Generation af menneskers Nasal epitelcelle Spheroids for individualiseret cystisk fibrose Transmembrane ledningsevne Regulator undersøgelse
Summary
Her beskriver vi en metode til at generere tredimensionelle klumpformet kulturer af menneskers nasal epitelceller. Spheroids derefter stimuleres til at drive cystisk fibrose Transmembrane ledningsevne Regulator (CFTR)-afhængige ion og væske sekretion, kvantificere ændringen i klumpformet luminale størrelse som en proxy for CFTR funktion.
Abstract
Mens indførelsen af cystisk fibrose Transmembrane ledningsevne Regulator (CFTR) modulator narkotika har revolutioneret pleje i cystisk fibrose (CF), har genotype-rettet terapi model i øjeblikket i brug flere begrænsninger. Første, sjældne eller forsømt mutation grupper er udelukket fra endelige kliniske forsøg. Desuden, som yderligere modulator narkotika komme ind på markedet, vil det blive vanskeligt at optimere modulator valg for en individuel sag. Begge disse spørgsmål behandles med brug af patient-afledte, individuelt tilpassede prækliniske modelsystemer af CFTR funktion og graduering. Menneskers nasal epitelceller (HNEs) er en let tilgængelig kilde til respiratorisk væv til sådan en model. Heri, beskriver vi generation af en tre-dimensionelle klumpformet model af CFTR funktion og modulation ved hjælp af primære HNEs. HNEs er isoleret fra fag i en minimalt invasiv mode, udvidet i betinget omprogrammering betingelser, og seeded i klumpformet kultur. Senest 2 uger efter såning, klumpformet kulturer generere HNE spheroids, der kan blive stimuleret med 3′, 5′-cyklisk adenosin fra (cAMP)-generering agonister at aktivere CFTR funktion. Klumpformet hævelse er derefter kvantificeres som en proxy for CFTR aktivitet. HNE spheroids kapitalisere på minimalt invasiv, men respiratorisk oprindelsen af nasal celler til at generere en tilgængelig, personlig model relevante for en epitel afspejler sygdom sygelighed og dødelighed. I forhold til luft-flydende interface HNE kulturer, er spheroids forholdsvis hurtig til at modnes, hvilket reducerer den samlede forurening hastighed. I sin nuværende form, er modellen begrænset af lav overførselshastighed, men dette opvejes af den relative lethed af væv erhvervelse. HNE spheroids kan bruges til at pålideligt kvantificere og karakterisere CFTR aktivitet på det individuelle plan. En igangværende undersøgelse at binde denne kvantificering i vivo drug reaktion vil afgøre, om HNE spheroids er en sand prækliniske prædiktor af patientens reaktion på CFTR graduering.
Introduction
Cystisk fibrose (CF) er en fatal, autosomal recessiv sygdom påvirker over 70.000 mennesker over hele verden1. Dette liv-afkortning genetisk sygdom er forårsaget af mutationer i den cystisk fibrose Transmembrane ledningsevne Regulator protein (CFTR)2. CFTR er medlem af adenosin trifosfat-binding kassetten familie, og fungerer som en ion-kanal tillader bevægelse af chlorid, og bikarbonat over de apikale membraner af flere polariseret epitheler herunder mave-tarmkanalen, sved kirtel, og respiratoriske træ, blandt andet3,4. Som sådan, fører dysfunktionelle CFTR til multisystemisk epitelial dysfunktion, med de fleste dødelighed som følge af luftvejssygdomme1. I CF lunge, tab af CFTR-drevet luftvejene overflade flydende (ASL) forordning og slim release fører til fortykket slim, luftvejsobstruktion, kronisk infektion, og progressive luftvejene remodellering og tab af lunge-funktion1,5.
Trods identifikationen af CFTR dysfunktion som årsag til sygdom, behandlinger i CF traditionelt fokuseret på afbødning af symptomer (f.eks., pancreas enzym substitutionsbehandling, luftvejene clearance terapier)1. Denne tilgang blev for nylig revolutionerede ved fremkomsten af roman therapeutics, betegnes “CFTR modulatorer,” der er direkte målrettet dysfunktionelle CFTR. Denne tilgang har flyttet den kliniske landskab fra symptom management til sygdomsmodificerende pleje men bærer flere begrænsninger6,7,8,9,10. Modulator aktivitet er specifikke for protein defekten ledsager hver CFTR mutation og begrænset til Vælg genetiske populationer11. Denne begrænsning er drevet af den heterogene karakter af protein mangler, men også af upraktiske af kliniske forsøg i sjældne mutation grupper. Derudover blandt forsøgspersoner med velundersøgte genotyper (f.eks.F508del/F508del CFTR, den mest almindelige CFTR mutation), er der bred variation i sygdom byrde og modulator svar6,7,8 ,9,11.
For at overvinde begge disse spørgsmål, har efterforskere foreslået brugen af personlig modeller for præklinisk afprøvning12. Dette begreb udnytter patient-specifikke væv for at generere en individualiseret ex vivo modelsystem for sammensatte test, forudsige i vivo emne svar på terapier i en personlig måde. Når validerede, kunne sådan en model bruges af klinikere at drive præcision terapi uanset patientens underliggende CFTR genotype.
Menneskelige bronchiale epitel (HBE) celler fremstillet af eksplantat væv i forbindelse med lungetransplantation etableret muligheden for sådan en model for CF13,14. HBEs dyrkes i en air-liquid grænseflade (ALI) giver mulighed for funktionel CFTR kvantificering direkte gennem elektrofysiologisk testning eller indirekte gennem foranstaltninger af ASL homøostase13,15. Denne model har været afgørende for at forstå CFTR biologi og var en vigtig drivkraft i udviklingen af CFTR modulatorer16. Desværre er HBE modeller ikke holdbar som en personlig model på grund af erhvervelse (lungetransplantation eller bronkial børstning) invasive art og manglende prøver for personer med sjældne mutationer eller mild sygdom. Omvendt, tarmens væv, fremstillet af rektal eller duodenal biopsi prøver, kan bruges til tarm aktuelle måling (ICM) eller en hævelse-baserede organoid analysen for at studere individualiseret CFTR funktion17,18, 19. Organoid assays, i særdeleshed er meget følsomme modeller af CFTR aktivitet20,21,22. Begge modeller er begrænset af væv kilde (tarmens væv, mens de fleste sygdom patologi er respiratorisk) og den semi-invasive metode til erhvervelse. Alternativt, adskillige efterforskere har studeret menneskers nasal (HNE) epitelceller til model CFTR restaurering23,24,25. HNEs sikkert kan høstes af børste eller curettage i emner i alle aldre, og når kulturperler i ALI, sammenfatte mange Karakteristik af HBEs25,26,27,28. HNE éncellelag kulturer har traditionelt været begrænset af planocellulære transformation og lang tid at modenhed29. Desuden rapporterede kortslutte aktuelle målinger i HNEs er mindre end i HBEs, tyder på et mindre vindue for at registrere terapeutiske virkning25.
I betragtning af behovet for en personlig, ikke-invasiv, respiratorisk vævskultur model af CFTR funktion, forsøgte vi at flette følsomhed af en hævelse-baseret, organoid assay med HNEs non-invasiv og respiratoriske karakter. Her, beskriver vi vores metode til at generere 3-dimensional “klumpformet” kulturer af HNEs for individualiseret CFTR undersøgelse i en hævelse-baseret analyse30. HNE spheroids polarisere pålideligt med epitelial apex mod kuglens centrum, eller lumen. Denne model indeholder talrige Karakteristik af en lavere respiratorisk epitel og modner hurtigere end ALI kulturer. Som en funktionel assay kvantificere HNE spheroids pålideligt en vifte af CFTR funktion samt graduering i velundersøgte mutation grupper (f.eks.F508del CFTR). Denne hævelse-baseret analyse udnytter ion/salt transport egenskaber af CFTR, indirekte måling væske tilstrømning til sfæroide, som vandet følger apikale salt efflux. På denne måde, stimuleret spheroids med fuldt funktionelle CFTR svulme håndfast, mens dem med dysfunktionelle CFTR svulme mindre eller krybe. Dette er kvantificeret gennem billedanalyse af præ og 1 h efter stimulation spheroids, måle luminale område og fastlægge procent ændre. Denne foranstaltning kan derefter sammenlignes på tværs af eksperimentelle grupper til at screene for drug bioactivity i en patient-specifikke mode.
Protocol
Representative Results
Discussion
Denne protokol beskriver generation af patient-afledte nasal klumpformet cellekulturer stand til at producere en individualiseret, specifikke model af CFTR funktion. Der er flere vigtige skridt i den proces, der bør være nøje deltog for at undgå problemer. For det første er en god prøve erhvervelse fra patientens næse. En god prøve bør have > 50.000 celler, begrænset Slim/snavs, og være klar til forarbejdning i 4 h (selvom succes er også let opnåelige med overnatning shipping på is). Praksis erhverver prøv…
Divulgations
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Dette arbejde blev støttet af cystisk fibrose Foundation Therapeutics, giver CLANCY14XX0, og gennem cystisk fibrose Foundation, tildele nummeret CLANCY15R0. Forfatterne vil gerne takke Kristina Ray for hendes hjælp i patient rekruttering og myndighedstilsyn. Forfatterne også ønsker at takke arbejdsgruppen HNE, støttet af cystisk fibrose Foundation, der har bistået i generation af HNE kultur kapaciteter: Preston Bratcher, Calvin Cotton, Martina Gentzsch, Elizabeth Joseloff, Michael Myerburg, Dave Nichols, Scott Randell, Steve Rowe, G. Marty Solomon og Katherine Tuggle.
Materials
| 1.5 mL Eppendorf Tube | USA Scientific | 4036-3204 | |
| 150 mL Filter Flask | Midsci | TP99150 | To filter Media |
| 15 mL Conical Tube | Midsci | TP91015 | |
| 1 L Filter Flask | Midsci | TP99950 | To filter Media |
| 35 mm Glass-Bottom Dish | MatTek Corporation | P35G-0-20-C | Optional |
| 3-Isobutyl-1-Methylxanthine (IBMX) | Fisher Scientific | AC228420010 | Prepare a 100 mM stock solution of 22.0 mg in 1 mL of DMSO |
| 50 mL Conical Tube | Midsci | TP91050 | |
| Accutase | Innovative Cell Technologies, Inc. | AT-104 | Cell detachment solution |
| Adenine | Sigma-Aldrich | A2786-25G | See Table 1 |
| Amphotericin B | Sigma-Aldrich | A9528-100MG | See Table 1 |
| Bovine Brain Extract (9mg/mL) | Lonza | CC-4098 | See Table 2 |
| Ceftazidime hydrate | Sigma-Aldrich | C3809-1G | See Table 1 |
| Cell Scrapers 20 cm | Midsci | TP99010 | |
| CFTR Inh172 | Tocris Bioscience | 3430 | Prepare a 10 mM stock solution of 4.0 mg in 1 mL of DMSO |
| Cholera Toxin B (From Vibrio cholerae) | Sigma-Aldrich | C8052-.5MG | See Table 1 |
| CYB-1 | Medical Packaging Corporation | CYB-1 | Cytology brush |
| Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D5879-500ML | |
| Dulbecco's Modified Eagle Media (DMEM)/F12 Hepes | Life Technologies | 11330-057 | Base Medium; See Tables 1 and 2 |
| Epidermal Growth Factor (Recombinant Human Protein, Animal-Origin Free) | Thermo Fisher Scientific | PHG6045 | See Table 1 |
| Epinephrine | Sigma-Aldrich | E4250-1G | See Table 2 |
| Ethanol | Fisher Scientific | 2701 | |
| Ethanolamine | Sigma-Aldrich | E0135-500ML | 16.6 mM solution; See Table 2 |
| Ethylenediaminetetraacetic Acid (EDTA) | TCI America | E0084 | |
| Fetal Bovine Serum (high performance FBS) | Invitrogen | 10082147 | See Table 1 |
| Forskolin | Sigma-Aldrich | F6886-50 | Prepare a 10 mM stock solution of 4.1 mg in 1 mL of DMSO |
| Growth Factor-Reduced Matrigel | Corning, Inc. | 356231 | Corning Matrigel Growth Factor Reduced (GFR) Basement Membrane Matrix, Phenol Red-Free, LDEV-Free, 10 mL. |
| Hemacytometer | Hausser Scientific | 1483 | |
| Human Collagen Solution, Type I (VitroCol; 3 mg/mL) | Advanced BioMatrix | 5007-A | Collagen solution |
| HyClone (aka FetalClone II) | GE Healthcare | SH30066.03HI | See Table 2 |
| Hydrocortisone | StemCell Technologies | 07904 | See Tables 1 and 2 |
| Insulin, human recombinant, zinc solution | Life Technologies | 12585014 | 4 mg/mL solution; see Table 2 |
| IVF 4-Well Dish, Non-treated | NUNC (via Fisher Scientific) | 12566350 | 4-well plate for spheroids; similar well size to a 24-well plate |
| MEF-CF1-IRR | Globalstem | GSC-6001G | Irradiated murine embryonic fibroblasts |
| Metamorph 7.7 | Molecular Devices | Analysis Software; https://www.moleculardevices.com/systems/metamorph-research-imaging/metamorph-microscopy-automation-and-image-analysis-software for a quote | |
| Olympus IX51 Inverted Microscope | Olympus Corporation | Discontinued | Imaging Microscope. Replacment: Olympus IX53, https://www.olympus-lifescience.com/pt/microscopes/inverted/ix53/ for a quote |
| Pen Strep | Life Technologies | 15140122 | See Table 2 |
| Phsophoryletheanolamine | Sigma-Aldrich | P0503-5G | See Table 2 |
| Retinoic Acid | Sigma-Aldrich | R2625-50MG | See Table 2 |
| Rhinoprobe | Arlington Scientific, Inc. | 96-0905 | Nasal curette |
| Slidebook 5.5 | 3i, Intelligent Imaging Innovations | Discontinued | Imaging Software. Replacement: Slidebook 6, https://www.intelligent-imaging.com/slidebook for a quote |
| Sterile Phosphate Buffered Saline (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 20012050 | |
| Sterile Water | Sigma-Aldrich | W3500-6X500ML | |
| Tissue Culture Dish 100 | Techno Plastic Products | 93100 | Tissue culture dish for expansion |
| Tobramycin | Sigma-Aldrich | T4014-100MG | See Table 1 |
| Transferrin (Human Transferrin 0.5 mL) | Lonza | CC-4205 | See Table 2 |
| Triiodothryonine | Sigma-Aldrich | T6397-1G | 3,3′,5-Triiodo-L-thyronine sodium salt [T3]; See Table 2 |
| Trypsin from Porcine Pancreas | Sigma-Aldrich | T4799-10G | |
| Ultroser-G | Crescent Chemical (via Fisher Scientific) | NC0393024 | 20 mL lypophilized powder; See Table 2 |
| Vancomycin hydrochloride from Streptomyces orientalis | Sigma-Aldrich | V2002-5G | See Table 1 |
| VX770 | Selleck Chemicals | S1144 | Prepare a 1 mM stock solution of 0.4 mg in 1 mL of DMSO |
| VX809 | Selleck Chemicals | S1565 | Purchase or prepare a 10 mM stock solution of 4.5 mg in 1 mL of DMSO |
| Y-27632 Dihydrochloride ROCK inhibitor | Enzo LifeSciences | ALX-270-333-M025 | See Table 1 |
References
- Rowe, S. M., Miller, S., Sorscher, E. J. Cystic fibrosis. N Engl J Med. 352 (19), 1992-2001 (2005).
- Rommens, J. M., et al. Identification of the cystic fibrosis gene: chromosome walking and jumping. Science. 245 (4922), 1059-1065 (1989).
- Anderson, M. P., et al. Nucleoside triphosphates are required to open the CFTR chloride channel. Cell. 67 (4), 775-784 (1991).
- Boucher, R. C. Human airway ion transport. Part one. Am J Respir Crit Care Med. 150 (1), 271-281 (1994).
- Ehre, C., Ridley, C., Thornton, D. J. Cystic fibrosis: an inherited disease affecting mucin-producing organs. Int J Biochem Cell Biol. 52, 136-145 (2014).
- Accurso, F. J., et al. Effect of VX-770 in persons with cystic fibrosis and the G551D-CFTR mutation. N Engl J Med. 363 (21), 1991-2003 (2010).
- De Boeck, K., et al. Efficacy and safety of ivacaftor in patients with cystic fibrosis and a non-G551D gating mutation. J Cyst Fibros. 13 (6), 674-680 (2014).
- Moss, R. B., et al. Efficacy and safety of ivacaftor in patients with cystic fibrosis who have an Arg117His-CFTR mutation: a double-blind, randomised controlled trial. Lancet Respir Med. 3 (7), 524-533 (2015).
- Wainwright, C. E., et al. Lumacaftor-Ivacaftor in Patients with Cystic Fibrosis Homozygous for Phe508del CFTR. N Engl J Med. , (2015).
- Brewington, J. J., McPhail, G. L., Clancy, J. P. Lumacaftor alone and combined with ivacaftor: preclinical and clinical trial experience of F508del CFTR correction. Expert Rev Respir Med. 10 (1), 5-17 (2016).
- . . CFTR2 Database. , (2017).
- Mou, H., Brazauskas, K., Rajagopal, J. Personalized medicine for cystic fibrosis: establishing human model systems. Pediatr Pulmonol. 50 Suppl 40, S14-S23 (2015).
- Randell, S. H., Fulcher, M. L., O’Neal, W., Olsen, J. C. Primary epithelial cell models for cystic fibrosis research. Methods Mol Biol. 742, 285-310 (2011).
- Whitcutt, M. J., Adler, K. B., Wu, R. A biphasic chamber system for maintaining polarity of differentiation of cultured respiratory tract epithelial cells. In Vitro Cell Dev Biol. 24 (5), 420-428 (1988).
- Worthington, E. N., Tarran, R. Methods for ASL measurements and mucus transport rates in cell cultures. Methods Mol Biol. 742, 77-92 (2011).
- Van Goor, F., et al. Correction of the F508del-CFTR protein processing defect in vitro by the investigational drug VX-809. Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (46), 18843-18848 (2011).
- Hug, M. J., Tummler, B. Intestinal current measurements to diagnose cystic fibrosis. J Cyst Fibros. 3 Suppl 2, 157-158 (2004).
- van Barneveld, A., Stanke, F., Ballmann, M., Naim, H. Y., Tummler, B. Ex vivo biochemical analysis of CFTR in human rectal biopsies. Biochim Biophys Acta. 1762 (4), 393-397 (2006).
- Dekkers, J. F., et al. A functional CFTR assay using primary cystic fibrosis intestinal organoids. Nat Med. 19 (7), 939-945 (2013).
- Dekkers, J. F., et al. Optimal correction of distinct CFTR folding mutants in rectal cystic fibrosis organoids. Eur Respir J. 48 (2), 451-458 (2016).
- Dekkers, R., et al. A bioassay using intestinal organoids to measure CFTR modulators in human plasma. J Cyst Fibros. 14 (2), 178-181 (2015).
- Zomer-van Ommen, D. D., et al. Limited premature termination codon suppression by read-through agents in cystic fibrosis intestinal organoids. J Cyst Fibros. , (2015).
- Bridges, M. A., Walker, D. C., Davidson, A. G. Cystic fibrosis and control nasal epithelial cells harvested by a brushing procedure. In Vitro Cell Dev Biol. 27a (9), 684-686 (1991).
- Di Lullo, A. M., et al. An "ex vivo model" contributing to the diagnosis and evaluation of new drugs in cystic fibrosis. Acta Otorhinolaryngol Ital. 37 (3), 207-213 (2017).
- Pranke, I. M., et al. Correction of CFTR function in nasal epithelial cells from cystic fibrosis patients predicts improvement of respiratory function by CFTR modulators. Sci Rep. 7 (1), 7375 (2017).
- Devalia, J. L., Davies, R. J. Human nasal and bronchial epithelial cells in culture: an overview of their characteristics and function. Allergy Proc. 12 (2), 71-79 (1991).
- Devalia, J. L., Sapsford, R. J., Wells, C. W., Richman, P., Davies, R. J. Culture and comparison of human bronchial and nasal epithelial cells in vitro. Respir Med. 84 (4), 303-312 (1990).
- Thavagnanam, S., et al. Nasal epithelial cells can act as a physiological surrogate for paediatric asthma studies. PLoS One. 9 (1), e85802 (2014).
- Jorissen, M., Van der Schueren, B., Van den Berghe, H., Cassiman, J. J. The preservation and regeneration of cilia on human nasal epithelial cells cultured in vitro. Arch Otorhinolaryngol. 246 (5), 308-314 (1989).
- Brewington, J. J., et al. Detection of CFTR function and modulation in primary human nasal cell spheroids. J Cyst Fibros. , (2017).
- Sun, H., et al. Tgf-beta downregulation of distinct chloride channels in cystic fibrosis-affected epithelia. PLoS One. 9 (9), e106842 (2014).
- Boucher, R. C. Evidence for airway surface dehydration as the initiating event in CF airway disease. J Intern Med. 261 (1), 5-16 (2007).
