Summary

Reinigung des menschlichen S100A12 und seiner Ionen-induzierten Oligomere zur Immunzellstimulation

Published: September 29, 2019
doi:

Summary

Dieses Protokoll beschreibt eine Reinigungsmethode für rekombinantes tagfreies Calciumbindungsprotein S100A12 und seine ioneninduzierten Oligomere für humane Monozytenstimulationstests.

Abstract

In diesem Protokoll beschreiben wir eine Methode zur Reinigung des humanen Calcium-bindenden Proteins S100A12 und seiner ioneninduzierten Oligomere aus der Escherichia coli-Kultur für Immunzellstimulationen. Dieses Protokoll basiert auf einer zweistufigen Chromatographiestrategie, die die Proteinvorreinigung auf einer Anionenaustauschchromatographiesäule und einen anschließenden Polierschritt auf einer hydrophoben Wechselwirkungssäule umfasst. Diese Strategie produziert S100A12 Protein von hoher Reinheit und Ausbeute zu überschaubaren Kosten. Für funktionelle Tests an Immunzellen erfordert eine eventuelle Rest-Endotoxin-Kontamination eine sorgfältige Überwachung und weitere Reinigungsschritte, um endotoxinfreies Protein zu erhalten. Die mehralsige Endotoxinkontamination kann durch Anionenaustauschchromatographie ausgeschlossen werden. Um Restkontaminationen zu beseitigen, beschreibt dieses Protokoll einen Entfernungsschritt mit Zentrifugalfiltern. Je nach verfügbarer Ionenstärke kann S100A12 in verschiedene Homomultimere anordnen. Um das Verhältnis zwischen Struktur und Funktion zu untersuchen, beschreibt dieses Protokoll die Ionenbehandlung von S100A12-Protein enden, gefolgt von chemischer Vernetzung zur Stabilisierung von S100A12-Oligomeren und deren anschließender Trennung durch Größenausschluss. Chromatographie. Schließlich beschreiben wir einen zellbasierten Assay, der die biologische Aktivität des gereinigten Proteins bestätigt und die LPS-freie Zubereitung bestätigt.

Introduction

S100A12 ist ein Kalzium-bindendes Protein, das überwiegend von menschlichen Granulozyten produziert wird. Das Protein wird während (systemischer) Entzündungen überexprimiert und sein Serumspiegel, insbesondere bei (auto)entzündlichen Erkrankungen wie systemischer juveniler idiopathischer Arthritis (sJIA), familiärem Mittelmeerfieber (FMF) oder Kawasaki-Krankheit (KD) Krankheitsaktivität und Reaktion auf die Therapie. Abhängig von Mustererkennungsrezeptoren (PRRs) wie gebührenähnlichen Rezeptoren (TLRs) kann das angeborene Immunsystem durch pathogenassoziierte molekulare Muster (PAMPs) wie Lipopolysaccharide (LPS) oder Schäden an assoziierten molekularen Mustern (DAMPs; auch als “Alarmins” bezeichnet). DAMPs sind endogene Moleküle wie zelluläre Proteine, Lipide oder Nukleinsäuren1. DAMP-Funktionen sind für die Mitglieder der Calgranulin-Proteinfamilie, S100A8/A9 und S100A122, die auch als divalente metallionchelisierende antimikrobielle Peptide 3,4, 5,6. Je nach verfügbarer Ionenstärke kann S100A12, wie andere Mitglieder der S100-Familie, in verschiedene Homomultimere einwirken und bis vor kurzem waren die Auswirkungen der S100A12-Oligomerisierung auf die PRR-Interaktion, insbesondere TLR4, unbekannt.

Die monomere Form des Proteins (92 Aminosäuren, 10,2 kDa) besteht aus zwei EF-Hand-Helix-Loop-Helix-Strukturen, die durch einen flexiblen Linker verbunden sind. Die C-Klemme EF-Hand enthält das klassische Ca2+-Bindungsmotiv, während die N-TerminalEF-Hand eine S100-proteinspezifische erweiterte Schleifenstruktur (‘pseudo-EF-hand’) aufweist und eine reduzierte Ca2+-Affinitätaufweist. Ca2+-Bindung durch S100A12 kann eine wesentliche konforme Veränderung des C-Terminusder Proteine induzieren, was zu einer Exposition eines hydrophoben Pflasters auf jedem Monomer führt und die Dimerisierungsschnittstelle bildet. So ist die kleinste quaternäre Struktur, die durch S100A12 gebildet wird, unter physiologischen Bedingungen ein nicht-kovalenter Dimer (ca. 21 kDa), in dem einzelne Monomere antiparallel ausgerichtet sind. Als Dimer angeordnet, wird S100A12 als Sequestrierung Zn2+ sowie andere divalente Metallionen, z.B. Cu2+ mit hoher Affinität7gemeldet. Diese Ionen werden an der Dimerschnittstelle S100A12 durch die Aminosäuren H15 und D25 einer Untereinheit und H85 sowie H89 der parallel enzierenden anderen Untereinheit8,9,10koordiniert. Während frühere Studien nahelegten, dass Zn2+-geladene S100A12 die Organisation des Proteins in Homo-Tetramere (44 kDa) induzieren und zu einer erhöhten Ca2+-Affinität11,12führen kann, Studien6 schlagen Ca2+-bindung durch S100A12 vor, um die Affinität des Proteins zu Zn2+zu erhöhen. Sobald die S100A12 EF-Zeiger von Ca2+voll belegt sind, wird angenommen, dass zusätzliche Ca2+ zwischen Dimeren binden und die Hexamerbildung auslösen (ca. 63 kDa). Die Architektur der hexamerischen Viertelstruktur unterscheidet sich deutlich von der des Tetramers. Es wird vorgeschlagen, dass die Tetramer-Schnittstelle unterbrochen wird, um neue Dimer-Dimer-Schnittstellen hervorzurufen, die der Hexamer-Bildung10zugute kommen. S100A12 wird fast ausschließlich von menschlichen Granulozyten ausgedrückt, wo es etwa 5% des gesamten zytosolischen Proteins13ausmacht. In seiner DAMP-Funktion wurde S100A12 historisch als Agonist des Multiligandenrezeptors für fortgeschrittene Glykationsendprodukte (RAGE) beschrieben, das damals als extrazelluläres neu identifiziertes RAGE-bindendes Protein (EN-RAGE)14bezeichnet wurde. Obwohl wir früher über biochemische S100A12-Bindung sowohl an RAGE als auch an TLR415berichtet haben, haben wir kürzlich gezeigt, dass menschliche Monozyten auf S100A12-Stimulation in einer TLR4-abhängigen Weise reagieren16. Dies erfordert die Anordnung von S100A12 in seine Ca2+/Zn2+-induzierte hexamerische Viertelstruktur16.

Hier beschreiben wir ein Reinigungsverfahren für rekombinantes menschliches S100A12 und seine ioneninduzierten Oligomere für Immunzellstimulationen16,17. Diese basiert auf einer zweistufigen Chromatographie-Strategie, die zunächst eine Anionenaustauschsäule umfasst, um das Protein zu isolieren und zu konzentrieren und Massenkontaminationen (z.B. Endotoxine/Lipopolysaccharide) zu entfernen18. Ionenaustauscher-Chromatographieharze trennen Proteine auf der Grundlage unterschiedlicher Netzoberflächenladungen. Bei sauren Proteinen wie S100A12 (isoelektrischer Punkt von 5,81) führt ein Puffersystem mit einem pH-Wert von 8,5 und einem starken Anionenaustauschharz zu einer guten Trennung. Gebundene Proteine wurden mit einem hohen Salzpuffergradienten eluiert. Mit einer Erhöhung der Ionenstärke konkurrieren negative Ionen im Elutionspuffer mit Proteinen um Ladungen auf der Oberfläche des Harzes. Proteine, die je nach Nettoladung einzeln elutieren, und dadurch ermöglichen die hier beschriebenen Puffer, das überexprimierte S100A12-Protein zu isolieren und zu konzentrieren. Aufgrund negativ geladener Gruppen in Lipopolysacchariden binden diese Moleküle auch an Anionenaustauschharze. Ihre höhere Nettoladung führt jedoch zu einer späteren Elution im aufgebrachten Hochsalzgradienten. Der zweite Schritt des Reinigungsverfahrens wurde zu Polierzwecken eingeführt. Dies nutzt die Calciumbindungsfähigkeit von S100A12 und entfernt restliche Verunreinigungen an einer hydrophoben Wechselwirkungssäule. Die Calciumbindung von S100A12 führt zu einer Konformationsänderung und einer Exposition hydrophober Flecken auf der Oberfläche des Proteins. Unter diesem Zustand interagiert S100A12 mit der hydrophoben Oberfläche des Harzes. Bei der Calcium-Chelatierung durch EDTA wird diese Wechselwirkung umgekehrt. In Gegenwart von Ionen, insbesondere Kalzium und Zink, ordnet S100A12 zu homomeren Oligomeren. Um Struktur-Funktions-Beziehungen der verschiedenen Oligomere zu untersuchen, stabilisierten wir dimer, tetramerische und hexamerische Rekombinante S100A12 mit einem chemischen Verklinker und trennten die Komplexe auf einer Farbtonographiesäule mit Größenausschluss. Um die Funktionalität und biologische Aktivität des gereinigten Proteins und seiner ioneninduzierten Oligomere zu analysieren, kann schließlich die Zytokinfreisetzung von S100A12 und LPS stimulierter Monozyten verglichen werden.

Verschiedene Methoden zur Reinigung von S100A12 wurden bisher beschrieben. Jackson et al.19veröffentlichten beispielsweise ein Protokoll mit Reinigung über eine Anionenaustauschsäule und eine anschließende Größenausschlusschromatographie. Das Feinpolieren an einer Größenausschlusssäule führt zu guten Ergebnissen, ist aber aufgrund der z. B. begrenzten Ladevolumina weniger flexibel in der Skalierbarkeit. Ein anderer Ansatz, veröffentlicht von Kiss et al.20, beschreibt die Reinigung des markierten Proteins über Ni2+ Affinitätsspalte als ersten Reinigungsschritt, gefolgt von enzymatischer Spaltung, um das Tag zu entfernen und weitere Reinigungsschritte. Im Gegensatz zu den vorherzitierten Studien19,20wird das in diesem Protokoll beschriebene produzierte Protein für Experimente an Immunzellen bestimmt. Daher ist eine Rest-Endotoxin-Kontamination aus der Bakterienkultur eine Herausforderung. Obwohl bisher unterschiedliche Ansätze zur Endotoxinentfernung beschrieben wurden, gibt es keine einheitliche Methode, die für eine gegebene Proteinlösung gleich gut funktioniert21,22.

Zusammenfassend kombiniert unser Protokoll die Vorteile einer tagfreien Expression in einem bakteriellen System mit einer effizienten Endotoxinentfernung und einer hohen Ausbeute an reinem Protein.

Protocol

HINWEIS: Zur Vorbereitung von Puffern und Lagerlösungen finden Sie in der Zusatztabelle 1. 1. Proteinexpression in E. coli Klonen Klonen Sie tagfreie menschliche S100A12 (NCBI-Referenzsequenz: NP_005612.1) in bakteriellen Expressionsvektor pET11b. Um das Protein auszudrücken, wandeln Sie das Konstrukt in E. coli BL21(DE3) um. kultur Bereiten Sie eine St…

Representative Results

Nach vorerierierweiser AIEX-Säule (Abbildung 1A-C) und anschließender kalziumabhängiger HIC (Abbildung 2A,B) wurde hochreines Protein gewonnen (Abbildung 2C). Darüber hinaus ergaben Messungen von Endotoxin eine erfolgreiche LPS-Entfernung. Der LPS-Gehalt nach AIEX wurde in einer Verdünnung von 1:10 über dem Assay-Nachweisgrenzwert, d. h. über 500 EU/ml, gemessen. Nach der ersten Filtration du…

Discussion

In diesem Protokoll beschreiben wir die tagfreie bakterielle Expression des menschlichen S100A12 und seine Reinigung sowie die Trennung in verschiedene Ionen-induzierte Oligomere zur Immunzellstimulation. Im Vergleich zur veröffentlichten Literatur zur S100A12-Proteinreinigung8,23,24ist die Verwendung von hohem CaCl2 (25 mM) in der hydrophoben Wechselwirkungschromatographie unseres Wissens einzigartig. Mehrere Protok…

Divulgations

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Diese Studie wurde durch Stipendien des intramuralen innovativen medizinischen Forschungsprogramms der Medizinischen Fakultät der Universität Münster (KE121201 bis C.K.) und der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG, Fo354/3-1 bis D.F.)unterstützt.

Materials

pET11b vector Novagen    
BL21(DE3) competent E. coli New England Biolabs C2527  
       
100 x Non-essential amino acids Merck K 0293
25% HCl Carl Roth X897.1
4−20% Mini-PROTEAN TGX Protein Gels BioRad 4561093
Ampicillin sodium salt Carl Roth HP62.1
BS3 (bis(sulfosuccinimidyl)suberate) – 50 mg ThermoFisher Scientific 21580
Calciumchlorid Dihydrat Carl Roth 5239.1
Coomassie Briliant Blue R250 Destaining Solution BioRad 1610438
Coomassie Briliant Blue R250 Staining Solution BioRad 1610436
EasySep Human Monocyte Enrichment Kit Stemcell 19059 Magnetic negative cell isolation kit
EDTA disodium salt dihydrate Carl Roth 8043.1
EGTA Carl Roth 3054.3
EndoLISA Hyglos 609033 Endotoxin detection assay
Endotoxin-Free Ultra Pure Water Sigma-Aldrich TMS-011-A Ultrapure water for preparation of endotoxin-free buffers
EndoTrap red Hyglos 321063 Endotoxin removal resin
FBS (heat-inactivated) Gibco 10270
HBSS, no calcium, no magnesium ThermoFisher Scientific 14175053
Hepes Carl Roth 9105
Hepes (high quality, endotoxin testet) Sigma-Aldrich H4034
hTNF-alpha – OptEia ELISA Set BD 555212
IPTG (isopropyl-ß-D-thiogalactopyranosid) Carl Roth CN08.1
L-Glutamine (200 mM) Merck K 0282
LB-Medium Carl Roth X968.1
Lipopolysaccharides from E. coli O55:B5 Merck L6529
Pancoll, human PAN Biotech P04-60500 Separation solution (density gradient centrifugation)
Penicillin/Streptomycin (10.000 U/ml) Merck A 2212
Phenyl Sepharose High Performance GE Healthcare 17-1082-01 Resin for hydrophobic interaction chromatography
Polymyxin B Invivogen tlrl-pmb
Protease inhibitor tablets Roche 11873580001
Q Sepharose Fast Flow GE Healthcare 17-0510-01 Resin for anion-exchange chromatography
RoboSep buffer Stemcell 20104 Cell separation buffer (section 5.1.4)
RPMI 1640 Medium Merck F 1215
Sodium chloride (NaCl) Carl Roth 3957.2
Sodium hydroxide Carl Roth P031.1
Tris Base Carl Roth 4855.3
Zinc chloride Carl Roth T887
Labware
0,45 µm syringe filter Merck SLHA033SS
14 mL roundbottom tubes BD 352059
2 L Erlenmyer flask Carl Roth LY98.1
24 well suspension plates Greiner 662102
5 L measuring beaker Carl Roth CKN3.1
50 mL conical centrifuge tubes Corning 430829
50 mL high-speed centrifuge tubes Eppendorf 3,01,22,178
Amicon Ultra-15 Centrifugal Filter Unit MWCO 3 kDa Merck UFC900324
Amicon Ultra-15 Centrifugal Filter Unit MWCO 50 kDa Merck UFC905024
Culture dish (100 mm) Sarstedt 83.3902
Dialysis Tubing Closures Spectrum 132738
EasySep magnet 'The Big Easy` Stemcell 18001
Fraction collector tubes 5 mL Greiner 115101
Lumox film, 25 µm, 305 mm x 40 m Sarstedt 94,60,77,316 Film for monocyte culture plates
Spectra/Por Dialysis Membrane (3.5 kDa) Spectrum 132724
Steritop filter unit Merck SCGPT01RE
Equipment
37 °C Incubator (with shaking) New Brunswick Scientific Innova 42
ÄKTA purifier UPC 10 GE Healthcare FPLC System
Fraction collector GE Healthcare Frac-920
Centrifuge (with rotor A-4-81) Eppendorf 5810R
Fixed angle rotor Eppendorf F-34-6-38
Mini Protean Tetra Cell BioRad 1658000EDU
NanoPhotometer Implen P330
Sonicator Brandelin UW2070
Fluorescence reader Tecan infinite M200PRO
pH meter Knick 765

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Citer Cet Article
Fuehner, S., Foell, D., Kessel, C. Purification of Human S100A12 and Its Ion-induced Oligomers for Immune Cell Stimulation. J. Vis. Exp. (151), e60065, doi:10.3791/60065 (2019).

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