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Applicazione della vermimetria a flusso per la quantificazione e l'analisi del microbioma intestinale di Caenorhabditis elegans
 
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Applicazione della vermimetria a flusso per la quantificazione e l'analisi del microbioma intestinale di Caenorhabditis elegans

Article DOI: 10.3791/64605-v • 08:38 min • March 31st, 2023
March 31st, 2023 •
*1, *1, 1,2, 1, 1,2
1Alkek Center for Metagenomics and Microbiome Research and Department of Molecular Virology and Microbiology, Baylor College of Medicine, 2Development, Disease Models and Therapeutics Program, Graduate School of Biomedical Sciences, Baylor College of Medicine
* These authors contributed equally

Kapitel

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Caenorhabditis elegans è un potente modello per esaminare i determinanti molecolari che guidano le interazioni ospite-microbioma. Presentiamo una pipeline ad alto rendimento che profila i livelli di colonizzazione del microbioma intestinale dei singoli animali insieme ad aspetti chiave della fisiologia di C. elegans.

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Biologia Numero 193 Analisi Microbioma intestinale di Caenorhabditis elegans Composizione Fisiologia dell'ospite Cambiamenti di composizione Relazioni funzionali Driver molecolari Interazioni ospite-microbioma Piano corporeo trasparente Microbi naturali con tag fluorescenti Livelli relativi di microbi Ordinatore di particelle di grandi dimensioni Configurazione sperimentale Raccolta Analisi Popolazioni di C. elegans Funzionamento e manutenzione del selezionatore Analisi statistiche Ottimizzazione delle impostazioni del selezionatore Strategie di gating efficaci Arricchimento delle popolazioni animali scalabilità per applicazioni ad alto rendimento
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