Denne protokol beskriver, hvordan man rekonstruerer mitokondriecristae for at opnå 3D-billeddannelse med høj nøjagtighed, høj opløsning og højt gennemløb.
Forståelse af de dynamiske træk ved celleorganellens ultrastruktur, som ikke kun er rig på ukendt information, men også sofistikeret fra et tredimensionelt (3D) perspektiv, er afgørende for mekanistiske studier. Elektronmikroskopi (EM) giver god billeddybde og giver mulighed for rekonstruktion af billedstakke i høj opløsning for at undersøge den ultrastrukturelle morfologi af cellulære organeller selv på nanometerskala; derfor får 3D-rekonstruktion betydning på grund af dens uforlignelige fordele. Scanning elektronmikroskopi (SEM) giver en high-throughput billedoptagelsesteknologi, der gør det muligt at rekonstruere store strukturer i 3D fra det samme område af interesse i på hinanden følgende skiver. Derfor bliver anvendelsen af SEM i storstilet 3D-rekonstruktion for at genoprette den ægte 3D-ultrastruktur af organeller stadig mere almindelig. I denne protokol foreslår vi en kombination af seriel ultratynd sektion og 3D-rekonstruktionsteknikker til at studere mitokondrie-cristae i kræftceller i bugspytkirtlen. Detaljerne om, hvordan disse teknikker udføres, beskrives i denne protokol trin for trin, herunder osmium-thiocarbohydrazid-osmium (OTO) -metoden, den serielle ultratynde sektionsbilleddannelse og visualiseringsdisplayet.
Mitokondrier er en af de vigtigste organeller i cellen. De tjener som det centrale knudepunkt for cellulær bioenergetik og metabolisme 1,2 og spiller en kritisk rolle i kræft3. Kræft i bugspytkirtlen (PC) er en af de sværeste kræftformer4 at behandle på grund af dens hurtige spredning og høje dødelighed. Mitokondriel dysfunktion, som hovedsageligt skyldes ændringer i mitokondriemorfologien 3,5,6,7, har været forbundet med sygdomsmekanismerne bag PC8. Mitokondrier er også meget dynamiske, hvilket afspejles af de hyppige og dynamiske ændringer i deres netværksforbindelse og cristae-struktur9. Omformningen af cristaestrukturen kan direkte påvirke mitokondriefunktionen og cellulær tilstand10,11, som ændres signifikant under tumorcellevækst, metastase og tumormikromiljøændringer12,13.
I de senere år har forskere studeret denne organel ved hjælp af EM-observation14,15,16,17; for eksempel har forskere analyseret mitokondriedynamikken ved hjælp af 3D-rekonstruktionsteknikker 6,7,18,19. Det generelle koncept og metode til 3D-rekonstruktion af elektronmikroskopibilleder blev formelt etableret allerede i 196820 og involverede kombination af elektronmikroskopi, elektrondiffraktion og computerbilledbehandling for at rekonstruere T4-faghalen. Indtil nu har elektronmikroskopi 3D-billeddannelsesteknologi gjort betydelige fremskridt med hensyn til billedopløsning 21, automatiseringsgrad 22 og behandlingsvolumen23 og er blevet brugt i stadig bredere skala inden for biologisk forskning, fra vævsniveau til organel ultrastrukturniveau på nanometerskala24. I de senere år er elektronmikroskopi 3D-billeddannelse også blevet en lovende teknologi til en bred vifte af applikationer25,26,27.
Den voksende opmærksomhed på mitokondrie-cristae illustrerer især de væsentlige krav til ultrastrukturel volumenbilleddannelse. Transmissionselektronmikroskopi (TEM) er blevet brugt til at visualisere prøver indsamlet på et kobbergitter (400 mesh)28, hvor elektronstrålen passerer gennem sektionen. På grund af kobbergitterets begrænsede rækkevidde er det imidlertid umuligt fuldt ud at afbilde kontinuerlige skiver af den samme prøve29. Dette komplicerer undersøgelsen af målstrukturer under TEM-billeddannelse. Derudover er TEM afhængig af tidskrævende og fejlbehæftede manuelle opgaver, herunder skæring og indsamling af flere skiver og billeddannelse af dem sekventielt21, så det er ikke tilpasset til ultrastrukturelle rekonstruktioner af prøver i store mængder23. På nuværende tidspunkt opnås rekonstruktion i høj opløsning af prøvebilleddannelse i store mængder ved brug af specialudstyr, såsom TEM-kameraarrayet (TEMCA)30 eller to andengenerations-TEMCA-systemer (TEMCA2)31, som muliggør automatiseret billeddannelse med høj kapacitet på kort tid. Denne type billeddannelse har imidlertid ikke fordelen ved at være let at opnå og universel på grund af kravet om tilpasset udstyr.
Sammenlignet med TEM forbedrer metoden til automatisk generering af tusindvis af serielle volumetriske billeder til store områder baseret på SEM 32,33 effektiviteten og pålideligheden af seriel billeddannelse og leverer højere z-opløsninger34. For eksempel har seriel blokfladescanningelektronmikroskopi (SBF-SEM) og fokuseret ionstrålescanningelektronmikroskopi (FIB-SEM) begge gjort det muligt at opnå 3D-rekonstruktion af ultrastruktur med høj hastighed, effektivitet og opløsning35,36. Det er imidlertid uundgåeligt, at blokoverfladen barberes mekanisk af SBF-SEM’s diamantkniv eller ved fræsning med den fokuserede ionstråle i FIB-SEM33,37. På grund af de to metoders destruktivitet over for prøverne er det ikke muligt at rekonstruere den samme målstruktur igen til yderligere analyse38,39,40. Derudover har få undersøgelser forsøgt at rekonstruere 3D-organelultrastrukturen af kræftceller ved hjælp af EM for at observere patologiske ændringer12. Af disse grunde foreslår vi for yderligere at belyse de patologiske mekanismer i kræftceller, såsom kræftceller i bugspytkirtlen, en ny teknologi til 3D-rekonstruktion af serielle sektionsbilleder ved hjælp af et ultramikrotomt og et feltemissionsscanningelektronmikroskop (FE-SEM) til at analysere mitokondrie-ultrastrukturen på cristae-niveau; Med denne teknologi kan data i høj opløsning erhverves ved hjælp af en effektiv og tilgængelig metode. De serielle ultratynde sektioner lavet ved hjælp af et ultramikrotomt kan gemmes semi-permanent i et gitterhus og genafbildes flere gange, selv efter flere år41. FE-SEM er højt værdsat som et værktøj inden for forskellige forskningsområder på grund af dets evne til at levere billeddannelse i høj opløsning, høj forstørrelse og alsidighed42. I et forsøg på at vise organellernes fine struktur i 3D kan teknikken til fremstilling af serielle 2D-billedstakke med nyttig opløsning ved hjælp af tilbagespredte elektroner produceret af FE-SEM 43,44 også bruges til at opnå billeddannelse med høj gennemstrømning og multiskala af målregioner eller deres tilknyttede strukturer uden specielt udstyr 45. Genereringen af ladningsartefakter påvirker direkte kvaliteten af de erhvervede billeder, så det er især vigtigt at holde opholdstiden kort.
Således uddyber denne undersøgelse de eksperimentelle procedurer, der anvendes i denne SEM-teknik til at rekonstruere 3D-strukturen af mitokondrie-cristae46. Specifikt viser vi processen udviklet til at opnå den halvautomatiske segmentering af mitokondrieregioner og digitalisere 3D-rekonstruktionen ved hjælp af Amira-software, som også involverer fremstilling af skiveprøver ved hjælp af den konventionelle OTO-prøveforberedelsesmetode44,47, færdiggørelse af sektionssamlingen ved hjælp af ultramicrotomskæring og erhvervelse af sekventielle 2D-data af FE-SEM.
Metoden, der præsenteres her, er en nyttig trinvis vejledning til anvendelse af 3D-rekonstruktionsteknikken, som indebærer anvendelse af elektronmikroskopi og billedbehandlingsteknologi til stabling og segmentering af 2D-tomografiske billeder genereret fra serielle ultratynde sektioner. Denne protokol fremhæver en begrænsning af 2D-billeder, der kan løses ved 3D-visualisering af organellens ultrastruktur, som har fordelene ved stærk reproducerbarhed af strukturerne på et højopløsningsniveau og højere nøjagtigh…
The authors have nothing to disclose.
Denne forskning blev støttet af Natural Science Foundation of Zhejiang Province tilskud (Z23H290001, LY19H280001); National Natural Science Foundation of China tilskud (82274364, 81673607 og 81774011); samt det offentlige velfærdsforskningsprojekt fra Huzhou Science and Technology Grant (2021GY49, 2018GZ24). Vi sætter pris på den store hjælp, teknisk support og eksperimentel support fra Public Platform of Medical Research Center, Academy of Chinese Medical Science, Zhejiang Chinese Medical University.
(1S,3R)-RSL3 | MCE | HY-100218A | |
Acetone | SIGMA | 179124 | |
Amira | Visage Imaging | ||
Aspartic acid | MCE | HY-42068 | |
Dulbecco's modified Eagle’s medium | Gibco | 11995115 | |
Ethanol | Merck | 100983 | |
Ferrostatin-1 | MCE | HY-100579 | |
Fetal bovine serum | Gibco | 10437010 | |
Field emission scanning electron microscope | HITACHI | SU8010 | |
Glutaraldehyde | Alfa Aesar | A10500.22 | |
Lead nitrate | SANTA CRUZ | sc-211724 | |
Osmium Tetroxide | SANTA CRUZ | sc-206008B | |
Panc02 | European Collection of Authenticated Cell Cultures | 98102213 | |
Penicillin-streptomycin | Biosharp | BL505A | |
Phosphate Buffered Saline | Biosharp | BL302A | |
Pon 812 Epoxy resin | SPI CHEM | GS02660 | |
Potassium ferrocyanide | Macklin | P816416 | |
Thiocarbohydrazide | Merck | 223220 | |
Ultramicrotome | LEICA | EMUC7 | |
Uranyl Acetate | RHAWN | R032929 | 2020.2 |