L’organe de Corti, logé dans la cochlée de l’oreille interne, contient des cellules ciliées mécanosensorielles et des cellules de soutien environnantes qui sont organisées en forme de spirale et ont un gradient tonotopique pour la détection des sons. La cochlée de la souris mesure environ 6 mm de long et est souvent divisée en trois tours (apex, milieu et base) pour l’analyse. Pour étudier la perte cellulaire, la division cellulaire ou l’expression génique en mosaïque, l’ensemble du montage ou de la préparation de surface de la cochlée est utile. Cette méthode de dissection permet de visualiser toutes les cellules de l’organe de Corti lorsqu’elle est combinée à l’immunomarquage et à la microscopie confocale pour imager les cellules à différents plans de l’axe z. Plusieurs sections efficaces optiques peuvent également être obtenues à partir de ces images de la pile z. De plus, la méthode de dissection complète peut être utilisée pour la microscopie électronique à balayage, bien qu’une méthode de fixation différente soit nécessaire. Ici, nous présentons une méthode pour isoler l’organe de Corti en trois tours cochléaires intacts (apex, milieu et base). Cette méthode peut être utilisée pour des souris âgées d’une semaine à l’âge adulte et diffère de la technique utilisée pour les échantillons néonatals où la calcification de la cochlée est incomplète. Une version légèrement modifiée peut être utilisée pour la dissection de la cochlée du rat. Nous faisons également la démonstration d’une procédure d’immunomarquage avec des anticorps marqués par fluorescence.