$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Les essais décrits ici sont utiles pour étudier l’étendue de l’internalisation et la survie intracellulaire de S. aureus dans les NPPC, ainsi que l’efficacité intracellulaire des composés antimicrobiens6,15,16. Certaines étapes des deux protocoles d’essai peuvent être critiques. L’état de santé et la densité des cellules doivent être parfaitement contrôlés et cohérents entre des expériences indépendantes. L’inoculum bactérien doit être soigneusement standardisé pour obtenir un MOI réel proche du MOI théorique ciblé. En général, il faut veiller à ne détacher aucune des cellules lors du pipetage. Les lavages pour éliminer la lysostaphine et les antibiotiques sont des étapes critiques de l’EPA. L’utilisation de la protéinase K s’est avérée améliorer cette étape lorsqu’aucun antibiotique n’est utilisé (voir ci-dessous). Enfin, les cellules doivent être complètement détachées dans chaque puits et complètement homogénéisées après l’incubation avec le tampon de lyse pour quantifier de manière fiable la charge intracellulaire de S. aureus.
Dans certains cas, des problèmes peuvent être rencontrés et plusieurs points doivent d’abord être vérifiés. En cas de manque de reproductibilité, il faut garder à l’esprit que S. aureus peut former des amas, rendant la quantification par absorbance inexacte. L’agglutination des bactéries peut être augmentée par des étapes de centrifugation et de lavage si le milieu de culture doit être remplacé (par exemple, pour éliminer une protéine sécrétée). La suspension bactérienne doit être utilisée rapidement car les bactéries continuent de se développer à température ambiante. L’efficacité de la lysostaphine pourrait diminuer en raison de conditions de stockage incorrectes, d’un pH sous-optimal pour l’activité enzymatique dans les milieux de culture, de la variabilité de l’activité enzymatique entre les lots et les fournisseurs et du manque de sensibilité à la lysostaphine de certaines souches dans des conditions de croissance spécifiques. Le rouge phénol pourrait avoir un léger effet bactériostatique, en particulier lorsque le milieu de culture est relativement pauvre en nutriments par rapport aux bouillons typiques utilisés pour la croissance des bactéries. Ainsi, il est conseillé d’utiliser un milieu de culture cellulaire sans rouge phénol, ce qui améliore également les observations microscopiques à fluorescence en réduisant le bruit de fond.
Bien que cette méthode soit un outil précieux pour étudier le devenir intracellulaire de différentes souches, certaines limites de la méthode doivent être prises en compte. L’utilisation d’un MOI très élevé peut surcharger la capacité d’internalisation par les CENTRALES et niveler les différences entre les différentes souches testées. L’étendue de l’internalisation des souches les plus cytotoxiques peut être sous-estimée car la lysostaphine (ou antibiotiques) détruit rapidement S. aureus qui est libérée par les cellules endommagées. Ainsi, les expériences de longue durée (c’est-à-dire pour étudier la survie intracellulaire ou l’activité intracellulaire des antibiotiques) sont plus faciles à mettre en place avec des souches à faible cytotoxicité. Par conséquent, le temps d’incubation et le MOI doivent être ajustés avec précision en fonction de la virulence de la souche, du type de cellule et de l’objectif expérimental.
La méthode décrite ici avec l’utilisation de la lysostaphine est plus fiable que celles à base de gentamicine car, contrairement à la lysostaphine, la gentamicine a tendance à être internalisée par les cellules hôtes13. L’autre avantage est la possibilité d’inactiver la lysostaphine. L’inhibition de l’activité de la lysostaphine a été rapportée par Kim et al.13 avec l’utilisation d’EDTA pour chélater les ions zinc ou la 1,10-phénanthroline; cependant, des lavages intensifs sont toujours nécessaires pour éliminer l’enzyme avant le placage de la bactérie. Ici, la protéinase K permet une inactivation rapide de la lysostaphine. Nous avons observé que les cellules ont tendance à se détacher de la plaque de culture lorsqu’elles sont fortement infectées en raison de la multiplication de S. aureus intracellulaire. En sautant l’étape finale de lavage, la méthode iEPA a grandement simplifié la manipulation technique et permis la récupération des bactéries internalisées dans des cellules faiblement adhérentes ou déjà détachées.
Les réactifs et les tampons plus concentrés utilisés dans l’iEPA ont également contribué à réduire l’effort de pipetage et à minimiser la perte de cellules. En outre, iEPA peut être utilisé avec des cellules en suspension, ainsi qu’avec des organoïdes difficiles à laver. En conclusion, les tests de protection enzymatique permettent d’étudier l’étendue de l’internalisation et le devenir intracellulaire de S. aureus, ainsi que l’activité intracellulaire des médicaments antimicrobiens avec différents modèles in vitro . Des améliorations devraient être apportées pour mieux caractériser la relation entre l’internalisation et la cytotoxicité afin de mieux apprécier l’importance de développer des médicaments capables d’atteindre S. aureus à l’intérieur de la cellule.