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Analisi di espressione genica da comunità microbiche marine utilizzando Trascrittomica Ambientale
Journal JoVE
Biologie
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Journal JoVE Biologie
Analyzing Gene Expression from Marine Microbial Communities using Environmental Transcriptomics
DOI:

13:51 min

February 18, 2009

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Chapitres

  • 00:00Titre
  • 01:06Introduction
  • 01:51Preparation and Environmental RNA Collection
  • 03:32Total RNA Extraction
  • 06:03First rRNA Removal
  • 07:29Second rRNA Removal
  • 10:38mRNA Amplification
  • 12:01cDNA Synthesis
  • 12:51Representative Results/ Outcome
  • 13:16Conclusion

Summary

Traduction automatique

Vi presentiamo un metodo per la generazione di cDNA da mRNA ambientale. In generale, l'RNA totale viene prima raccolto dall'ambiente, è selettivamente rimosso rRNA, mRNA è selettivamente amplificato, e cDNA sintetizzato dalla piscina mRNA arricchito è sequenziato. Sequenze recuperato può essere annotati utilizzando le normali tecniche di bioinformatica per identificare i geni espressi.

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