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8.1:

Pareamento de Bases e Reparo do DNA

JoVE Core
Cell Biology
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JoVE Core Cell Biology
Base-pairing and DNA Repair

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O ADN assemelha-se a uma escada torcida. E os degraus da escada do ADN a são pares complementares de bases ozonizadas. De acordo com as regras do emparelhamento de base, adenina, uma purina, emparelha-se com a timina, uma pirimidina, com duas ligações de hidrogénio.E aparece a guanina, uma purina com citosina, uma pirimidina, com três ligações de hidrogénio. Mas porque é que as purinas emparelham sempre com as pirimidinas. Devido às restrições estereotipadas que são restrições espaciais impostas pelo fosfato de açúcar na espinha dorsal do ADN, apenas um espaço de 10, 85 angstrom está disponível para a base numa dupla hélice de ADN.As purinas têm uma estrutura dupla em anel. Portanto, duas purinas juntos serão demasiado grandes para caber neste espaço. Por outro lado, se colocarmos duas pirimidinas juntas, que contêm apenas um único anel, a distância entre eles será demasiado grande para formar ligações de hidrogénio, que são aproximadamente duas angstroms de comprimento.No entanto, se emparelharmos uma purina e uma pirimidina, encaixam perfeitamente dentro da hélice de ADN e estão suficientemente próximas para formarem ligações de hidrogénio. As ligações de hidrogênio podem formar-se quando um o átomo de hidrogénio está aproximadamente a duas angstroms de um átomo eletronegativo, tal como oxigénio ou nitrogénio. A adenina tem um átomo de hidrogénio próximo a um oxigénio e a uma timina.E a timina tem um hidrogénio próximo de um nitrogénio e uma adenina. Isto leva à formação de duas ligações de hidrogénio. A adenina não pode formar ligações de hidrogénio com citosina, porque a citosina tem um átomo de hidrogénio onde o oxigénio e timina seria.E o átomo de hidrogénio que está presente na timina está ausente na citosina. Ocorre um fenómeno semelhante na base do par citosina guanina onde um oxigénio na guanina, e um oxigénio e um ozônio na citosina são posicionados cada um através de um hidrogénio, que conduzem à formação de três ligações de hidrogénio, o que não acontece no emparelhamento da guanina da base da timina. A elevada especificidade de emparelhamento de base, juntamente com a ajuda de enzimas de replicação de ADN, é por isso que adenina se emparelha sempre com a timina e guanina se emparelha sempre com a citosina.

8.1:

Pareamento de Bases e Reparo do DNA

As regras de Erwin Chargaff sobre a equivalência de DNA prepararam o caminho para a descoberta do emparelhamento de bases no DNA. As regras de Chargaff afirmam que, em uma molécula de DNA de cadeia dupla,

  1. a quantidade de adenina (A) é igual à quantidade de timina (T);
  2. a quantidade de guanina (G) é igual à quantidade de citosina (C); e
  3. a soma das purinas, A e G, é igual à soma das pirimidinas, C e T (ou seja, A+G = C+T).

Trabalhos posteriores de Watson e Crick revelaram que, no DNA de cadeia dupla, A forma sempre duas ligações de hidrogénio com T, e G forma sempre três ligações de hidrogénio com C.  Este emparelhamento de bases mantém uma largura constante da dupla hélice de DNA, uma vez que ambos os pares A-T e C-G têm 10.85Å de comprimento e cabem perfeitamente entre os dois esqueletos de açúcar-fosfato.

Os emparelhamentos de bases fazem com que as bases nitrogenadas estejam inacessíveis a outras moléculas até que as ligações de hidrogénio se separem. No entanto, enzimas específicas podem facilmente quebrar essas ligações de hidrogénio para realizar os processos celulares necessários, tais como a replicação e transcrição do DNA. Como um par G-C tem mais ligações de hidrogénio do que um  par A-T, o DNA com uma elevada percentagem de pares G-C irá necessitar de maior energia para a separação de duas cadeias de DNA do que um com uma percentagem semelhante de pares A-T. 

Análogos de Bases como Medicamentos

O emparelhamento correto de bases é essencial para a replicação fiel do DNA. Os análogos de bases são moléculas que podem substituir as bases de DNA padrão durante a replicação do DNA. Estes análogos são agentes antivirais e anticancerígenos eficazes contra doenças como hepatite, herpes, e leucemia. O Aciclovir, também conhecido como Acicloguanosina, é uma base análoga da guanina e é comumente usado no tratamento do vírus herpes simplex.  A parte de guanina do Acyclovir emparelha com adenina como de costume durante a replicação do DNA; no entanto, por não ter uma terminação 3’ do nucleótido, a DNA polimerase não pode continuar a formar pares de bases, e a replicação termina.