פרוטוקול זה מתאר הדמיה וניתוח פלואורסצנטי של קואנזימים מטבוליים אנדוגני, אדנין ניקוטינאמיד מופחת (פוספט) dinucleotide (NAD(P)H), ו flavin adenine dinucleotide מחומצן (FAD). הדמיה אוטופלואורסצנטית של NAD(P)H ו-FAD מספקת שיטה נטולת תוויות ולא הרסנית להערכת חילוף החומרים התאי.
חילוף החומרים התאי הוא התהליך שבו תאים מייצרים אנרגיה, ומחלות רבות, כולל סרטן, מאופיינות בחילוף חומרים חריג. ניקוטינאמיד אדנין מופחת (פוספט) דינוקלאוטיד (NAD(P)H) ופלובין אדנין דינוקלאוטיד מחומצן (FAD) הם קואנזימים של תגובות מטבוליות. NAD(P)H ו-FAD מציגים זרימה אוטומטית וניתן לבודד אותם באופן ספקטרלי על ידי אורכי גל של עירור ופליטה. שני הקואנזימים, NAD(P)H ו- FAD, יכולים להתקיים בתצורה חופשית או כרוכה בחלבון, שלכל אחד מהם פלואורסצנטיות ייחודית לכל החיים – הזמן שעבורו הפלואורופור נשאר במצב הנרגש. הדמיה לכל החיים של פלואורסצנטיות (FLIM) מאפשרת כימות של עוצמת הפלואורסצנטיות ואורך החיים של NAD(P)H ו- FAD לניתוח ללא תוויות של חילוף החומרים התאי. ניתן למטב את עוצמת הפלואורסצנטיות ואת המיקרוסקופים לכל החיים להדמיית NAD(P)H ו- FAD על-ידי בחירת אורכי הגל המתאימים של עירור ופליטה. הפרעות מטבוליות על ידי ציאניד לאמת פרוטוקולי הדמיה autofluorescence כדי לזהות שינויים מטבוליים בתוך תאים. מאמר זה ידגים את הטכניקה של הדמיית autofluorescence של NAD(P)H ו- FAD למדידת חילוף החומרים התאי.
חילוף החומרים הוא התהליך התאי של ייצור אנרגיה. חילוף החומרים התאי מקיף מסלולים מרובים, כולל גליקוליזה, זרחן חמצוני, גלוטמינוליזיס. תאים בריאים משתמשים במסלולים מטבוליים אלה כדי לייצר אנרגיה להתפשטות ולתפקוד, כגון ייצור ציטוקינים על ידי תאי מערכת החיסון. מחלות רבות, כולל הפרעות מטבוליות, סרטן, ניוון עצבי, מאופיינים בחילוף חומרים תאי שונה1. לדוגמה, כמה סוגי תאים סרטניים יש שיעורים גבוהים של גליקוליזה, אפילו בנוכחות חמצן, כדי ליצור מולקולות לסינתזה של חומצות גרעין, חלבונים, שומנים, שומנים2,3. תופעה זו, המכונה אפקט ורבורג, היא סימן היכר של סוגי סרטן רבים, כולל סרטן השד, סרטן ריאות, ו glioblastomas4. בגלל השינויים של חילוף החומרים התאי הקשורים עם התקדמות הסרטן, חילוף החומרים התאי יכול להיות סמן ביולוגי פונדקאי לתגובה תרופתית 5,6. יתר על כן, הבנת יעילות התרופה ברמה התאית היא חיונית כמו הטרוגניות התא יכול להוביל לתגובות סמים שונות אצל אנשים7,8.
טכנולוגיות המזהות ומכמתות שינויים בחילוף החומרים התאי חיוניות למחקרים של סרטן ותגובה לתרופות. ניתוחים כימיים וחלבון משמשים להערכת חילוף החומרים של תאים או רקמות אך חסרים רזולוציה של תא יחיד ומידע מרחבי. בדיקות המבוססות על קורא לוחות מטבוליים יכולות למדוד את צריכת החומציות והחמצן במדגם לאורך זמן ואת ההפרעה המטבולית הבאה על ידי כימיקלים. ניתן להשתמש ב- pH כדי לחשב את קצב החמצה חוץ-תאית (ECAR), המספק תובנה על הפעילות הגליקוליטית של התאים9. שיטות הדמיה לכל הגוף, כולל טומוגרפיה של פליטת פלואורו-D-גלוקוז פוזיטרונים (FDG PET) וספקטרוסקופיית תהודה מגנטית (MRS), הן שיטות הדמיה לא פולשניות המשמשות קלינית לזיהוי הישנות גידולים ויעילות התרופה באמצעות מדידות מטבוליות10,11,12,13,14.14.
FDG-PET מצלם את ספיגת הרקמות של FDG, אנלוגי גלוקוז עם תווית רדיו. ספיגה מוגברת של FDG-PET על ידי גידולים ביחס לרקמה שמסביב נובעת אפקט ורבורג12,13. MRS מדמה גרעינים נפוצים של מולקולות המשמשות לחילוף חומרים, כגון 13C ו– 31P, ויכולה לקבל מידע דינמי על האופן שבו חילוף החומרים משתנה בתגובה לגירויים, כגון פעילות גופנית או אכילה14. למרות FDG-PET ו- MRS ניתן להשתמש קלינית, טכנולוגיות אלה חסרות את הפתרון המרחבי כדי לפתור הטרוגניות תוךטומורלית. כמו כן, מדידות צריכת חמצן נעשות על אוכלוסייה בתפזורת של תאים. הדמיית Autofluorescence מתגברת על מכשול הרזולוציה המרחבית של טכנולוגיות אלה ומספקת שיטה לא פולשנית לכימות חילוף החומרים התאי.
איור 1: NADH ו-FAD במסלולים מטבוליים נפוצים. NADH ו-FAD הם קואנזימים המשמשים בגליקוליזה, מחזור קרבס ושרשרת הובלת האלקטרונים. הדמיה Autofluorescence של מולקולות אלה מספק מידע על חילוף החומרים הסלולר. לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
ניקוטינאמיד אדנין מופחת (פוספט) דינוקלאוטיד (NAD(P)H) ופלובין אדנין דינוקלאוטיד מחומצן (FAD) הם קואנזימים של תגובות מטבוליות, כולל גליקוליזה, זרחן חמצוני וגלוטמינוליזיס (איור 1). הן NAD(P)H והן FAD הם autofluorescent ומספקים ניגודיות אנדוגנית להדמיית פלואורסצנטיות1,15. ל- NADPH תכונות פלואורסצנטיות דומות ל- NADH. מסיבה זו, NAD(P)H משמש לעתים קרובות כדי לייצג את האות המשולב של NADH ו NADPH2,16.
הדמיה לכל החיים פלואורסצנטיות (FLIM) מכמתת את חיי הפלואורסצנטיות או את הזמן שעבורו פלואורופור נמצא במצב הנרגש. תקופות חיים פלואורסצנטיות מגיבות למיקרו-סביבה של הפלואורופורים ומספקות מידע על חילוף החומרים התאי17. NAD(P)H ו-FAD יכולים להתקיים בתוך תאים בקונפורמציות הקשורות לחלבון או בחינם, שלכל אחד מהם יש חיים שונים. ל-NAD(P)H החינמי יש אורך חיים קצר יותר מ-NAD(P)H הקשור לחלבון; לעומת זאת, ל-FAD בחינם יש חיים ארוכים יותר מ-FAD18,19 מאוגד. ניתן לכמת את אורך החיים ואת משקולות הרכיבים לכל החיים מנתוני ריקבון לכל החיים של פלואורסצנטיות באמצעות Eq. (1)20:
I(t) = α 1e-t/τ1 + α 2e-t/τ2 + C (1)
Eq (1) מייצג את עוצמת הפלואורסצנטיות המנורמלת כפונקציה של זמן. α 1 ו-α 2 במשוואה זו מייצגים את הרכיבים היחסיים של אורך חיים קצר וארוך (α 1+ α 2=1), בהתאמה, τ1 ו- τ2 מייצגים את אורך החיים הקצר והארוך, בהתאמה, ו- C מהווה אור רקע7,20. אורך החיים המשוקלל של משרעת, המיוצג כאן כ- τm, מחושב באמצעות Eq. (2).
τm= α 1τ1+ α 2τ2 (2)
חיים ממוצעים יכולים להיות מחושבים על ידי ממוצע “t” על דעיכה אינטנסיבית של פלואורופור, אשר עבור ריקבון דו-מעריכי מוצג על ידי Eq. (3)17,21.
τ*m= (α 1τ12+ α 2τ22)/ (α 1τ1+ α 2τ2) (3)
ניתן לחשב תמונה בעוצמה פלואורסצנטית מהתמונה לכל החיים על-ידי שילוב הריקבון של חיי הפלואורסצנטיות. הדמיה אוטופלואורסצנטית היא שיטה לא הרסנית ונטולת תוויות שניתן להשתמש בה כדי לאפיין את חילוף החומרים של תאים חיים ברזולוציה תת-תאית. יחס redox אופטי מספק מדד אנלוגי אופטי של מצב redox כימי של התא ומחושב כיחס של עוצמות NAD(P)H ו- FAD. למרות שהנוסחה לחישוב יחס ה-redox האופטי אינה מתוקננת22,23,24,25, היא מוגדרת כאן כעוצמת ה-FAD על פני העוצמות המשולבות של NAD(P)H ו-FAD. הגדרה זו משמשת מכיוון שהעוצמה המסוכמת במכנה מנרמלת את המדד בין 0 ל-1, והתוצאה הצפויה של עיכוב הציאניד היא ירידה ביחס ה- redox. חיי הפלואורסצנטיות של NAD(P)H ו-FAD בחינם מספקים תובנה לגבי שינויים במיקרו-סביבה הממסית המטבולית, כולל pH, טמפרטורה, קרבה לחמצן ואוסמולאריות17.
שינויים באורך הפלואורסצנטיות של השברים הכרוכים של NAD(P)H ו- FAD יכולים להצביע על ניצול מסלול מטבולי וחילוף חומרים ספציפי למצע26. ניתן לפרש משקולות רכיבים לשינויים בשבר החופשי עד הכרוך של קואנזים18,19. בסך הכל, מדדים כמותיים אלה של אורך החיים של autofluorescence מאפשרים ניתוח של חילוף החומרים התאי, והדמיה autofluorescence שימש לזיהוי neoplasms מרקמות נורמליות27,28, המאפיינים תאי גזע29,30, הערכת תפקוד תאי מערכת החיסון31,32,33,34,35, מודד פעילות נוירולוגית36, 37,38, והבנת יעילות התרופה בסוגי סרטן כגון סרטן השד וסרטן הראש והצוואר21,39,40,41,42. הדמיית תצפרחת אוטומטית ברזולוציה גבוהה ניתן לשלב עם פילוח תמונה לניתוח תא יחיד וכימות של הטרוגניות תוך-אוכלוסיות43,44,44,45,45,46,47.
ניתן לצלם את NAD(P)H ו- FAD במיקרוסקופים פלואורסצנטיים של פוטון יחיד או רב-פוטון המוגדרים לעוצמה או להדמיה לכל החיים. עבור מיקרוסקופים של פוטון יחיד, NAD(P)H ו- FAD מתרגשים בדרך כלל באורכי גל של 375-405 ננומטר ו- 488 ננומטר, בהתאמה, בשל מקורות לייזר נפוצים באורכי גל אלה48. בהתרגשות פלואורסצנטית דו-פוטונית, NAD(P)H ו-FAD ירגשו באורכי גל של כ-700 עד 750 ננומטר ו-700 עד 900 ננומטר, בהתאמה, 15,49. לאחר הפלורופורים מתרגשים, NAD(P)H ו- FAD פולטים פוטונים באורכי גל בין ~ 410 ננומטר ל ~ 490 ננומטר ו ~ 510 ננומטר ~ 640 ננומטר, בהתאמה. אורכי הגל של פליטת NAD(P)H ו-FAD maxa הם כ-450 ננומטר ו-535 ננומטר, בהתאמה, בהתאמה.
בגלל אורכי הגל השונים של עירור ופליטה, הפלואורסצנטיות של שני הקואנזימים המטבוליים יכולה להיות מבודדת באופן ספקטרלי. הבנה של המאפיינים הספקטרליים של NAD(P)H ו- FAD נחוצה לתכנון ואופטימיזציה של פרוטוקולי הדמיה autofluorescence. ציאניד הוא מעכב עירוי מורכב של שרשרת הובלת אלקטרונים (ETC). ההשפעות של ציאניד על חילוף החומרים התאי ואת עוצמות autofluorescence ואת אורך החיים של NAD(P)H ו FAD בתוך תאים מאופיינים היטב27,40. לכן, ניסוי הפרעת ציאניד הוא אמצעי יעיל לאימות פרוטוקולי הדמיה NAD(P)H ו- FAD. ניסוי ציאניד מוצלח מספק ביטחון כי פרוטוקול הדמיה NAD(P)H ו- FAD יכול לשמש כדי להעריך את חילוף החומרים של קבוצות לא ידועות או הפרעות.
עוצמת autofluorescence והדמיה לכל החיים היו בשימוש נרחב כדי להעריך את חילוף החומרים בתאים21,55. FLIM הוא ברזולוציה גבוהה ולכן פותר תאים בודדים, אשר חשוב עבור מחקרי סרטן כי הטרוגניות הסלולר תורם תוקפנות הגידול ועמידות לתרופות7,39,41,44,44,45,46,58.</su…
The authors have nothing to disclose.
מקורות המימון כוללים את המכון למניעת סרטן ומחקר של טקסס (CPRIT RP200668) ואוניברסיטת טקסס A&M. איור 1 נוצר עם BioRender.com.
2-deoxy-d-glucose (2-DG) | Sigma | AC111980000; AC111980010; AC111980050; AC111980250 | |
Antibiotic Antimicrobial (pen-strep) | Gibco | 15240096 | |
Cell Samples | American Type Culture Collection | N/A | MCF-7 cancer line |
CellProfiler | Broad Institute | N/A | Image analysis software |
Conical Tube | VWR | 89039-664 | 15 mL conical tube |
DMEM | ThermoFisher | 11965092 | Culture media |
FAD dichroic mirror | Semrock | FF495-Di03-25×36 | 495 nm |
FAD emission filter | Semrock | FF01-550/88-25 | 550/88 nm |
FAD excitation filter | Semrock | FF01-458/64-25 | 458/64 nm |
FBS | ThermoFisher | 16000036 | |
Fluorescence Lifetime Microscope | 3i | N/A | |
Glass bottom dish | MatTek Corp | P35G-1.0-14-C | |
Multiphoton Laser | Coherent | N/A | 2P Coherent Laser, Tunable 680 nm-1080 nm |
NAD(P)H dichroic mirror | Semrock | FF409-Di03-25×36 | 409 nm |
NAD(P)H emission filter | Semrock | FF02-447/60-25 | 447/60 nm |
NAD(P)H excitation filter | Semrock | FF01-357/44-25 | 357/44 nm |
PBS | ThermoFisher | 70011044 | |
Potassium Cyanide | Sigma-Aldrich | 380970 | |
SlideBooks 6 | 3i | N/A | Image acquisition software |
SPCImage | Becker & Hickl GmbH | N/A | Fluorescence lifetime analysis software |
Stage Top Incubator | okoLab | N/A | |
Trypsin | Biosciences | 786-262 | |
Urea | Sigma-Aldrich | U5128 | |
YG beads | Polysciences | 19096-2 | Yg microspheres (20.0 µm) |