquençage des bibliothèques préparées conformément à ces lignes directrices donne suffisamment de données pour une analyse bioinformatique complète. Le protocole que nous présentons est simple, utilise un équipement de laboratoire standard et prend sept jours de la lyse à l’obtention des bibliothèques.

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