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Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data
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Identificación de empalme alternativo y poliadenilación en datos de RNA-seq

DOI:
10.3791/62636-v

•

08:35 min

•

June 24, 2021

•

, , ,
1Department of Genome Sciences, The John Curtin School of Medical Research,The Australian National University, 2Department of Biology,New York University

Kapitel

  • 00:05Introduction
  • 00:51Alternative Splicing (AS) Analysis Using RNA-Seq
  • 06:02Results: Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-Seq Data
  • 07:46Conclusion

Summary

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El empalme alternativo (AS) y la poliadenilación alternativa (APA) amplían la diversidad de isoformas de transcripción y sus productos. Aquí, describimos protocolos bioinformáticos para analizar RNA-seq a granel y ensayos de secuenciación final 3' para detectar y visualizar AS y APA que varían según las condiciones experimentales.

Tags

Alternative SplicingPolyadenylationRNA-seqDifferential SplicingDifferential Exon ExpressionLimmaEdgeRVoomDiffSplice

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