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Un rápido de alto rendimiento para el método de asignación de Ribonucleoproteínas (RNP) de Derechos Humanos pre-mRNA
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A Rapid High-throughput Method for Mapping Ribonucleoproteins (RNPs) on Human pre-mRNA
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Un rápido de alto rendimiento para el método de asignación de Ribonucleoproteínas (RNP) de Derechos Humanos pre-mRNA

DOI:
10.3791/1622-v

•

13:00 min

•

December 02, 2009

•

, ,
1Department of Molecular and Cellular Biology,Brown University, 2Center for Computational Molecular Biology,Brown University

Chapitres

  • 00:00Titre
  • 00:42Introduction
  • 01:17Pool Design and Oligo Recovery
  • 03:53Co-immunoprecipitation of the Oligo Pool with an RNP of Interest
  • 07:50Labeling the Samples and Hybridizations to the Microarray
  • 10:50Mapping RNPs on Pre-mRNAs Representative Results
  • 11:56Conclusion

Summary

Traduction automatique

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Debido a la naturaleza transitoria de la pre-ARNm, que pueden ser difíciles de aislar y estudiar<em> In vivo</em>. A continuación, presentamos una novela<em> In vitro</emEnfoque> para investigar las interacciones proteína-ARN utilizando un oligo piscina sintéticos que los azulejos de todas las regiones seleccionadas de pre-mRNA.

Tags

Rapid High-throughput MethodMapping RibonucleoproteinsRNPsHuman Pre-mRNACo-immunoprecipitateRNA Binding ProteinsSplicing FactorIn Vitro ApproachOligonucleotide PoolMolecular SelectionTwo Color Array StrategyEnrichmentHigh-resolution MapsSequence-specific DeterminatesStructural DeterminatesRibonucleoprotein BindingUnique AdvantageSampling BiasIP TechniquesSELEX TechniquesFlexibility

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