Summary

מיקרופלואידיקה דיגיטלי עבור עיבוד אוטומטי proteomic

Published: November 06, 2009
doi:

Summary

Digital מיקרופלואידיקה היא טכניקה מאופיין מניפולציה של טיפות בדידים (~ NL – מ"ל) על מערך של אלקטרודות על ידי יישום של שדות חשמליים. הוא מתאים היטב בביצוע מהיר, רציף, מבחני מיניאטורי ביוכימיים אוטומטיות. כאן אנו מדווחים פלטפורמה מסוגל מיכון כמה מדרגות עיבוד proteomic.

Abstract

Proteomics קלינית התפתחה כדיסציפלינה חדשה חשוב, המבטיח גילוי סמנים כי יהיה שימושי עבור אבחון מוקדם הפרוגנוזה של המחלה. בעוד שיטות proteomic קליניים להשתנות במידה רבה, מאפיין משותף הוא הצורך (i) מיצוי של חלבונים מן נוזלים הטרוגנית מאוד (כלומר, בסרום, דם מלא, וכו ') וכן (ii) עיבוד ביוכימיים מקיף לפני הניתוח. כאן, אנו דו"ח חדש דיגיטלי מיקרופלואידיקה (DMF) שיטה המבוססת שילוב מדרגות עיבוד מספר proteomics בשימוש קליני. זה כולל מיצוי חלבון, resolubilization, הפחתה, אלקילציה עיכול אנזימטי. Digital מיקרופלואידיקה היא טכניקה microscale נוזל הטיפול בהם טיפות nanoliter-microliter בגודל הם מניפולציה על משטח פתוח. טיפות ממוקמים על גבי מערך של אלקטרודות כי הם מצופים בשכבת דיאלקטרי – כאשר הפוטנציאל החשמלי מוחל על אגל, חיובים מצטברים משני צדי דיאלקטרי. האישומים לשמש מטפל אלקטרוסטטי שניתן להשתמש בהם כדי לשלוט בעמדה רביב, ועל ידי הטיית רצף של אלקטרודות בסדרה, טיפות ניתן לוותר, להזיז, למזג, לערבב, ולפצל על פני השטח. לכן, DMF הוא בכושר טבעי לביצוע מהיר, רציף רב שלבי, מיניאטורי מבחני ביוכימיים אוטומטיות. זה מייצג התקדמות משמעותית לעומת שיטות קונבנציונליות (בהסתמך על pipetting רובוטים או ידנית), ויש לו פוטנציאל להיות כלי חדש שימושי proteomics קליניים.

מאיס ג'Jebrail, ויויאן נ 'לוק, וסטיב CC שי תרמו באופן שווה על עבודה זו.

הכתובת הנוכחית סרג'יו LS של פריירה הוא באוניברסיטת למדעי בפילדלפיה הממוקם 600 דרום רחוב 43, פילדלפיה, פנסילבניה 19104.

Protocol

חלק 1: ייצור המכשיר זכוכית מצעים נקיים בפתרון Piranha (03:01 קונצרט כלשהו חומצה גופרתית:. חמצן 30%). השאירו את מצעים בפתרון Piranha דקות 10 בהתרגשות תכופים. לאחר שטיפה במים (DI) deionized וייבוש מצעים עם גז 2</s…

Discussion

חוסר טיפול מדגם עיבוד סטנדרטי ב proteomics היא מגבלה עיקרית עבור השדה. בנוסף, מדגם טיפול קונבנציונלי macroscale כרוך containers רבים והעברות פתרון, אשר יכול להוביל לאובדן מדגם וזיהום. פתרון אפשרי לבעיות אלו היא ליצור מערכות משולבות לעיבוד דיגיטלי מדגם להסתמך על מיקרופלואידיקה 1<…

Acknowledgements

אנו מודים למדעי הטבע וההנדסה המועצה למחקר (NSERC) והחברה הקנדית למלחמה בסרטן לתמיכה כספית. SCCS הודות NSERC ו VNL מודה בוגרת מלגת אונטריו (OGS) תוכנית מלגות לתארים מתקדמים. ARW מודה CRC עבור הקתדרה למחקר בקנדה.

Referencias

  1. Abdelgawad, M., Wheeler, A. R. The Digital Revolution: A New Paradigm for Microfluidics. Adv. Mat. 21, 920-925 (2009).
  2. Jebrail, M., Wheeler, A. R. A Digital Microfluidic Method for Protein Extraction by Precipitation. Anal. Chem. 81, 330-335 (2009).
  3. Luk, V. N., Wheeler, A. R. A Digital Microfluidic Approach to Proteomic Sample Processing. Anal. Chem. 81, 4524-4530 (2009).

Play Video

Citar este artículo
Jebrail, M. J., Luk, V. N., Shih, S. C. C., Fobel, R., Ng, A. H. C., Yang, H., Freire, S. L. S., Wheeler, A. R. Digital Microfluidics for Automated Proteomic Processing. J. Vis. Exp. (33), e1603, doi:10.3791/1603 (2009).

View Video